Команда «Уральца» получила по миновании шторма от имени августейших особ по десять чарок, кондукторы и боцман — ещё по пять рублей серебром, а создателю благополезного описания решили изъявить особую милость. В чём она состояла, однако, узнать не удалось.
— Саня, откуда в тебе столько энергии? — не переставал удивляться его старый добрый товарищ и тёзка Александр Колчак, будущий адмирал флота.
— Во-первых, у меня чернильница и перо — самописки. Они сами строчат. А ещё, как ты помнишь, я орехи люблю — от них в мозгах прочищение делается, — отшучивался Щеглов. И делать он успевал действительно чрезвычайно много.
В тесной каюте корабля, в небольшой, но уютной квартирке на Адмиралтейском канале, дом 5 в Петербурге, где нечасто доводилось проводить свой отпуск, Александр Николаевич готовил и шлифовал главный план своей жизни — проект оперативно действующего Морского Генерального штаба с функциями, неведомыми неповоротливому и застывшему в косности Главному Морскому штабу.
Прирождённый разведчик-аналитик, А. Н. Щеглов готовил свой проект тщательно и, как тогда говорили, «весьма сберегаясь». Впрочем, по крайней мере три человека были изначально посвящены в секрет проекта: Саша — Александр Васильевич Колчак и два адмирала — Зиновий Петрович Рожественский и Александр Фёдорович Гейден. Думаю, их имена также хорошо известны читателю России.
По иронии судьбы, с перепиской А. Н. Щеглова с этими замечательными людьми России, конечно же неполной, автору удалось ознакомиться благодаря... Осведомительному отделу самого Главного Морского штаба — его дотошные умельцы с особым усердием «пасли» нашего героя. Благодаря «отдельцам» сохранилась и значительная часть из того документального наследия Щеглова, что в перебелённом виде отправилась «наверх» и сгинула в болоте канцелярии Морского министра.
Усилиями 3. П. Рожестве некого и А. Ф. Гейдена Щеглов был переведён с флота на берег, чтоб «закончил начатое в тепле и без качки», как изволил пошутить Зиновий Петрович Рожественский, «а то пишете и без того мелко и неудобочитаемо».
Уже осенью 1905 года два друга — лейтенанты A.Н. Щеглов и А. В. Колчак, два капитана 2-го ранга
B.К. Пилкин и М. М. Римский-Корсаков объединились в Санкт-Петербургский морской кружок. В беседах в кружке, в обмене мнениями с маститыми адмиралами получила окончательное оформление пространная записка о коренных преобразованиях в деятельности всего морского ведомства России.
9 (24) января 1906 года в Управление Морского Генерального штаба из стратегической части Военно-морского учёного отдела были откомандированы 14 офицеров, и среди них — Щеглов. В очередную годовщину этого откомандирования в посольство России в Стамбуле, где тогда работал А. Н. Щеглов, 9 января 1912 года пришла телеграмма с признанием его заслуг. На бланке Администрации почт и телеграфа Османской империи латинскими буквами значилось (воспроизводим по подлиннику):
Vas pomnim pervogo iniziatora shtaba i shlem nizkiy poklon Karsakoff Berens Samarine Keller Novikoff Borkovsky Guene Nischenkoff Kallistoff Yakovleff.
Адресат — наш герой — ознакомился с телеграммой друзей по Морскому Генеральному штабу, думаю, с не меньшим удовлетворением, чем с подписанным тогда царским рескриптом о награждении А. Н. Щеглова, капитана 2-го ранга, орденом Станислава 2-й степени «в воздаяние отлично усердной службы Вашей».
Все перипетии и козни морского начальства при обсуждении и проведении в жизнь указа от 25 апреля (по ст. ст.) 1906 года о создании Морского Генерального штаба заслуживают особого рассказа. Достаточно сказать, что безвестный лейтенант добился того, что не слишком благоволивший к флотским император Николай II получил доклад Щеглова в обход морского министра, аккуратно всё прочёл и заявил: «В докладе и законопроекте так ясно и подробно очерчены все обязанности и деятельность органов Морского Генерального штаба, что остаётся только сесть и начать работать». И ещё подчеркнул: «Какие дельные мысли о разведке!»
Не вдаваясь в детали тщательно проработанного проекта, заметим, что он предлагал очень высокий уровень требований к сотрудникам Разведочного бюро и Отделения иностранной статистики, в частности. Достаточно сказать, что начальник отделения подчинялся лично первому заместителю начальника Генмора с обязанностью письменного доклада один раз в два месяца. Все офицеры отделения зачислялись на должность только после полугодовой стажировки под наблюдением упомянутого первого заместителя начальника Генмора и очень суровых экзаменов. Знание трёх-четырёх иностранных языков и длительная зарубежная практика в стране изучения считались само собой разумеющимися факторами наравне с пяти-, семилетней службой после окончания Морского корпуса.
Николай II высоко оценил идеи Щеглова, подчеркнув, что видит в них «залог обновления и скорейшего развития флота».