Проникавшая через переборки в местах прохода труб вентиляции, горловин, клинкетов вода залила поддувала паровых котлов. Команда работала из последних сил, откачивая воду ручными помпами и ведрами, но батарею спасти не удалось — она затонула на глубине около 8 м. 3 июня ее подняли и через три дня доставили в Кронштадт. Во время восстановительного ремонта установили новые котлы и наглухо заделали трубы лотов.
С начала службы "Кремль" почти ежегодно находился во внутреннем плавании в составе Практической эскадры или Учебноартиллерийского отряда Балтийского флота. 1 февраля 1892 г. его переклассифицировали в броненосец береговой обороны, а 11 декабря 1904 г. в соответствии с приказом по Морскому ведомству перевели во второй ранг судов. 12 октября 1905 г. "Кремль" исключили из списков флота, а 26 августа 1908 г. все три батареи за 62500 рублей продали на слом.
"Кремль" завершил серию броненосных батареи русского флота, рассчитанных на прибрежное плавание. За счет уменьшения запасов удалось создать хорошо бронированные и относительно мореходные корабли. Их значение резко понизилось с появлением мониторов и броненосных башенных фрегатов, поэтому четвертая батарея в серии даже не была заложена.
В заключение следует отмстить, что создание броненосных батарей послужило для отечественных кораблестроителей хорошей школой — отрабатывались многие конструктивные решения, примененные впоследствии на казематных и башенных броненосцах. Батареи долго и хорошо служили, на них прошла подготовку значительная часть моряков.
Из отчета по Морскому ведомству за 1864 г
1) При постройке батареи "Кремль" тоже возбуждены были вопросы о некоторых внутренних устройствах, вследствие чего Комитет предлагает высшему начальству, что на батарее "Кремль" впереди и позади поперечных блиндированных переборок положено иметь: а) легкие борта, только у клюзов, на деревянных тимберсах, для удобства выполнения работ, а порты противу погонных и ретирадных пушек делать из откидных железных ставней, как на лодке "Смерч", и б) две легкие, но железные продольные переборки в носовой части для продолжения верхней палубы к бушприту, которые должно поставить так, чтобы не мешать стрельбе из пушек параллельно диаметральной плоскости. При оконечности же судна над палубой, в корме и по краям ее в носовой части, положены борта. Все эти легкие борта над палубами предположены деревянные, как всегда делалось на броненосных судах. Но работы приостановлены были по случаю возникшего вопроса: не лучше ли продолжить верхнюю палубу до самых оконечностей и сделать борта железные, подобно как на фрегате "Петропавловск".
Верхняя палуба на этой батарее покрыта листами в 1/
Его высочество изволил приказать продолжить верхнюю палубу до самых оконечностей носа и кормы; борта сделать из железных шпангоутов и железной обшивки: порты и ставни к погонным и ретирадным орудиям для стрельбы из батарейной палубы, а также внутренние продольные переборки сделать так, чтобы можно сыло стрелять параллельно диаметральной плоскости. Продолжение поперечных переборок на верхней палубе уничтожить.
2) Комитет обсуждал доводы командира батареи о бесполезности мостика и нашел, что мостик на батарее "Кремль" устроить следует, так как он во всяком случае будет с пользой служить для более удобного управления судном.
3) Главный инженер-механик балтийского флота спросил, будут ли устроены на батарее *Кремль" балластные цистерны, подобные тем, какие сделаны на батарее "Не тронь меня". На это сообщено, что так как устройство местных цистерн для водяного балласта стесняет расположение в трюме других внутренних устройств, необходимых для помещения грузов, составляющих существенную необходимость для службы судна; а между тем без цистерн таковых можно и обойтись и при составлении чертежей внутренних устройств для батареи "Кремль"
4) Рассмотрен с участием начальника броненосной эскадры чертеж устройства блиндированной капитанской рубки на батарее "Кремль", одобренный инспектором кораблестроительных работ и составленных согласно указаниям Комитета с назначением рубке места впереди мостика. Сообщено Кораблестроительному Департаменту, что прежде принятия этого чертежа в руководство необходимо сделать на самом деле, при строении, соображения, не будет ли мешать дымовая труба видеть из назначенных на чертеже визиров чрез форштевень, предметы, окружающие судно; в таком случае необходимо будет изменить их положение.