Японская кораблестроительная программа предусматривала постройку 4 броненосцев, 6 броненосных и 6 бронепалубных крейсеров, 3 минных крейсеров, 11 эскадренных миноносцев и 89 миноносцев. Программа предусматривала также развитие средств военных портов Сасебо, Куре, Йокосука, создание нового военного порта Майд-зуру, становление отечественной базы военного кораблестроения, основание самостоятельного производства брони, вооружения и боеприпасов.
Сведения об этих военных приготовлениях не могли не встревожить официальный Санкт-Петербург, ведь усиление японских вооруженных сил и агрессивные планы Японии в отношении Кореи и Китая непосредственно угрожали дальневосточным владениям России. Кроме того, Николай II и сам стремился к активной политике на Тихом океане. Император весьма сочувственно отнесся к мыслям о выходе России к "незамерзающим берегам" Тихого океана и основанию там торгового порта и военно-морской базы. Поэтому помимо уже запланированных к строительству кораблей в 1898 году была принята особая кораблестроительная программа "Для нужд Дальнего Востока", по которой предстояло построить 5 эскадренных броненосцев, 5 крейсеров и другие корабли. Фактически предполагалось создание на Дальнем Востоке третьего полноценного флота, а не эскадры переменного состава.
Пятнадцатого марта того же года в Пекине была подписана конвенция о согласии китайского императора "предоставить России в арендное пользование Порт-Артур и Талиенван вместе с прилегающим к этим портам водным пространством". Срок аренды устанавливался в 25 лет, на которые под юрисдикцию России отходила вся южная часть Квантунского (Ляодунского) полуострова "…в видах обеспечивания для русских военно-морских сил вполне надежной опоры на побережье Северного Китая".
Морское ведомство рассматривало флот в Тихом океане как фактор, удерживающий Японию от нападения, а не как силу, способную нанести поражение ее флоту. В результате важнейший принцип стратегии, требующий сосредоточения максимальных средств на театре военных действий, оказался в забвении. Решающая роль флота в возможной войне с Японией была очевидна для руководителей Морского министерства задолго до ее начала. Тем не менее планируемый состав Российского флота в Тихом океане даже к 1905 году не обеспечивал хотя бы незначительного превосходства над противником. Само сосредоточение этого флота в водах Дальнего Востока было поставлено в зависимость от сметы на заграничное плавание, а не от политического положения или наличия корабельного состава. Именно поэтому Япония все время опережала Россию в наращивании своих военно-морских сил на Дальнем Востоке. Именно поэтому она и начала подготовку к внезапному удару.
В начале 1904 года вероломным нападением японских миноносцев на Порт-Артур началась Русско-японская война. Прошло еще немного времени, и вице-адмирал Макаров был назначен командующим Тихоокеанской эскадрой. Вместе с собой он забирал в Артур ряд наиболее подготовленных офицеров. Хотел взять и Владимира Николаевича, но этому воспротивился Рожественский.
— Степан Осипович, — просил вице-адмирала, немного заикаясь от волнения, Миклуха, — готов хоть вахтенным начальником на последний миноносец! Я же дальневосточные моря как свои пять пальцев знаю!
— Что я могу сделать, дорогой Владимир Николаевич! — вздыхал Макаров. — Я и сам прекрасно понимаю всю глупость положения. Но что делать, если Рожественский имеет на вас столь большой зуб! Впрочем, по приезде в Артур попытаюсь вызвать вас туда телеграммой! А теперь прощайте, у меня утром поезд. Надеюсь, что свидимся!
Слово свое вице-адмирал сдержал. Сразу же по прибытии в Порт-Артур направил в Санкт-Петербург телеграмму: в связи с напряженным положением в крепости он требовал незамедлительной отправки к нему капитана 1-го ранга Миклухи как наиболее подготовленного офицера для назначения на должность капитана артурского порта. Но вновь вмешался старый недруг Миклухи — контр-адмирал Рожественский. Без особых объяснений он немедленно отправил ответ Макарову. Это была телеграмма № 1559 от 23 мая 1904 года. Содержание ее было весьма лаконично: "Миклуха капитаном порта назначен быть не может". Но Макаров уже не получил ее: на входе в Порт-Артурскую гавань его флагманский броненосец "Петропавловск" подорвался на японской мине и затонул. Вместе с вице-адмиралом Макаровым погибла почти вся команда и командование эскадрой.
А на Балтике полным ходом шло снаряжение на Дальний Восток 2-й Тихоокеанской эскадры. Император назначил на должность ее командующего Рожественского, с присвоением чина вице-адмирала, и предложил включить в состав эскадры и все три броненосца береговой обороны типа "Адмирал Ушаков". Но Рожественский ответил резонно:
— Зачем мне эти самотопы, ведь эскадре предстоит идти через три океана! Что я там с ними делать буду, какие берега охранять?
И затея была оставлена.