О позиции самого Александра Васильевича по этому вопросу можно судить, например, по истории с приказом генерала С. Н. Розанова, руководившего подавлением партизанского движения в Енисейской губернии. В мемуарах членов правительства Колчака есть свидетельства о том, что Розанов получил за это выговор и в дальнейшем был переведен на другой участок работы – командующим Приамурским военным округом. То есть Верховный правитель неоднократно пытался ввести в рамки законности подобные репрессии, иногда действительно приобретавшие в регионах жестокий стихийный характер.
Тем не менее до сих пор военная коллегия Верховного суда России отказывает в формальной реабилитации А. В. Колчака, обтекаемо объясняя это тем, что он не препятствовал операциям карательных органов и контрразведки против мирного населения.
Но вернемся в 1918 год. В действительности как Верховный главнокомандующий А. В. Колчак сразу же сосредоточился на укреплении боеспособности армии. Следующими своими целями он объявил победу над большевизмом, а также восстановление законности и порядка и возрождение погибающего государства.
Именно поэтому в январе 1919 года во многом благодаря его стараниям и усилиям в Омске был частично воссоздан Правительствующий сенат из состава находившихся в тот период в Сибири бывших сенаторов Российской империи. Весной 1919 года был сформирован Межведомственный правительственный комитет по обеспечению законности и порядка, в который вошли министр внутренних дел, министр юстиции и военный министр. Этот орган был призван координировать действия судебного ведомства, карательных органов МВД и военных органов, военных властей на местах по обеспечению законности. Иначе говоря, полным ходом шло государственное строительство.
Сильная власть, сконцентрированная в одних руках, дала белым надежду. Колчаку удалось осуществить важные административные, военные, финансовые и социальные реформы. Были предприняты меры по возобновлению промышленности, снабжению крестьян сельскохозяйственной техникой, освоению Северного морского пути.
Последовали и знаковые шаги: были восстановлены награды Русской армии, в том числе высшие императорские ордена, а также организовано расследование убийства царской семьи. А с конца 1918 года Александр Васильевич начал подготовку Восточного фронта к решающему весеннему наступлению, проведя реорганизацию армии.
В марте 1919 года белые войска в сражениях с частями Красной армии добились долгожданных успехов. Началось их продвижение к Волге. Авторитет А. В. Колчака был высок как никогда. В. И. Ленин называл его главным врагом Советов. Большевики даже назначили огромную премию за выдачу адмирала. В мае 1919 года главнокомандующий Вооруженными силами Юга России генерал А. И. Деникин признал власть адмирала Колчака как Верховного правителя Русского государства и подчинился ему как Верховному главнокомандующему Русской армией.
Летом в качестве основной цели Восточного фронта рассматривалась помощь войскам А. И. Деникина в запланированном походе на Москву. И в сентябре в ходе Тобольской операции белым вновь удалось одержать ряд побед. Однако к октябрю большевики смогли сосредоточить на этом направлении крупные силы. Началось наступление РККА. Командующий Восточным фронтом генерал М. К. Дитерихс принял решение сделать стратегическую уступку красным. Это стало непоправимой ошибкой. Белые войска попали под мощнейший контрудар, а их отступление стало последним. 10 ноября 1919 года была проведена эвакуация Омска.
Адмирал А. И. Колчак отходил вместе с армией. Как отмечают историки, во-первых, этим он рассчитывал поднять боевой дух деморализованных войск. А во-вторых, так Александр Васильевич пытался противодействовать возможному завладению союзниками, чехословаками или красными золотым запасом России. Колчак категорически отверг предложение французского генерала Жанена и дипломатического корпуса о взятии российского золота «под международную опеку» в обмен на помощь. По свидетельствам, ответ адмирала был резким: «Я вам не верю. Золото скорее оставлю большевикам, чем передам союзникам». Наверное, сегодня никого не удивит, что с этого момента судьба Колчака больше не интересовала союзников. А при первом удобном случае они его предали.
По прибытии в Иркутск 15 января 1920 года Колчак был выдан местному революционному совету чехословаками, стремившимися обеспечить собственную безопасность и пытавшимися максимально быстро покинуть страну. До этого Александр Васильевич отказался бежать и тем самым спасти свою жизнь, сказав: «Я буду разделять судьбу армии».