«Цель всех Вед — постичь Меня. Я — истинный составитель «Веданты» и знаток всех Вед».
Махапрабху принес высшую философию ачинтья-бхедабхеда-таттвы, философию одновременного тождества и отличия, в соответствии с которой индивидуальные души едины с Господом в качественом отношении, но различны в количественном, подобно капле морской воды и океану. Проповедуя, Шри Чайтанья опровергал монистическую философию майявады. Основная доктрина сознания Кришны заключается в том, что живое существо (джива) никогда не способно стать Богом.
Господь Чайтанья взял суть четырех главных философий, которые проповедовали приходившие до Него ачарьи-вайшнавы: Рамануджачарья, Мадхвачарья, Вишну Свами и Нимбарка. Из каждой из них Он заимствовал по две концепции. У Мадхвы Махапрабху позаимствовал полное опровержение философии майявады и почитание Божества Кришны как неотличного от Него Самого. От Рамануджи Господь Чайтанья взял доктрину чистой преданности, неоскверненной кармой и гьяной, а также важность служения вайшнавам. Из учения Вишну Свами Он позаимствовал умонастроение полной зависимости от Кришны и путь рага-бхакти, а от Нимбарки перенял необходимость принятия прибежища у Радхи и преклонение перед любовью гопи к Кришне.
Кроме того, Господь Чайтанья учил тому, что поклонения достоин не только Сам Кришна, но и Его святая обитель, Вриндаван. Он почитал «Шримад-Бхагаватам» как высшее ведическое писание. Махапрабху не просто говорил о необходимости признать существование Бога, понять Его величие и обращаться к Нему за благословениями. Он проповедовал, что высшей целью жизни является любовь к Богу, которая превосходит религиозные ритуалы, обретение богатства, чувственные наслаждения и даже освобождение из материального рабства. Высшим совершенством Гауранга провозгласил супружескую любовь гопи к Кришне. Чувства гопи к Кришне не следует путать с извращенными мирскими половыми отношениями. Отношения гопи и Кришны не только не аморальны, но являются вершиной духовного совершенства. До Господа Чайтаньи религиозные проповедники учили поклоняться Богу с почтением и благоговением, но Махапрабху раскрыл знание о сокровенной любви к Богу, которая лишена формальности.
Господь Чайтанья раскрыл знание о том, как Верховная Личность Бога, Кришна, сосет грудь матери Яшоды, играет на пастбищах Вриндавана и танцует с гопи. Подобные близкие отношения Господа и Его преданных непостижимы для обусловленных душ, и потому эти отношения не следует ни осуждать, ни имитировать. Однако по милости Махапрабху даже самые падшие души века Кали могут стать участниками сокровенных игр Кришны, встретиться с Ним лицом к лицу и наслаждаться вечным блаженством любовных отношений с Ним.
Господь Чайтанья был не просто философом, Он сделал любовь к Богу доступной для каждого. Он учил повторять святые имена Кришны в качестве наиболее эффективного метода самоосознания в современную эпоху и таким простым способом широко распространил сознание Кришны. Махапрабху предсказывал, что сознание Кришны распространится по всему миру. Он наказал Своим последователям стать гуру и повсеместно проповедовать учение Кришны.
Господь Чайтанья не написал ни одной книги. Он поручил это шести Госвами Вриндавана, среди которых своими произведениями особо отличились Рупа, Санатана и их племянник, Джива. Рупа Госвами написал многочисленные книги, среди которых наиболее известны: «Бхакти-расамрита-синдху», «Дана-кели-каумуди», «Хамсадута», «Лагху-бхагаватамрита», «Матхура-махатмья», «Падьявали», «Уддхава-сандеша», «Уджджвала-ниламани» и «Упадешамрита». В его пьесах «Лалита-мадхава» и «Видагдха-мадхава» описаны игры Кришны в Двараке и Вриндаване. Санатана Госвами является автором «Брихад-бхагаватамриты». Вместе с Гопал Бхаттой Госвами он написал «Хари-бхакти-виласу». Кроме того, Санатана Госвами составил комментарий к Десятой песни «Шримад-Бхагаватам», который называется «Дашама-типпани». В своих шести «Шат-сандарбхах» Джива Госвами сделал подробный обзор философии Гаудия вайшнавов, а в «Гопала-чампу» описал игры Кришны.
Последующие поколения преданных написали многочисленные книги, в которых подробно проанализировали и систематически описали философию, практику, а также уровни сознания Кришны. Таким образом учение Господа Чайтаньи распространилось по всей Индии. В наше время Шрила Прабхупада написал более шестидесяти книг, изложив философию Шри Чайтаньи в простой и доступной форме. Его книги пользуются популярностью как среди ученых, так и среди людей неискушенных.
Чайтанья Махапрабху проповедовал, что осознать Бога можно, постоянно повторяя Его святые имена, и особенно маха-мантру: