Есть одно следствие, которое выводили из трактата и которое можно найти в «Физике» Аристотеля: Первопричина не может быть началом более чем одного Мира. Он – единственный. Обсуждение единственности мира длилось несколько столетий. Проблема в том, что данное утверждение ограничивает всесилие Бога, постулированное в христианстве. Бог, по мнению христиан, может делать что угодно не противоречащее логике. Многие положения Аристотеля, касающиеся физики и метафизики, рассматривались как невозможные, в то время как они не приводили к логическому противоречию и с точки зрения всесилия Бога были возможными. Вопрос: может ли Бог нарушать законы физики и что сильнее – всемогущество природы или всемогущество Бога?
Христиане в своих рассуждениях понемногу сдавали отдельные позиции. Например, в вопросе о существовании чудес богословы, в конце концов, пришли к выводу, что надо отличать абсолютное всесилие Бога и его способность совершить в любой момент любое чудо, противоречащее законам природы, от реального исполнения такого чуда. Со временем изображение чудес встречается реже на картинах и иконах, зато чаще появляются сцены искушения Христа. Дьявол подстрекал Христа сотворить чудо: превратить камни в хлеб или сбросить себя с вершины собора. Художники иллюстрировали ответ Христа: «Отойди от Меня, сатана; ибо написано: Господу Богу твоему поклоняйся, и ему одному служи» (Матф. 4:10).
Есть ещё одно существенное отличие философских систем язычников от построений приверженцев монотеистической религии. В христианской религии предполагается, что знать может только Бог и, в меньшей степени, человек. Возможно, кое-что знают животные, но всё-таки их поведение предпочитали рассматривать с точки зрения инстинктов. В Книге Причин предполагается, что знанием обладают все и вся, хоть и в разной степени. Существует всеобщий Ум. Масса работ была посвящена опровержению данной ереси. Всеобщий Ум раздражал многих христианских мыслителей.
Что такое причина, следствие, знание, действие, а также существование материальных тел и их взаимодействие – вот комплекс вопросов, обсуждаемый в трактатах Аристотеля и в «Книге причин». В ней нет ни слова ни про Бога, ни про ангелов. Конечно, можно попробовать, как это делали католические теологи, приписать функции Перводвигателя Аристотеля (или Первопричины неизвестного автора) Богу, но это приводило к противоречиям.
Античная философия представляет опасность для монотеистической религии. Христианство никогда не могло полностью примириться с Аристотелем. Его учение срабатывало как бомба замедленного действия. С учением Платона у христианских мыслителей, в основном благодаря Августину, были более «дружественные» отношения, но и учение Платона не удовлетворяло христианским догматам.
Ещё до появления в Европе XIII века переводов с арабского работ великого философа имя Аристотеля европейцам было известно. Во-первых, знали логику Аристотеля. Во-вторых, устройство мира принималось таким, как его описывал Аристотель. Обе эти части аристотелевского учения составляли фундамент христианского мировоззрения, что создавало дополнительные трудности при ознакомлении с вновь открытыми работами философа, которые не согласовывались с христианской доктриной. Часть учения Аристотеля, посвящённая небесным сферам, входила в канон христианского учения, а часть, относящаяся к «вечному двигателю», не совпадала с Библией.
Так как многие работы Аристотеля были получены от арабов, то у христианских деятелей возникало естественное желание объяснить противоречия неправильностью интерпретации текстов философа. Арабские философы всё напутали, и надо очистить Аристотеля от мусульманского толкования. Такая позиция стимулировала переводы трудов Аристотеля непосредственно с греческого языка. Но как выяснилось, после «чистки» работ Аристотеля ситуация только усугубилась.
В 1210 году в Парижском университете запретили некоторые работы Аристотеля как не соответствующие Священному Писанию. До 1231 года в парижском университете были под запретом работы Аристотеля по натуральной и метафизической философии. Вместе с ними под запрет попали работы Авиценны и некоторых других философов. Надо отметить, что в Париже запреты соблюдались плохо, к тому же они не распространялись на другие университеты.
В 1231 году папа Григорий IX дал поручение привести учение Аристотеля в соответствие с христианской верой. В 1255 году работы Аристотеля вновь официально включены в программу факультета искусств Парижского университета. Более того, так как обучение на факультете теологии предполагало предварительное обучение на факультете искусств, все будущие церковные деятели были вынуждены сдать экзамен по философии Аристотеля.