Памятуй, что рабе Божией должно быть тихой, скромной, приветливой…
Архимандрит Нафанаил
Люди приходили к Богу через горе, болезни и страдания. И старец помогал им идти по этому нелегкому пути, облегчая их беды и скорби, помогал прийти к вере и покаянию.
Он лечил их искалеченные души, очищал от скверны, устранял нравственные причины болезни. И Господь, по молитве праведника, Духом Святым совершал исцеления страждущих.В апреле 1993 года иеромонах Пафнутий был возведен в сан архимандрита, а в августе 1993 года назначен наместником киевской Китаевской Свято-Троицкой пустыни
, возвращенной Русской Православной Церкви в 1992 году.После назначения наместником Китаевского скита
старец по-прежнему ездил в лавру, по субботам служил всенощную, а в воскресные дни исповедовал в лаврском Трапезном храме. Затем стал и исповедь проводить в Китаево. Прозорливый старец знал прегрешения кающегося и часто отпускал грехи молча, но иногда сам называл те самые грехи, о которых человек либо забывал, либо не осознавал как грех. В апреле 1994 года наместник Киево-Печерской лавры архимандрит Павел (Лыбидь) совершил постриг архимандрита Пафнутия в схиму с наречением имени Феофил – в честь святого Феофила. Благодаря стараниям схиархимандрита Феофила возродилась Киевско-Китаевская Свято-Троицкая пустынь.