Вы видите, с какими трудностями для нас, с каким ущербом для государства, страны и народа и с какими жертвами среди офицеров и солдат мы подчиняем в Зенджане группу крестьян и ремесленников, руководимую одним духовным лицом, которое уверовало в претензию, выдвигаемую этим лицом». Насир ад-Дин-шах санкционировал ликвидацию Баба и с этой миссией в иранский Азербайджан был отправлен Сулейман-хан Афшари.
Баба доставили из крепости Чехрик в Тебриз вместе с двумя братьями-сейидами Хосейном и Хасаном, которые сидели вместе с Бабом. Хосейн был секретарем Баба и записывал его высказывания.
Перед самым приездом Баба на казнь в Тебриз, здесь был схвачен бабидский проповедник – мулла Мохаммед-Али Тебризи.
В соответствии с пожеланием Насир ад-Дин-шаха, муджтахиды Тебриза приняли фетву о казни Баба. А также высказались за казнь Мохаммеда-Али Тебризи и сейидов Хасана и Хосейна. После вынесения смертного приговора Баб и его помощники три дня ожидали казни в тюрьме. За это время Баб предложил остальным отречься от него и тем сохранить свою жизнь. Хасан и Хосейн согласились, публично прокляли Баба, и не были тогда казнены. А мулла Мохаммед-Али Тебризи категорически отказался проклинать Баба и пожелал лучше быть казненным вместе с ним.
9 июля 1850 года была организована публичная казнь Баба в Тебризе. На площади «Сарбазхане-йе кучек» (Старой Казарменной площади) собралась большая толпа. Во избежание беспорядков на площади были выстроены три полка солдат: четвертый тебризский полк, специальный тебризский полк и полк «Бахадуран» (богатырей), состоявший из христиан, в основном, армян. Баб и Мохаммед-Али были связанными подвешены на веревках у столбов.
Приказ расстрелять Баба был дан командиру специального тебризского полка Ага-хану Зенджани. Но он отказался выполнять приказ, мотивируя это тем, что он может выполнять только приказы военного министерства. Этот предлог понадобился потому, что солдаты-мусульмане боялись стрелять в Баба, объявившего себя имамом Махди.
Тогда расстрел Баба был перепоручен христианину Сам-хану и его полку Бахадуран. И христиане шахиншаха не подвели. Когда рассеялся пороховой дым от залпа, то выяснилось, что убит только мулла Мохаммед-Али Тебризи, а в Баба пули не попали. Ими были перебиты веревки, на которых Баб был подвешен к столбу.
Упав на землю, Баб забежал в одну из казарм и спрятался там. По приказу Сам-хана солдаты отыскали Баба и снова подвесили на столбе. При повторном залпе, когда больше целиться было не в кого, Баб был изрешечен десятками пуль. Толпа на площади убедилась, что Баб мертв, а не сокрылся, как имам Махди и не улетел на небо, как подумали многие после того, как Баб исчез после первого залпа.
Ликвидировав Баба, правительству удалось предотвратить возникновение новых восстаний под бабидскими лозунгами. Теперь нужно было только подавить уже полыхающие локальные бунты. Тем временем, подступив к Нейризу, войска расположились лагерем и начали артиллерийский обстрел занятой бабидами крепости. Сейид Яхья Дараби приказал совершить ночную атаку на правительственные войска. Было отобрано 300 бабидов, и они атаковали войсковой лагерь с мечами и дубинами в руках. В ходе ночного боя погибло около 300 солдат и около 150 бабидов.
Среди убитых бабидов были: кондитер хаджи Хосейн, каменщик Аскер, красильщик Зейн оль-Абедин, сукновал Асадулла, кузнец Мухаммед, сапожники Шамс ад-Дин и Багер и много представителей духовенства. Вылазка закончилась неудачно для бабидов. Разгромить лагерь, как при Шейх-Табарси, не удалось. На следующий день Яхья Дараби обратился за подкреплениями к крестьянам окрестных районов. Получив их, бабиды предприняли еще одну атаку на лагерь войск шахиншаха. Но и эта вылазка была отбита с большими потерями для нападавших.
Эти неудачи вызвали дезертирство в рядах бабидов. Командование правительственных войск решило прибегнуть к уже испытанному при Шейх-Табарси методу – к обману. Сейиду Яхье Дараби было послано письмо с предложением прекратить сопротивление и выйти из крепости. Письмо содержало обещание сохранить ему жизнь, подтвержденное клятвой на Коране.
Сейид Яхья с пятью помощниками, среди которых был хаджи сейид Абед, вышли из крепости и отправились на переговоры. Остающимся в крепости бабидам сейид Яхья велел держаться до поступления от него письменных распоряжений. Несколько дней Зейн оль-Абедин-хан, Мустафа Кули-хан и другие шахские полководцы делали вид, что ведут переговоры и демонстрировали Яхье Дараби показное уважение. Затем они предложили сейиду Яхье написать в крепость письмо с известием, что заключен мир, и бабиды должны прекратить борьбу и разойтись по домам.