Версия о насильственной смерти базируется на следующих фактах. Те люди, которые первыми вошли в каюту теплохода, где во время съёмок жил и скончался Шукшин, сразу обратили внимание на странный запах, который присутствовал в помещении (в других каютах этого запаха не было). Потом была высказана догадка, что это мог быть инфарктный газ, который кто-то запустил в шукшинскую каюту через открытое окно. Кстати, этим человеком мог быть неизвестный мужчина, который накануне смерти Шукшина крутился на теплоходе, а потом бесследно исчез, не оставив после себя ни имени, ни каких-либо следов.
За что же могли убить Шукшина? Дело в том, что в последние годы его творчество приобретало не только социальный, а политический оттенок. На это ясно указывали как литературные, так и кинематографические опыты покойного. Например, появление в первой половине 70-х сказки с выразительным названием «Ванька, смотри!» говорило о том, что Шукшин сворачивает в сторону обличительной сатиры социально-политического толка. По словам друзей Шукшина, следующим его подобным произведением должна была стать пьеса о «золотой молодёжи» — сынках высокопоставленных деятелей, которые тогда начали буквально заполнять советские верха, что Шукшиным расценивалось как весьма опасный симптом.
Однако ещё большую озабоченность доставляло верхам желание Шукшина экранизировать своего «Степана Разина». Как уже говорилось, на протяжении почти десяти лет власти то давали «добро» на этот проект, то закрывали его, но Шукшин всё равно не терял надежд осуществить задуманное. Это почти маниакальное упорство ясно указывало недоброжелателям Шукшина на то, что отвратить его от задуманного им вряд ли удастся. Во всяком случае, теми традиционными способами, которые они успешно использовали в общении с другими деятелями советской литературы и искусства.
Незадолго до смерти Шукшин в открытую стал говорить, что собирается бросить «сидеть на трёх стульях» (быть одновременно писателем, режиссёром и актёром) и целиком посвятить себя литературе. Побудительным мотивом для такого решения стала его встреча с одним из главных идеологов державного течения писателем Михаилом Шолоховым, которая случилась в Вёшенской летом 74-го, в разгар съёмок фильма «Они сражались за Родину» (вместе с Шукшиным на той встрече присутствовали и другие участники съёмок: С. Бондарчук, Ю. Никулин, И. Лапиков, Г. Бурков и др.). Там произошёл эпизод, о котором чуть позже расскажет А. Заболоцкий:
«Бурков мне рассказывал, что в Вёшенской во время застолья у М.А. Шолохова, когда слово досталось Шукшину, он с ходу „расшифровался“ — мол, много говорим о русском характере, а народ вымирает, пора искать путь русского единства. Слово в пустоту упало. Сник… Михаил Александрович неловкую паузу разбил, иронично предложив выпить за собирателя земли русской Васю Шукшина. Об этом же событии Макарыч мне рассказывал иначе: „С тостом я там вылетел не застольным, о гибели русской. Шолохов смягчил, всё поняв — не для той компании мои слёзы; предложил тост за меня, а когда увидел, что я не выпил, подошёл ко мне и тихо сказал: "Ну, Вася, приеду в Москву, у тебя и чаю не выпью". Жора (Бурков) при мне неотступно, поэтому с Михаилом Александровичем поговорить мне один на один не удалось, но с сыном его перемолвился… Обязательно побываем у него до начала "Разина", — весело надеялся Шукшин. — После Шолохова я по-другому взглянул окрест себя. Слишком уж я разговорился с журналистами. Суета все публичные выступления…“»
Именно это желание поближе сойтись с Шолоховым, чтобы «совместно искать путь русского единства», судя по всему, и могло сильнее всего насторожить тех людей в советских верхах, кто более всего боялся возрождения русского национального самосознания. Для них этот намечавшийся тандем сулил большие проблемы в будущем.
В свете всего вышеперечисленного не кажется надуманной версия о том, что в советских верхах (его либеральном крыле) могла созреть идея физического устранения Шукшина. Отметим, что подобные эксцессы являются отличительной чертой любой политики — не только советской. Вот и в СССР за этим скрывалось тайное противостояние, которое велось в высшей советской элите между представителями разных политических течений. Например, в КГБ между собой боролись две группировки: Юрия Андропова (либерал) и его первого заместителя Семёна Цвигуна (державник). Последний с большой симпатией относился как к Шолохову, так и к Шукшину и на том же «Мосфильме» плотно контактировал с бондарчуковским объединением (там экранизировались книги Цвигуна о партизанском движении). Поэтому если предположить, что Шукшина убили, то подозрение в этом падает прежде всего на андроповское окружение, а не на цвигуновское.
О том, что это могло быть именно убийство, говорили люди весьма осведомлённые. Например, Сергей Бондарчук, который в одном из откровенных разговоров со своим тогдашним зятем, Николаем Бурляевым, обронил фразу: «Васю убили, и я даже знаю, кто это сделал». Не от Цвигуна ли, с которым Бондарчук дружил, он мог узнать об этом?