Абу Бакр Мухаммед бен Закария (865–925 годы) преуспел в лечении оспы. Энциклопедист и философ, рационалист и бунтарь остался в истории под именем Рази. Из 184 сочинений ученого сохранилось только 61. Главный труд — обширный свод медицинских знаний, по мнению специалистов, лишен систематизации. Славу Рази составил небольшой трактат, где имелось описание оспы и кори, а также указывалось на различия между этими болезнями. Здесь же был представлен способ оспопрививания. В антирелигиозном отношении интересна философская концепция медика, основанная на принципах неоплатонизма, то есть учения о пяти вечных началах. Философский трактат Рази послужил истоком памфлета «О трех обманщиках», благодаря которому автор получил известность как вольнодумец. В медицине арабский врач следовал методикам Гиппократа и считался хорошим клиницистом.
Создание медицинских энциклопедий было продолжено Али ибн аль-Аббасом, персидским автором начала X века. Его труд «Царская книга» представлял собой обширный свод медицинских знаний того времени, но был написан и классифицирован намного лучше, чем энциклопедия Рази. Египетский еврей Исаак Бен Соломон Израэли (845–940 годы) создал книги о правильном питании, лекарственных средствах, описал клинику лихорадки и пытался установить ее природу.
Персидский ученый-энциклопедист Абу Рейхан Мухаммед ибн Ахмед аль-Бируни (973 — 1048 годы) признавал суфизм, смеялся над суевериями, ненавидел астрологию, которой его принуждали заниматься владыки. Еще в юности Бируни увезли из родного Хорезма, заставив служить при дворе правителя персидского города Газни. Возможно, подневольное существование во дворце определило тягу к мистическому суфизму (от арабск. «суф» — «грубая шерстяная ткань»). Это течение ислама возникло в VIII веке, но окончательно оформилось только спустя 200 лет. Из названия можно понять, что сторонники одного из направлений мусульманства придерживались крайне сурового образа жизни, предпочитая забывать о теле и помнить о душе. Физически аскетизм выражался в ношении власяницы и беспрерывных молитвах, а духовно — в постепенном приближении к познанию бога и слиянию с ним посредством мистической любви.
Бируни состоял в переписке с Авиценной. Писал книги на арабском и персидском языках; знал санскрит, греческий, сирийский и древнееврейский языки. Наиболее известной его работой является трактат «Памятники минувших поколений» (1000) и «Канон Масуда» (1030). Труд по истории Индии с длинным названием «Разъяснение принадлежащих индийцам учений, приемлемых рассудком или отвергаемых», представлял мысль о том, что долина Инда некогда являлась морским дном. Материал для этого сочинения был собран лично автором во время индийских походов султана Газневи.
Открытием в гидрогеографии стало объяснение природы подземных источников. Придворный астролог Бируни впервые высказал идею движения Земли вокруг Солнца. Его заслугой в физике считается определение удельного веса камней и металлов.
Единственной ошибкой арабского хирурга Авензоара из Севильи (1072–1162 годы) стал пресловутый «безоаровый камень». Сам автор подразумевал под этим понятием плотное отложение, образующееся из остатков пищи и несъедобных частиц в желудке некоторых жвачных животных, в частности коз. Приписав бесполезному комку «величайшие целебные свойства», он невольно выразил общую направленность средневековой медицины. В то же время Авензоар умел распознавать метастазы в желудке, первым применил питательную клизму и считался превосходным клиницистом. Его ученик Аверроэс (1126–1198 годы) не ограничился эмпирической медициной, овладев множеством других наук. Усердно занимаясь врачеванием, на досуге писал книги, особенно предпочитая философию. Взаимопроникновением медицины и философии отмечено творчество его ученика Маймонида (1135–1204 годы).
Горькая судьба талантливого медика ознаменовала конец спокойного периода в арабском халифате. Врач отказался перейти из иудаизма в мусульманство, за что был изгнан из Кордовы. Занимая место придворного целителя халифа Салах-ад-Дина, он продолжал практиковать в Каире. Подобно Аверроэсу, Маймонид более известен как философ.
Несмотря на запрет анатомирования, арабские ученые тайно вскрывали трупы и потому располагали значительными познаниями в физиологии. Хирургия долго сохраняла статус более низкий, чем лекарственная медицина, что одинаково распространялось на исламскую и христианскую части человечества.
После Павла Эгинского самым выдающимся хирургом Средневековья считался Абуль-Касым Халаф ибн Аббас аз-Захрави (936 — 1013 годы). В латинском варианте его имя звучит как Абулькасис. Одна из сохранившихся книг медика из Кордовы имеет название «Удовлетворение». Вопреки наименованию вполне серьезное содержание труда составляют статьи о достижениях хирургии, не только предшественников, но и современных автору врачей. Ученый попытался поднять престиж врачевания: его трактат является одной из самых первых иллюстрированных книг по хирургии.