Дисбиоз микробиома означает нарушение его экосистемы в результате изменения видового разнообразия микроорганизмов, производимых ими химических соединений и генов, которые они стимулируют. Дисбиоз, похоже, является не только потенциальной причиной ожирения и других хронических воспалительных заболеваний, но и их следствием, частью зловещей петли обратной связи, которая все сильнее раскручивает маховик болезни. Стоит отметить, что для одних заболеваний данные исследований более убедительны, чем для других.
Подверженный дисбиозу микробиом очень часто провоцирует скрытое или явное воспаление, которое может начаться в кишечнике и распространиться по всему организму, способствуя развитию разных болезней. Во Франции, в университете Клермон-Феррана, ранние эксперименты Гордона вдохновили молодого Бенуа Шассена на получение докторской степени по микробиологии. Шассен, увлеченный идеей о том, что кишечные микробы способны привести к ожирению, решил разобраться,
Кишечные микробы формируют иммунные реакции в болезни и здравии, регулируя масштаб и продолжительность воспаления. Они помогают иммунной системе запускать и подавлять воспаление по мере необходимости, сдержанно реагируя на угрозы и предотвращая смертельные инфекции и хронические воспалительные заболевания. Новые исследования микробиома как на людях, так и на животных показали, что различные уровни кишечного воспаления могут передаваться, подобно ожирению, вместе с пересаженными кишечными микробами. Исследования Шассена, а также работы его коллег по всему миру позволяют предположить, что одним из важных механизмов, объясняющих негативное влияние дисбиоза на здоровье, является развитие хронического воспаления.
У воспалительного микробиома совсем другой характер, его раздраженные, разрушительные микробы вызывают беспорядочное и беспричинное поведение у макрофагов и других иммунных клеток. Между тем это состояние не поддается какому-то строгому определению. Некоторые микробы могут быть «противовоспалительными», как, например, кластеры клостридий Хонды, или «воспалительными». Отдельные бактерии, имеющие тонкие, похожие на хлысты придатки, называемые жгутиками, и клеточные стенки со специфическими токсинами, скорее всего, являются воспалительными. Тем не менее большинство микробов сложно назвать однозначно хорошими или плохими. Подобно героям романов Диккенса, да и большинству людей на планете, они представляют собой многогранные «личности», которые развиваются со временем и под воздействием внешних факторов.
Многие виды микроорганизмов играют двойную роль и могут способствовать как здоровью, так и болезни, в зависимости от своего окружения и других внешних воздействий. Так, бактерия
Симбиоз между людьми и микробами, отточенный эволюцией, несовершенен и чреват потенциальными конфликтами, если его должным образом не контролировать. Вред организму-носителю могут причинить как отдельные виды микроорганизмов, так и весь микробиом в целом.