– Я согрешил, как человек, простив из жалости злодея, недостойного жизни; но суд Божий решил иначе, не попустя остаться ему живым, это будет всегдашним мне наставлением – не прощать злодеев, вредных обществу. Страшитесь, – заключил государь, – преступники нераскаянные строгости правосудия, вверенного мне.
После этого осужденные судом злодеи были казнены.
И потом начался розыск с Щегловитым и другими привезёнными стрельцами, как Амбросима Белаго полку и другие, которые были привезены от выборных стрельцов разных полков.
Как только Федьку привезли, он был препровождён в большую комнату, где царь собрал бояр. Его допрашивали в течение 4 часов и оттуда привели в башню монастыря, где он был подвергнут пытке (эта пытка называется кнут. Испытуемого привязывают к спине сильного мужчины, который прямо стоит на ногах, опираясь руками в подобие скамьи на высоте его головы. В этом состоянии приговорённый получает 200 или 300 ударов кнутом по спине. Удары начинают наносить ниже шеи, от плеча до плеча; палач бьёт с такой силой, что [вырывает] с каждым ударом кусок кожи толщиной с сам кнут и длиной во всю спину. Большинство после этого умирает или остаются искалеченными). Ему связали руки за спиной, подвесили и палач нанёс ему несколько ударов кнутом, длиною с кучерский, но другого качества, так что ремень гораздо раньше врезался ему в тело и заставил его переносить исключительные страдания. После нескольких подобных ударов он признался, что ему было поручено убить царицу мать, царя и трёх(?) его братьев. Этим признанием удовлетворились и отвели его в тюрьму. После этого были допрошены 7 других злодеев, которые должны были исполнить это преступление. Их пытали и добились от них того же признания, что и от Федьки. Прошло два дня, пока решали, что делать с преступниками.
В допросных актах по делу Фёдора Шакловитого есть подробная записка, своего рода доклад следственной комиссии царю Петру. Это главный документ в трёхтомном «розыскном деле». В нём сведены воедино все «вины и замыслы» Шакловитого, послужившие основой для смертного приговора: