В конце 1971 г. Е.И. Богданов занял по конкурсу должность заведующего кафедрой «Подъёмно-транспортные машины и оборудование» Северо-Западного заочного политехнического института (СЗПИ, ныне Северо-Западный государственный заочный технический университет) и сразу же приступил к созданию научного направления по совершенствованию горнотранспортной техники. В 1973 г. он был утверждён в учёном звании профессора.
В 1971–1983 гг. Богдановым разработаны и внедрены хорошо известные сегодня в горной практике конструкции отвалообразователей ОЛОЗ-2-1000, отсадочных машин ОМТ-1-1600, спиральных обезвоживателей ОСП-1-130, консольных скрубберных агрегатов АСК-200, погрузчиков-питателей пластинчатых БППП-1-П00 и цепных ПСЦ-5, подъёмных переставных конвейеров КПП-2-1000 и др.
В 1980 г. по договору с ВПО «Союззолото» на кафедре начали совместные с ЦКБ ВНИИ-1 и ПО «Северовостокзолото» работы по созданию транспортно-обогатительного комплекса ТОК-2000К для промывки и обогащения песков при разработке россыпных месторождений золота. К этому времени все работы этого направления выполнялись в рамках государственной программы ОЦ.039ГКН СССР, где СЗПИ был одним из исполнителей.
Труды Е.И. Богданова и сейчас не потеряли своей актуальности, они широко востребованы специалистами россыпной золотодобывающей промышленности, научными сотрудниками, преподавателями и студентами вузов горного профиля. В его работах можно найти оригинальные идеи и предложения по совершенствованию технологий и оборудования при разработке россыпных месторождений открытым и подземным способами.
Разработанная Е.И. Богдановым технологическая схема переработки песков россыпей драгой имеет существенные преимущества по сравнению с применявшимися ранее. В созданной Е.И. Богдановым отсадочной машине типа ОМТ отсадке подвергается горная масса в процессе принудительного транспортирования её механическим способом, что позволило придать данным машинам новую функцию: обогащение крупных фракций песков и извлечение самородков.
С появлением мощных промывочных приборов серьёзной проблемой на разработке россыпных местонахождений стало размещение значительных объёмов «хвостов» скруббера (плюсовых фракций). Применявшиеся для этих целей конвейеры позволяли складировать в отвал только небольшую часть «хвостов». Е.И. Богданов успешно решил эту проблему, создав опорно-звеньевые ленточные отвалообразователи (стакеры) СПЗ-II-650 и СПЗ-II-800, способны складировать объёмы «хвостов», в десятки раз превышающие объём первичного отвала.
Почти все научные и конструкторские разработки Е.И. Богданова и его соратников выполнялись на уровне изобретений.
Работая в Ленинграде, Евгений Иванович не прерывал связей с Дальним Востоком. Так, в 1976 г. Е.И. Богданов и академик Н.А. Шило представили в Госплан СССР совместный доклад о проявлениях платиноидов на севере Хабаровского края. Богданов хотел создать в Хабаровске, центре горнодобывающей промышленности Дальнего Востока, Институт горного дела – академическую организацию, способную решать проблемы эффективного освоения минерального сырья региона. В соответствии с Постановлением Совета министров СССР № 56 от 21 января 1980 г. Президиум Академии СССР принимает решение «…организовать в гор. Хабаровске в составе Дальневосточного научного центра АН СССР Институт горного дела АН СССР на базе лабораторий горного дела Хабаровского комплексного научно-исследовательского института АН СССР». Через три года было подписано распоряжение Дальневосточного научного центра АН СССР № 160/21х от 10 марта 1983 г.: «Организовать в г. Хабаровске Институт горного дела АН СССР на базе лабораторного горного дела Хабаровского комплексного научно-исследовательского института АН СССР». С января 1983 г. Е.И. Богданов – член Президиума ДВНЦ и директор – организатор института, а 14 марта 1984 г. постановлением общего собрания Академии наук СССР он утверждён в должности директора Института горного дела Дальневосточного научного центра.
В постановлении Президиума Академии наук СССР № 1439 от 10/17 ноября 1983 г. «Об организации Института горного дела АН СССР» в составе Дальневосточного научного центра АН СССР были утверждены следующие основные направления научных исследований Института горного дела АН СССР: прогнозирование развития и технико-экономическая эффективность горнодобывающей промышленности Дальневосточного экономического региона; создание эффективных видов горных машин, оборудования и технологических процессов, в полной мере соответствующих горно-геологическим и экономико-географическим условиям Дальнего Востока и Северо-Востока; существенное повышение комплексности и полноты извлечения полезных ископаемых из руд и россыпей; создание научных основ прогрессивной технологии разработки россыпных месторождений, основанной на применении оборудования высокой единичной мощности; определение основных направлений технической политики на разработке россыпей; решение региональных экологических проблем горного производства.