Несмотря на все сложности жизни Ярославля в самом начале ХVII в., в целом это столетие стало для него своего рода золотым веком, когда после изгнания интервентов из России он начал стремительно развиваться, стал славиться как мощный торговый и ремесленный центр. В Ярославле быстро росло число отечественных и иностранных хозяйствующих субъектов. Были созданы почти три десятка иностранных контор, прежде всего английских, немецких, голландских. Но предпосылки для этого были созданы гораздо раньше – еще во второй половине ХVI в., когда после завоевания царем Иваном Грозным Казанского и Астраханского ханств (1552 г. – победоносный штурм Казани) возникли благоприятные условия для развития торговли по Волге с восточными странами. Ярославль стал одним из ключевых центров торговли, поскольку он имел (и имеет) выгодное транспортное положение, находился на пересечении очень важных тогда речных путей, связывавших Москву, Западную Европу, страны Ближнего Востока. Длительное время в Ярославле успешно развивались и разные местные промыслы, в том числе выделка кож, ткачество, мыловарение, кузнечное и ювелирное ремесло, а также льноводство и рыболовство. В ХVII в. Ярославль в масштабе всей России оценивался как крупный торговый (хлеб, лен, рыба, другие товары) и ремесленный центр (особенно славились местные каменщики, плотники, кожевники и кузнецы). Во второй половине ХVII в. Ярославль был вторым городом страны (после Москвы) по числу жителей и экономическому значению.
Ярославль был богатым городом, в нем жили многие очень состоятельные купцы и целые их династии. По мере роста благосостояния ярославцев укреплялось их стремление с комфортом и вкусом организовать свой быт, иметь красивые и удобные дома для жилья и деловых операций. В городе стремительно разворачивалось каменное строительство, к середине ХVII в. сложились самобытные школы ярославского каменного зодчества и настенных росписей.
В 1722 г. по указу царя Петра I в Ярославле приступили к созданию Ярославской большой мануфактуры, что ознаменовало начало нового этапа в его хозяйственно-экономическом развитии. В ХVIII в. Ярославль стал крупным промышленным центром.
В начале ХIХ в. ярославцам, как и всем другим россиянам, пришлось снова бороться с внешним врагом, участвовать в ликвидации угрозы национальной безопасности России. 1812 год принципиально изменил ритм жизни Ярославля. Ярославцы принимали доблестное участие в войне с французскими интервентами. В июне 1812 г. 600-тысячная армия Наполеона вторглась в Россию, в сентябре французы были в Москве, Ярославская губерния стала прифронтовой. На Ярославской земле открыли госпитали для раненых российских воинов, 2 из них действовали в Ярославле, в котором размещался штаб «Ярославской военной силы» (народное ополчение). Ярославское ополчение было создано в августе 1812 г., оно состояло из 4 пеших и одного конного полка – всего 11,3 тыс. воинов, в основном – крепостных крестьян. Ярославское дворянство выбрало начальником их ополчения генерал-майора Я.И. Делюнина. Ярославское ополчение вошло в состав отряда русских войск, прикрывавших дорогу из Москвы на Петербург. Затем ярославцев направили в действующую армию. Ярославские ополченцы в 1813 г. в составе русской армии участвовали в осаде Данцига, который был взят. В 1814 г. вышел указ о роспуске ополчения «Ярославская военная сила», ярославцы вернулись на родную землю.
После победоносного окончания войны с Наполеоном промышленное развитие Ярославля продолжилось и еще более ускорилось, особенно в связи со строительством в 1870–1898 гг. железной дороги, связавшей Ярославль с Петербургом, Москвой, Вологдой, Костромой, другими значимыми в хозяйственном плане городами. Большое значение имело и строительство железнодорожного моста через Волгу в 1903 г. Поезда стали следовать на север и восток от Ярославля, в том числе в Китай и Монголию.
Постепенно упрочивалось значение Ярославля как центра культуры и образования. В 1750 г. созданная по инициативе Ф.Г. Волкова театральная труппа положила начало созданию русского театра. В 1805 г. в Ярославле по инициативе и на средства известного богача П.Г. Демидова было основано Демидовское высших наук училище, реорганизованное в 1833 г. в лицей (в 1918–1924 гг. – университет).
В конце ХIХ в. Ярославль был одним из самых экономически благополучных и красивых городов на Верхней Волге. В нем насчитывалось в 1897 г. 1755 деревянных и 1099 каменных домов, было 77 церквей, действовали отделения разных банков (Государственного, Крестьянского поземельного, Московского международного), а также Городской общественный банк, конторы и пристани, 5 пароходных обществ, работали 57 фабрик и заводов (особенно большое значение имели мануфактуры бумажной и льняной пряжи и тканей, а также табачная, заводы химические, спичечные, лесопильные), ежегодно проводились ярмарки (главный предмет их торговли – стеклянная, фаянсовая и фарфоровая посуда), были городской театр, больница губернского земства, другие учреждения.