Стремясь сохранить поддержку сторонников покойного президента, которые хорошо помнили, что он оказался даже на вице-президентском посту только по тактическим соображениям, Тайлер заявил, что не будет менять состава сформированного Гаррисоном кабинета. На первом же заседании правительства в Белом доме госсекретарь Даниел Уэбстер, который считался значительно более влиятельным политиком, чем новый президент, проинформировал его, что в течение последних недель все президентские решения принимались большинством голосов кабинета. Скорее всего, это была выдумка, так как в самые «последние недели» президент болел и никаких решений вообще не принимал. Своим заявлением Уэбстер явно стремился показать, что именно министры, и сам он прежде всего, должны определять политический курс. Тайлер, однако, парировал: «Прошу прощения, господа. Я очень рад, что в моем кабинете состоят такие способные государственные деятели, какими вы показали себя. И я буду рад опираться на ваши советы и помощь. Но я никогда не соглашусь, чтобы мне диктовали, что я должен делать и что не должен. В качестве президента я ответственен перед всей администрацией… Если же кто-либо будет думать иначе, будет принята его отставка». Это было достаточно твердое предупреждение, что новый президент в полной мере считает себя таковым, что он намерен проводить собственную политику, а не курс, навязываемый ему однопартийцами.
Было решено не ограничиваться принесением клятвы, а устроить инаугурацию на заседании Конгресса, которая состоялась 9 апреля. В соответствующей речи Тайлер заявил, что намерен проводить курс джефферсоновской демократии, подчеркнув ограниченность федеральной власти и широкие права штатов, что соответствовало его курсу на протяжении допрезидентской деятельности. Большинство членов Конгресса приветствовали инаугурационную речь, тем самым закрепив положение Тайлера как полноправного президента. Правда, и после этого некоторые упрямые политики называли его вице-президентом или исполняющим обязанности президента (по-английски acting president), а в Белый дом подчас поступала корреспонденция с таким обозначением адресата. По требованию Тайлера эти поступления немедленно возвращались лицам или организациям, которые их направили.
Уже вскоре после вступления на президентский пост Тайлер столкнулся с серьезной оппозицией в Конгрессе со стороны части членов Партии вигов во главе с Клеем.
Правда, Тайлер одобрил и подписал фундаментальный закон о преимущественном праве покупки, который предоставлял право лицам, занявшим земли на западе без какого-либо юридического оформления (так называемым сквоттерам) право покупать участки земли в 160 акров (ок. 65 гектаров) за ничтожную плату в 1,25 доллара. Это же право распространялось на всех, кто намеревался переселиться на новые земли. Закон о сквоттерах, как его стали называть, стал мощным инструментом освоения западных земель белыми поселенцами и дальнейшего оттеснения индейцев в резервации. Были подписаны и вступили в силу и некоторые законы по конкретным вопросам, в частности о банкротстве, определявший случаи, при которых отдельные фирмы могли объявлять о своем банкротстве и получали льготы при расчете по долгам. Тайлер подписал и закон о таможенных сборах, регулировавший ввозные пошлины, повышая одни и снижая другие в зависимости от интересов американского капитала.
В то же время Тайлер наложил вето на три принятых по настоянию Клея закона о банковской системе, считая, что они ущемляют права штатов в пользу федеральных властей. Полагая, что Тайлер нарушил партийную дисциплину, Клей добился беспрецедентного решения об исключении президента из Партии вигов, объявив его предателем партийных принципов (именно Клей впервые назвал его «ваша случайность»). Оказавшись без своей партии, но сохраняя властные амбиции, Тайлер попытался склонить на свою сторону некоторых вигов, но эта затея оказалась малорезультативной. В прессе была развернута кампания с требованием его отставки. В июле 1842 г. было даже выдвинуто требование импичмента на основании того, что президент не уважает волю Конгресса как высшего органа власти и пытается установить единоличную власть. Клей и близкие к нему конгрессмены сочли, однако, что это требование носит искусственный характер и может привести к нестабильности в стране. В результате требование импичмента было отвергнуто 127 членами Палаты представителей против 83. Тем не менее ряд членов правительства ушли в отставку, и Тайлеру пришлось заполнять вакантные места малоизвестными деятелями из числа своих близких сторонников.