В центре города, повествует летопись, на площади, где стояла сгоревшая церковь Вознесения, Батый приказал разложить большой костер, на который положили тело молодого хана Кюлькана, младшего сына Чингисхана, погибшего в сражении под Коломной. Вместе с ним монголы сожгли живьем 40 самых красивых коломенских девушек и двух любимых его коней в нарядной золотой сбруе. И девушки и кони, по мнению Батыя, должны были последовать в заоблачный мир, чтобы там верно служить своему погибшему господину. На другом костре были сожжены трупы павших монголов.
В 1301 г. князь Московский Данила Александрович присоединяет Коломну к Московскому княжеству, отвоевав ее у Рязанского. Коломна стала сторожевым постом на границах Московского княжества.
В 1380 г. князь Дмитрий Иванович собирает в Коломне русские войска для битвы с ханом Мамаем.
В 1525 - 1531 гг. по указу Василия III в Коломне сооружен каменный кремль с высокими зубчатыми стенами и 16 башнями. «Стены его, выстроенные из больших камней и крепкого, чудесного красного кирпича, страшной высоты. Его башни… удивительно крепки и непоколебимы», - писал Павел Алеппский, посетивший Коломну в XVII в. Со времени сооружения этого кремля татары ни разу не смогли взять город.
В Коломне бывал и Иван Грозный. В 1552 г. здесь состоялся военный совет, на котором под его руководством вырабатывался план похода на Казань.
В 1606 г. Коломна была в руках восставших крестьян под предводительством Ивана Болотникова, а через два года на ее улицах войска Дмитрия Пожарского вели упорные бои с польско-шляхетскими интервентами, завершившиеся освобождением города от захватчиков.
В Коломне много памятников архитектуры. В их числе прежде всего следует назвать кремль, Успенский собор (XVII в.), шатровую церковь Брусенского монастыря (1552 г.), «Дом воеводы» (XVII в.), церковь Вознесения, построенную в 1799 г. архитектором М. Ф. Казаковым, церковь Воскресения (XIV, XVIII вв.).
В Коломне сохранился дом, в котором родился и провел юношеские годы писатель И. И. Лажечников. В произведениях «Немного лет назад», «В старом доме», «Дочь соляного пристава» им ярко описаны быт и нравы купцов и мещан города XIX в. В течение двух лет (1842 - 1843) в Коломне жил известный русский композитор А. А. Алябьев.
Как индустриальный центр Коломна начала развиваться во второй половине XIX в., когда началась постройка железнодорожного моста через Оку у села Щурова.
В 1863 г. в пригородном селе Боброве для постройки железнодорожного моста были созданы небольшая кузница, механические и чугунолитейные мастерские, которые вскоре превратились в крупный машиностроительный завод.
В 1866 г. на заводе был создан первый паровоз, а с 1869 г. началась постройка пассажирских вагонов. Завод изготовлял металлические части мостов, буксирные пароходы, землечерпалки, сельскохозяйственные машины, двигатели внутреннего сгорания и пассажирские теплоходы.
Лучшие в свое время отечественные паровозы серий СУ, ИС, ФД созданы коломенцами. Завод выпускал тракторы, щиты, тюбинги для Метростроя, выполнял заказы строителей гидроузлов.
Уже в начале XX в. на заводе работало около 8 тыс. рабочих. С 1901 - 1902 гг. здесь, а также и на других предприятиях Коломны возникли первые марксистские кружки, которые в 1903 г. объединились в Коломенскую организацию РСДРП.
В 1905 г. рабочие Коломны принимали активное участие в борьбе против самодержавия. Во время Всероссийской октябрьской стачки в Коломне был создан Совет рабочих депутатов.
В дни Декабрьского вооруженного восстания в Москве коломенские боевые дружины захватили телеграф и участок железной дороги, разоружали воинские составы и посылали оружие в Москву.
Героически сражались дружинники с прибывшими в Коломну царскими карателями, которым только с помощью пушек удалось сломить сопротивление дружин и подавить восстание.
Активное участие принимали рабочие Коломны и в Великой Октябрьской социалистической революции. Советская власть была провозглашена в Коломне 8 ноября 1917 г. На площади Двух революций в окружении зелени и цветов находится братская могила героев Декабрьского вооруженного восстания 1905 г. и Великого Октября. В 1918 г. здесь были похоронены член Коломенского Совета рабочих и крестьянских депутатов Лазарев, красногвардеец Толстиков и матрос Буфеев, убитые 28 декабря 1917 г. контрреволюционерами. В 1927 г., в десятую годовщину Октябрьской революции, в братскую могилу были перенесены останки 27 большевиков, расстрелянных карателями на станции Голутвин в 1905 г. Горожане любовно ухаживают за могилой героев.
За годы Советской власти Коломна превратилась в промышленный, научный и культурный центр Подмосковья. Кроме тепловозостроительного завода здесь созданы крупные заводы тяжелого станкостроения и текстильного машиностроения. Развита промышленность стройматериалов и пищевая. Имеются мебельная и швейная фабрики, заводы канатный, шиноремонтный, резинотехнических изделий.