Через минуту-другую после прорыва в помещения Пинхас и Арнон заметили, что кто-то лежит на животе неподалеку от них перед зданием. Они поняли, что ранен кто-то из своих, и, подбегая к нему, закричали: «Здесь раненый!» Арнон повернул лежащее на площадке тело, и тогда, при свете, который там был, обнаружили, что это Йони. «Врача!» — закричали бойцы. Давид, находившийся в соответствии с планом возле главного входа в зал с заложниками, повернувшись в сторону кричавших, увидел лежавшего в нескольких метрах от него на земле раненого и тут же подошел к нему. Правилом Давида было — никого не оставлять на месте ранения; он оттащил Йони, который был без сознания, поближе к зданию, за невысокую ограду. Впрочем, и это место, как и вся площадка, было доступно для возможной стрельбы с контрольной башни.
Давид услышал по рации, что Муки зовет Йони. Хотя кто-то доложил ему сразу после ликвидации террористов, что Йони ранен, Муки вдруг почудился голос Йони по рации. Он пытался ему ответить, пока не вмешался Давид и не сообщил ему, что Йони ранен и что он, Давид, сейчас занимается им.
Йони был очень бледен. Давид заметил и другие признаки, говорящие о большой потере крови. Ему было ясно, что ранение очень тяжелое. Не увидев пятен крови на одежде Йони, только на правом рукаве, поскольку Йони был ранен и в локоть, Давид решил, что кровотечение было в основном внутреннее. С помощью Арнона доктор разрезал ножом ремни и рубаху Йони и стал усиленно искать, куда вошла пуля. Сперва он обнаружил лишь выход пули на спине, у позвоночника. Несмотря на хорошее освещение, он долго не мог найти входное отверстие, пока наконец не обнаружил небольшую впадину под ключицей, с правой стороны груди. Это означало, что кровотечение действительно было внутренним и не было никакой возможности его остановить. Давид понял, что положение Йони, по сути, почти безнадежно.
Узнав, что Йони ранен, Муки сообщил об этом по рации отряду, добавив, что берет на себя командование. Перед этим, во время предварительной проверки зала, когда запах пороха, смешанный с острым запахом крови раненых и мертвых, заполнял помещение, к Муки подошел, очнувшись от первого шока, один из заложников и сказал: «В этом зале всех уничтожили, несколько террористов осталось только в соседнем крыле».
Этих террористов, как было сказано, уничтожило звено Гиоры, к которому по ошибке присоединились Шломо и Илан. Когда все было кончено в этом отсеке, Шломо помог оказать первую помощь раненому из звена Даниэля, а Илан прошел в большой зал, в котором и должен был находиться с самого начала. Амир был вне себя от радости, увидев своего друга, внезапно появившегося в дверях. Не обнаружив раньше в зале двоих из своего звена — Илана и Шломо, — он со всевозрастающим беспокойством ожидал известия о том, что их подстрелили по дороге, во время атаки. Он уже воображал самое худшее — что они погибли, как погиб другой боец из их группы во время акции по спасению в отеле «Савой». Однако при появлении Илана Амир не позволил себе дать выход чувствам. Он только поднял с широкой улыбкой автомат «Калашников» убитого им террориста и обратился к другу под аккомпанемент выстрелов бойцов Ифтаха с верхнего этажа: «Смотри, какой новый „Калашников“ я себе отхватил!»
Ифтах тем временем спустился вниз после очистки верхнего этажа и, по дороге наткнувшись на угандийских солдат, застрелил их. Снаружи он встретил Арнона, командира второго своего звена, и с несколькими своими солдатами стал очищать длинный, выходящий на площадку коридор, который отделял таможенный зал от большого. Об этом выходе, а также о коридоре, ведущем в более отдаленные части терминала, бойцам Части не было известно заранее, кроме того, что Халивни рассказал Йони в Лоде. (Выход этот посчитали в Части вторым выходом таможенного зала.)
Пинхас, оставшись сбоку здания, приготовился к позиции «с колена» снова стрелять по контрольной башне, тем временем замолчавшей, но вдруг почувствовал толчок сзади и услышал, как кто-то бормочет непонятные слова. Он повернул голову и увидел дуло винтовки в нескольких сантиметрах от своих глаз. Из-за пятнистой формы солдата Пинхас не сразу разобрался, что к чему, и подумал на миг, что это кто-то из наших, но, заметив темный цвет кожи, закричал: «Арнон, берегись! Тут кто-то есть!» Приблизившийся к Пинхасу угандийский солдат, как видно, тоже не совсем понял, что происходит. Может, и его сбила с толку пятнистая форма, и он подошел именно к Пинхасу, самому смуглому из израильского отряда. Арнон обернулся на крик и, увидев угандийца с ружьем, нацеленным в голову Пинхаса, выстрелил в него.