Как и ожидал Рудольф Туссен, камнем преткновения стало именно немедленное прекращение огня обеими сторонами. Группенфюрер СС фон Пиклер-Бургхаусс не хотел об этом и слышать в тот самый момент, когда его части уже были буквально в шаге от полного подавления всего восстания и уничтожения его руководящей верхушки. За поддержкой он обратился к рейхсминистру, но Франк, к его удивлению, поддержал командующего Вермахта, согласившись с тем, что город надо покинуть максимально быстро и за любую цену. Карл Герман Франк был обергруппенфюрером СС, то есть для Пиклера являлся старшим как по должности, так и по званию, и ему не оставалось ничего другого как подчиниться. Потом уже рассматривался только вопрос, как сообщить всем разбросанным по окрестностям и часто изолированным друг от друга и от центрального командования германским частям о прекращении боевых действий. Решением стала передача в эфир по всем имевшимся и у чехов и у немцев радиостанциям совместного заявления о прекращении боевых действий от имени Чешской Народной рады и командования Вермахта. Это обращение пражская радиостудия повстанцев передала в 19 часов 18 минут восьмого мая 1945 года.
Абсолютное большинство германских войск приказ о прекращении огня исполнили безоговорочно и немедленно начали отход на запад.
Полк «Дер Фюрер», командир которого раньше всех остальных соединений Ваффен-СС в Праге сам заключил перемирие с местными пражскими повстанцами, к этому времени уже выстроился в походную колонну, растянувшуюся через целый район Кобылисы аж до Голешовиц, где недавние бывшие противники теперь сами с готовностью расчищали машинам эсэсовцев путь среди голешовицких баррикад.
Примерно в 16.30 по договоренности о перемирии прекратила вести огонь и «кампфгруппа» генерала Рейманна, бронемашины которой находились в тот момент как раз на самой Староместской площади. Солдаты Вермахта вышли из казарм на Жижкове, уже в половине седьмого на Велварском проспекте в Дейвицах появились движущиеся из города в западном направлении организованные колонны войск. Штандарт (батальон) СА «Фельдхернхалле» около семи вечера освободил здание гимназии на Пражачке, после семи тридцати опустели казармы Вермахта в пражской Инвалидовне. К восьми вечера сформировался второй, параллельный дейвицкому, поток отступления войск через Бржевнов и далее в направлении на Карловы Вары. Немецкие колонны в Праге повсюду выглядели одинаково – сначала двигались моторизованные части абсолютно на всем, что имело колеса, причем кроме штатных прицепов в их качестве за бронемашины и грузовики «запрягалась» и любая по какой-то причине неспособная самостоятельно двигаться техника, потом шла пехота, с которой постепенно смешивались немецкие гражданские беженцы со своим наскоро собранным скарбом. В одной из чешских газет это впоследствии описывалось так:
Из крупных воинских формирований условия перемирия с самого начала не соблюдали лишь большинство частей боевой группы СС «Валленштайн», прибывших в Прагу с Бенешовского полигона и саперной школы в Градиштьку. Войска под командованием штандартенфюрера СС Вольфганга Йерхеля только ближе к вечеру начали выходить из боя и собираться в районах Крч, Кунратице, Лхотка и Модржаны, откуда потом все двинулись на Збраслав, ведя с собой несколько сотен человек в качестве заложников [148]
. Для прикрытия оставленных позиций остался небольшой арьергард с несколькими пулеметами, а одна артиллерийская батарея из Лхотки продолжала обстрел близлежащих жилых районов вплоть до наступления темноты, создавая у повстанцев впечатление наличия перед ними значительных немецких сил.