К концу Галльской кампании Цезарь командовал десятью легионами. Большинство солдат были закаленными ветеранами, абсолютно преданными Цезарю и доверяющими своему и командирскому умению. В поддержку им были приданы отряды превосходной галльской и германской конницы. В противовес этому Помпей имел семь легионов, размещенных в его испанских провинциях, хотя они имели мало опыта реальных боев. Кроме того, в Италии у него оставалось два легиона, которые еще не были отправлены на восток, но, так как оба легиона недавно служили под началом Цезаря, их преданность казалась сомнительной. Однако Помпей хвастал, что стоит ему только шаг ступить в Италии, как в его распоряжении появится большее количество легионов, и что он также уверен в лояльности восточных провинций, реорганизованных им всего десять лет назад. За более долгий период, возможно, Помпей мог бы претендовать на большие ресурсы, чем Цезарь, но мобилизация полевых армий заняла бы время.
В 49 г. до н.э. Помпею было почти 58 лет, но он оставался исключительно здоровым и активным, многие восхищались энергией, которую он демонстрировал, участвуя в тренировочных упражнениях своих солдат. Его военная репутация была исключительно хорошей, даже несмотря на то, что у него вошло в привычку прибывать на поле боя на последних стадиях сражения, заявляя права на победу, в значительной степени одержанную кем-то другим. Без сомнения, он был блестящим организатором, как показывают его походы против пиратов и в более позднее время надзор за поставками зерна в Рим. В молодости он был смелым командиром, в нескольких случаях лично руководил атакой, но в основе его чисто римской напористости всегда была крепкая подготовка. Хотя Помпей был на шесть лет старше Цезаря, он провел последние десять лет в Риме и не участвовал в кампаниях с 62 г. до н.э. Его действия во время гражданской войны позволяют предположить, что его лучшие достижения как полководца остались в прошлом. Ему не помогло присутствие в лагере многих выдающихся сенаторов. В отличие от Цезаря, чьи последователи не были известны и чей авторитет не подлежал сомнению, Помпей всегда находился под давлением, заставлявшим его менять планы. Большинство сенаторов, стекавшихся к нему, обладали больше престижем, чем умением, и в нескольких случаях оказались несомненной помехой.