Как только Меншиков, оправившись от болезни, появился при дворе, он сразу почувствовал что-то новое в отношениях к нему императора и всего двора. Было заметно, что государь явно избегает его.
Чтобы подавить это «возмущение», Меншиков стал обращаться с Петром еще строже, чем прежде, и позволил себе по отношению к нему несколько крайне бестактных поступков.
Петербургские рабочие-каменщики поднесли императору в подарок 9 000 червонцев. Петр послал эти деньги Елизавете. Встретив во дворце солдата, которому император приказал отнести червонцы тетке, Меншиков вернул его обратно. Узнав об этом, Петр сильно вспылил и крикнул Меншикову: «Я тебе покажу, кто из нас двух император!» В следующий раз, когда Петр потребовал себе 500 червонцев, Меншиков спросил его: «Для кого?» – «Мне нужно!» – гордо ответил Петр.
Меншиков выдал деньги, но, узнав, что они отправлены Елизавете, приказал отобрать их у нее. Оскорбленная этим Елизавета тоже примкнула к врагам Меншикова и в разговорах с Петром настраивала государя против зазнавшегося временщика.
В сентябре Меншиков, по случаю освящения часовни, устроил в своем поместье в Ораниенбауме пышное празднество. Петр обещал быть на этом торжестве, но, узнав, что Елизавета не приглашена, в последнюю минуту прислал сказать, что не приедет. Меншиков был очень огорчен этим, но не показал вида. Празднество прошло с необыкновенным блеском. Однако и здесь Меншиков не удержался от бестактности: во время богослужения в часовне он стал на царское место. Об этом, конечно, сказали Петру.
На следующий день Меншиков поехал к императору, чтобы поговорить с ним и восстановить прежние отношения, но, желая избегнуть встречи во дворце с Елизаветой, умышленно приехал с опозданием и не был принят: Петр собирался на охоту. Тогда Меншиков поехал к Наталье Алексеевне, но она тоже не вышла к нему. Елизавета приняла Меншикова, но очень холодно. Раздраженный временщик стал грозить, что бросит все дела и уедет в украинскую армию. Елизавета отнеслась к этой угрозе равнодушно, и Меншиков ни с чем уехал из дворца.
В тот же день Петр, вернувшись с охоты, приказал перевезти свои вещи из дома Меншикова во дворец, а затем предупредил гвардию и Верховный совет, что впредь они должны повиноваться только его личным приказаниям. 8 сентября Меншиков был уже арестован.
Указом императора от 9 сентября Меншиков был лишен должностей, чинов, орденов и ссылался в свое имение в Рязанской губернии. По церквам было разослано запрещение поминать в ектеньях бывшую невесту государя. На следующий же день семья Меншикова покинула Петербург. Поезд опального вельможи состоял из 4 карет, 150 повозок и фургонов и 147 слуг. Но с дороги, по распоряжению императора, были возвращены экипажи и слуги, признанные лишними. В Клину, близ Москвы, Меншиков получил приказ выдать обручальное кольцо дочери Марии. Вскоре после этого и все колоссальное состояние Меншикова было конфисковано.
С падением Меншикова Петр почувствовал себя совершенно независимым. Он перестал учиться и заниматься делами. Уже в декабре один из современников писал в своем дневнике так: «Император занимается только тем, что целыми днями и ночами рыскает по улицам с царевной Елизаветой и сестрой, посещает камергера, пажей, поваров и Бог весть еще кого».
Характер Петра тоже сильно изменился к худшему: сделался вспыльчивым, настойчивым и резким. Если сестра пробовала уговаривать брата, он молча вставал и уходил.
Остерман, получивший теперь первенствующее влияние во всем, стал готовиться к коронации императора. 9 января 1728 года Петр с огромным штатом придворных сановников и свиты выехал в Москву. Но в Твери он заболел корью и пролежал две недели, а затем продолжал путь. Москва встретила императора восторженно, и 24 февраля 1728 года был совершен обряд коронации.
Вернувшись в Петербург, Петр продолжал вести прежнюю развязную жизнь. Опять вместе с Елизаветой и в сопровождении большой свиты он проводил целые недели на охоте. В ноябре скончалась любимая сестра императора, Наталья Алексеевна. Ее преждевременная смерть была огромной потерей для Петра, всей важности которой он не сознавал.
Вскоре после смерти сестры Петр подпал под влияние Долгоруких, и у этой честолюбивой семьи возник план породниться с императором, тем более что последний уже охладел к Елизавете и почувствовал влечение к Екатерине Долгорукой. Это была восемнадцатилетняя красавица изящного сложения, с прекрасным цветом лица, густыми черными волосами и необыкновенно выразительными глазами. Она имела смелый, энергичный характер и по тому времени была хорошо образована. Побуждаемая фамильным и личным честолюбием, она вся отдалась мысли увлечь императора своими чарами.