За зданием Кригс-комиссариата к набережной выходят несколько интересных строений под № 26, которые находятся на участке, исторически принадлежавшем к Садовнической улице, – речь о них пойдет в соответствующей главе.
На отрезке Космодамианской набережной до Большого Краснохолмского моста находятся несколько монументальных жилых домов советского времени – ансамбль строений № 28–30, 32–34 и 36 и далее № 40–42 и 46–50.
Первые три из них образуют комплекс разновременных строений: среднее отодвинуто вглубь, а боковые, соединенные с ним высокими башнями, выступают к набережной, образуя таким образом парадный двор.
Среднее строение (№ 32–34) – монументальный жилой дом, произведение архитектора М.И. Синявского (1952). Дом богато декорирован: наличники, напоминающие наличники XVII в. нарышкинского барокко, лепные вазы, гирлянды и в довершение всего карниз с советским гербом. В этом доме жили академики И.М. Франк и И.И. Новиков.
Далее по набережной – трехэтажный дом № 38, построенный в 1889 г. для жены коллежского советника А.И. Смецкой, а рядом – также в три этажа – одно из самых старых строений, относящееся к 1781 г., но с тех пор не раз перестраивавшееся. Декор его характерен для этого времени: вертикальные ниши на фасаде, образованные несколько выступающими филенками между первым и вторым этажом.
Дом № 40–42 (1940-е гг.) своим фасадом, украшенным тяжелым порталом с двумя дорическими колоннами, выходит на набережную; фасад его несимметричен: левая часть существенно более декорирована, чем правая, оформленная скромнее.
Здесь, на Знаменском лугу (назывался он так потому, что принадлежал Знаменскому монастырю в Китай-городе), находилось урочище под забавным названием Пупыши, которое сохранялось в имени переулка и церкви. После постройки в советское время существующего дома переулок вместе с церковью исчезли с карты Москвы, а с ними и само название из памяти москвичей. Правое крыло этого дома построено на месте закрытого Пупышевского переулка, название которого произошло, как объясняют, от «пупышей» – неких возвышенностей на низменной поверхности старицы. В «Словаре русского языка» академического Института русского языка слова «пупыши» нет, но оно встречается в разных местах России при обозначении холмов, курганов, останцов; есть также и прозвище «пупыш» (то есть волдырь, прыщ), от которой произошла фамилия Пупышев (в Новгороде XVI в. упоминается крестьянин Пупыш). По объяснению самого авторитетного специалиста по московским названиям А.А. Мартынова, приведенному в его книге «Названия московских улиц и переулков с историческими объяснениями», изданной в 1888 г., имя переулок «получил потому, что расположен в местности возвышенной, холмистой». Теперь, правда, особенных холмов здесь как будто незаметно, но вот автор книги «Седая старина Москвы» И.К. Кондратьев писал в 1893 г., что эти места не заливаются при наводнениях.
Через арку в правом крыле дома можно пройти в обширный двор, примерно посередине которого и стояла церковь Святого Николая, что на Пупышах (иногда она еще называлась «что на Пупышове» или «Пупушове», «в Садовниках», «на Знаменском лугу»). Она известна из летописного известия о пожаре 1565 г., по сведениям 1657 г., здание ее было деревянным, а каменное начато строительством в 1690 г., которое продолжалось около 10 лет. Довольно быстро оказалось, что церковь не вмещала молящихся, и в марте 1731 г. был дан указ: «Велено тоя настоящую церковь Пресвятой Богородицы и предел Чудотворца Николая за умалением разобрать и на том же месте построить вновь каменную ж настоящую и предел во имя тое же престола». Освящение нового здания, воздвигнутого тщанием суконного фабриканта Владимира Петровича Щеголина, происходило в 1735 г. Главный престол во имя Смоленской иконы Богоматери, приделы – Николая Чудотворца и иконы «Утоли моя печали», которая считалась «чудотворной». Колокольня и трапезная выстроены уже существенно позже: в 1846–1850 гг. по проекту архитектора П.П. Буренина. Внутренность церкви описывалась как «величественная», и отмечалось, что «иконостас обоих приделов богат и нового вкуса». На каменной ограде этой церкви отмечались уровни наивысшего разлива Москвы-реки с 1788 по 1856 г.
После закрытия церкви ее здание приспособили под общежитие работников конного транспорта. Как пишет историк В.Ф. Козлов, делалось это «поистине варварским способом» – выламывались колонны, сбрасывались кресты. Окончательно порушили церковь в 1959–1960 гг.