Но главным было обвинение их в причастности к репрессиям 30‐х годов, хотя знали, что Хрущев не меньше их был повинен в этих репрессиях. После пленума Жуков без санкции ЦК принял решение организовать школу диверсантов численностью 2,5 тысячи курсантов для создания армейского спецназа в противовес дивизии имени Дзержинского в Балашихе, которая подчинялась МВД. Об организации школы знали только Жуков, начальник ГРУ Штеменко и начальник школы генерал Мамсуров.
Поэтому вскоре Хрущев, когда решил организовать заговор по отстранению от власти амбициозного и авторитетного маршала Жукова, то сначала сплотил вокруг себя руководство КГБ, аппарат ЦК, а руководство армии собрал в Киеве на учения под руководством Малиновского.
Тогда единственным, кто по спецсвязи оповестил о заговоре Жукова, находившегося в командировке в Югославии, был начальник ГРУ Штеменко. Естественно, что Малиновский после свержения Жукова стал министром обороны, а Штеменко был снят с должности начальника ГРУ.
В ЦК о школе диверсантов узнали от Мамсурова. Об этом доложили Хрущеву, который забеспокоился: зачем Жукову нужна школа диверсантов и не собирается ли он выступить в роли Наполеона? На пленуме Никита Сергеевич говорил: «Еще в октябре 1954 года маршал Малиновский предупреждал: надо внимательно следить за Жуковым — «растущим Бонапартом», опасным человеком, которого никто и ничего не остановит».
Это стало поводом, чтобы поскорее избавиться от Жукова, который много сделал для Хрущева, но слишком много знал и на многое был способен. Поэтому в сентября 1957 года министр обороны маршал Жуков на крейсере «Куйбышев» в сопровождение двух эсминцев Черноморского флота был направлен с дружественным визитом в Югославию и Албанию. Его на флоте, да и в армии не очень любили, потому что боялись.
Когда крейсер зашел в югославский порт Задар и маршал Жуков спустился по трапу в катер, помахав на прощание рукой, командир крейсера неожиданно получил по радио приказ Главного штаба ВМФ — следовать обратно в Севастополь.
В это время в Москве Хрущев созвал внеочередное заседание Президиума ЦК. Докладчиком он выбрал начальника Главного политического управления армии и флота генерал-полковника Желтова, который давно жаловался на министра в ЦК, обвиняя его в пренебрежении к политической работе. На Президиум ЦК пригласили также маршалов Малиновского и Конева.
Однако, когда Хрущев спросил у Конева: «Ваше мнение?», тот ответил: «Желтов сводит с Жуковым счеты». Малиновский согласился с Коневым. Однако выступавшие члены Президиума ЦК Суслов, Козлов, Брежнев и другие полностью поддержали Желтова и добавили, что маршал Жуков не оправдал надежд и доверия партии на высоком посту министра обороны. Поэтому Конев и Малиновский изменили свое мнение и присоединились к большинству.
Президиум ЦК принял решение провести в округах, на флотах, в гарнизонах собрания партийного актива, на которых подвергнуть критике всю деятельность министра обороны. Собрание партактива Минобороны и Московского гарнизона было созвано в Кремле. Докладчиком был Желтов. Затем с пространной речью выступил Хрущев.
Когда на следующий день после возвращения крейсера «Куйбышев» в Севастополь командира крейсера вызвали на собрание партактива в Дом офицеров флота, где всё фойе было в фотографиях Жукова на крейсере «Куйбышев», то приехавший на собрание первый секретарь ЦК Компартии Украины Кириченко приказал: «Убрать, и немедленно».
Все поняли, что случилось что-то важное. Кириченко говорил о недостатках партийно-политической работы в армии и на флоте и сделал ряд замечаний в адрес Жукова, не назвав его должность. Жуков еще был министром обороны, но после ухода крейсера связь с министром прервалась, и за рубежом он оказался в изоляции. Однако после звонка начальника ГРУ Штеменко Жуков немедленно вылетел на родину.
27 октября 1957 года, прилетевшему в Москву маршалу, на аэродроме сообщили, что его ждут в Кремле.
— Прямо сейчас ехать? — спросил Жуков.
— Да, прямо сейчас, — ответил ему работник ЦК Чернуха.
В Кремле Хрущев предложил ему доложить об итогах поездки, но его сообщение уже никого не интересовало. Никита Сергеевич сообщил, что за время его отсутствия произошли важные события — прошло собрание партийно-политического актива Минобороны. О его итогах сообщил Суслов. Затем выступили Козлов, Брежнев, Микоян, Игнатов, Фурцева и другие.
Министра обороны Жукова они обвинили в том, что он зазнался, недооценивает партийно-политическую работу в вооруженных силах и насаждает культ своей личности в армии.
В итоге Хрущев предложил освободить Жукова от обязанностей министра обороны и на этот пост назначить маршала Малиновского. Провести пленум ЦК, где обсудить деятельность министра обороны.
На Президиуме ЦК присутствовало 15 военачальников, которые в основном молчали. Поэтому на пленуме 28–29 октября Жуков оказался в полном одиночестве, никто не сказал доброго слова о его деятельности на посту министра обороны. Основными пунктами обвинений в адрес Жукова были: