31 октября 1944 года дивизия была награждена орденом Красного Знамени за успешные боевые действия по освобождению Жемайтии, в ходе которых она прошла 187 километров, освободив 419 населенных пунктов, в том числе 11 городов. Сотни воинов дивизии получили награды за отвагу и героизм, а десяти наиболее отличившимся солдатам и офицерам было присвоено звание Героя Советского Союза Указом Президиума Верховного Совета СССР от 24 марта 1945 года. Вот их имена: майор Вольфас Виленскис (1919–1992), старший сержант Болеслав Гегжнас (1906–1952), младший сержант Федор Зацепилов (1924–1987), подполковник Федор Лысенко (1913 года рождения; погиб в бою 22 февраля 1945 года, звание присвоено посмертно), сержант Григорий Терентьев (1923 года рождения; погиб в бою 14 октября 1944 года, звание присвоено посмертно), ефрейтор Григорий Ушполис (1923–1997), старший сержант Василий Федотов (1924–2000), красноармеец Борис Цинделис (1916 года рождения) и младший сержант Стасис Шейнаускас (1917 года рождения) – погибли в бою 13 октября 1944 года, звание присвоено посмертно, сержант Калманас Шурас (1917–2003).
В ноябре – декабре 1944 года дивизия, совершив 160-километровый марш, приняла участие совместно с другими соединениями в боевых действиях против фашистской группировки «Север». Отрезанные от Восточной Пруссии 33 дивизии были окружены в лесах и болотах Курземе (по-латышски), или Курляндии (по-немецки), прижаты к прибрежной полосе Балтийского моря, где и остались до конца войны под названием Курляндская группировка.
Во второй половине января 1945 года дивизия ночными маршами снова прошла путь из Курляндии по Жемайтии через Мажейкяй, Седа, Плунге в Клайпедский край и приняла участие в операции 1-го Прибалтийского фронта по освобождению города-порта Клайпеды.
С 19 января по 21 февраля 1945 года дивизия в составе войск 4-й ударной армии (командующий – генерал-лейтенант П.Ф. Малышев) участвовала в боях за Клайпеду.
26 января Литовская дивизия, сосредоточенная в районе Кретинги, составляла резерв командующего армией.[150]
К вечеру этого дня разведка частей установила отход противника во вторую и третью линию траншей. Командующий армией отдал приказ о наступлении по всему фронту с утра 27 января. 16-я Литовская дивизия шла вперед в направлении северной части Клайпеды, левее 179-й дивизии. Воины дивизии шли в наступление под лозунгом «Клайпеда была и останется литовским городом». Наступление шло по всему фронту, однако к 12 часам наши войска овладели только первой позицией главной полосы обороны противника. В то же время 16-я дивизия на своем участке действовала энергично.Перейдя в наступление в два часа дня, 156-й и 249-й полки продвинулись на четыре километра. 156-й полк вел тяжелый бой за высоту на берегу реки Данге, с которой противник вел обстрел шоссе Клайпеда – Кретинга. Поскольку атака в лоб в шесть часов вечера оказалась неудачной, 249-й полк вышел в тыл противника. Обходной маневр совершила рота лейтенанта Нарбутаса, которая атаковала высоту с тыла. Немцы начали отходить. В бою Нарбутас получил смертельное ранение.
В три часа ночи 28 января в город первыми ворвались подразделения 249-го полка, за ними на северные окраины вышли другие части дивизии. В 5 часов 30 минут к заливу вышли подразделения 167-го стрелкового полка, которыми командовал майор И.В. Баранов. Войсками 4-й ударной армии Клайпеда была полностью освобождена к восьми часам утра.[151]
Тем самым от немецко-фашистских захватчиков в этот день была полностью очищена вся территория Литвы.
После отступления из района Клайпеды части противника закрепились на косе Курише-Нерунг, откуда весь день 29 января вели артиллерийский обстрел Клайпеды.
К утру 29 января из Клайпеды были выведены войска 344-й и 70-й стрелковых дивизий. 16-я дивизия осталась в городе одна. Она продолжала разминирование города, приводила себя в порядок и занимала оборону по восточному берегу залива Куришес-Хафф в районе города и к югу от него, до реки Шмельтелле (Шмельц).
С 30 января по 4 февраля части дивизии с боями очищали от противника косу Курише-Нерунг у Клайпеды. Здесь отличились воины 156-го стрелкового полка (командир – подполковник В. Луня), переправившиеся в ночь на 30 января 1945 года по сильно потрескавшемуся от обстрела льду залива и неожиданно для врага вступившие на Куршскую косу. Гитлеровцы не выдержали внезапного удара и, даже не успев взорвать склады с военным имуществом, стали отступать на север к маяку, где их ждали корабли. В конце косы противник был разгромлен в девять часов утра.[152]