В 1992 году по благословению митрополита Нижегородского и Арзамасского Николая началось восстановление Софрониевой пустыни. Руководство этими работами было возложено митрополитом Николаем на иеродиакона Владимира (Комендантова). Большую помощь в восстановлении пустыни оказали: А, Н. Захаров, глава администрации Арзамасского района, П. А. Коннов, директор колледжа № 68 города Арзамаса, Г. В. Бадин, директор ОАО «Арзамасэлектросети», Ю. Н. Попов, главный врач Чернухинской больницы, В. Н. Чиж, в бытность генеральным директором ОАО «Арзамасдорремстрой», и многие другие. Продолжают помогать пустыни в ее нуждах мэр Арзамаса А. Н. Мигунов, генеральный директор ОАО «Арзамасагропромстрой» Ф. М. Голышев, заместитель директора арзамасского филиала ОАО «Волга-Телеком» Н. М. Голышев, директор Арзамасского лесхоза А. Н. Лукьянов и другие. На средства благотворителей был построен храм, келейный корпус, сооружена сень над источником, устроена купальня, возведены различные хозяйственные постройки.
Ныне исполнилось еще одно пророчество старца Софрония о том, что монашеская жизнь на месте его подвигов возобновится. В настоящее время в Софрониевой пустыни по благословению епископа Нижегородского и Арзамасского Георгия подвизается многоопытный пастырь протоиерей Владимир Цветков с двадцатью послушницами, среди которых две инокини. Сестры совершают установленное молитвенное правило, читают неусыпаемую Псалтирь. В воскресные и праздничные дни в домовом храме совершается Божественная литургия. Во все дни, когда это разрешено церковным уставом, на могиле старца Софрония служатся панихиды. По завету старца Софрония в пустыни нет электричества, поэтому сестры живут по афонскому времени.
Протоиерей Владимир Цветков с насельницами Софрониевой пустыни. 2003 г.
Сестры выполняют различные послушания: ухаживают за коровами, лошадью и курами, летом выращивают овощи на подворье в селе Ковакса Арзамасского района, что в десяти километрах от пустыни. Возрождая традиции, существовавшие в пустыни при жизни старца Софрония, две сестры занимаются иконописью. Две сестры выполняют золотошвейное послушание: к празднику Успения Пресвятой Богородицы ими была вышита великолепная плащаница, одна из сестер переводит с греческого языка древние патерики.
16 марта 2003 года, в праздник Торжества Православия, Софрониеву пустынь посетил епископ Нижегородский и Арзамасский Георгий в сопровождении благочинного монастырей архимандрита Кирилла (Покровского), секретаря епархии протоиерея Николая Быкова, благочинного Арзамасского округа иерея Сергия Жулина, игумении Серафимо-Дивеевского монастыря Сергии (Конковой), а также мэра Арзамаса А. Н. Мигунова, главы администрации Арзамасского района А. Н. Захарова и других попечителей пустыни. Была отслужена панихида на могиле старца Софрония, после чего Владыка с гостями осмотрел пустынь. Владыка обратился с приветственным словом к протоиерею Владимиру Цветкову с сестрами, пожелал помощи Божией и Царицы Небесной в их трудах и благословил иконками преподобного Сергия Радонежского. Игумения Сергия преподнесла сестрам иконки преподобного Серафима Саровского и подарки от Серафимо-Дивеевского монастыря. За трапезой в келейном корпусе шла речь о перспективах развития Софрониевой пустыни. В настоящее время в пустыни по благословению епископа Георгия ведется строительство храма в честь Иверской иконы Божией Матери. В планах – строительство второго келейного корпуса, часовни над источником старца Софрония и купальни, гостиницы для паломников, скотного двора и других хозяйственных построек, В осуществлении этих планов отцу Владимиру с сестрами помогают предприниматели из Санкт-Петербурга. Активное участие в восстановлении пустыни принимает группа студентов Арзамасского государственного педагогического института.
Отец Софроний говорил: «Кто меня будет поминать, за тех и я буду молиться»[286]
. Чудотворная сила его молитв проявляется и в наши дни. Около десяти лет назад священник церкви Смоленской иконы Божией Матери в селе Выездном отец Алексий ехал с рабочими на лошади в восстанавливавшуюся пустынь. Стоял ноябрь, глубокие колеи на дороге, всегда заполненные водой, подмерзли, их припорошило снегом, но под лошадью лед проваливался. Лошадь боялась наступать на лед и не хотела идти дальше, тогда один из рабочих взял её под уздцы и повел, В это время возница сильно стегнул лошадь, она рванулась, упряжью сдавила руку рабочего и протащила его на некоторое расстояние в таком положении. Получив травму, рабочий не хотел ехать дальше, но отцу Алексию все же удалось убедить его не возвращаться назад. Когда добрались до пустыньки, рука рабочего сильно опухла, посинела и «остекленела». После молитвы у могилы старца рабочий положил на нее свою больную руку и почувствовал, что боль, к его несказанному удивлению, тут же прекратилась.После этого в течение трех дней бригада рубила сруб. Намокшее дерево было на редкость твердым, приходилось прикладывать большую физическую силу. Рабочий тот трудился вместе со всеми, не чувствуя боли.