В Париже принимает участие в газете «La Reforme» и составляет собственную программу борьбы за освобождение России и славянства. В 1847 году на банкете, устроенном в честь участников Польского восстания (1830–1831 гг.), произнес речь с резкими нападками на русское правительство.
В июне 1848 года принимает участие в Пражском народном восстании, а в мае 1849 года становится одним из руководителей восстания в Дрездене.
После подавления восстания приговорен Саксонским судом к смертной казни, которая была заменена пожизненным заключением. Вскоре саксонское правительство выдало его Австрии, и он был осужден еще раз на смертную казнь за участие в Пражском восстании, но и на этот раз смертную казнь заменили пожизненным заключением и выдали его России.
С 1851 по 1854 год отбывал заключение в Алексеевском равелине Петропавловской крепости, где написал по требованию императора Николая I «Исповедь», в которой изложил свои взгляды на революционное движение и славянский вопрос, после чего был переведен в Шлиссельбургскую крепость.
В 1857 году после семи лет заключения, уступая настойчивым хлопотам семьи Бакунина, Александр II перевел Бакунина на вечное поселение в Сибирь.
Сначала Михаил Бакунин поселился в Томске, где женился на дочери польского дворянина 18-летней Антонине Квятковской.
Осенью 1861 года через Японию и Америку бежал в Лондон, где был принят Герценом в состав издателей «Колокола».
В 1865–1866 годах написал свой программный документ — «Революционный катехизис», а в 1869 году перевел на русский язык «Манифест коммунистической партии» Карла Маркса и сблизился с явившимся за границу Нечаевым.
Участвовал в работе Интернационала и состоял в масонских ложах.
В 1874 году выпустил отдельной книгой самое значительное свое сочинение «Государственность и анархия. Борьба двух партий в интернациональном обществе рабочих».
Умер в Берне, в Швейцарии, в больнице для чернорабочих 1 июля (19 июня) 1876 года. Русских на его похоронах не было.
2 (15) апреля 1902 года, накануне своего дня рождения, одетый в адъютантскую форму, он приехал в Мариинский дворец, и произвел покушение на министра внутренних дел Д. С. Сипягина. От полученных смертельных ран министр через час скончался. На допросе Балмашев заявил: «Террористический способ борьбы я считаю бесчеловечным и жестоким, но он является неизбежным при современном режиме», — и от других показаний отказался. Военный суд приговорил его к смертной казни через повешение.
2 мая 1902 года С. В. Балмашева привезли в крепость и 3 (16) мая 1902 года повесили на малом дворе цитадели.
Батырша был арестован 8 августа 1756 года в деревне Азяково Осинской дороги и под усиленной охраной доставлен в Москву, затем в Санкт-Петербург. В ожидании приговора составил знаменитое письмо императрице Елизавете Петровне.
В декабре 1758 года приговорен к наказанию плетьми, вырыванию ноздрей и пожизненной каторге. Заточен в Шлиссельбургскую крепость.
24 июля 1762 года топором, забытым в его камере надзирателем, убил четырех охранников и погиб сам.