Фриц Габер и Рихард Вильштеттер были назначены содиректорами Института физической химии и электрохимии Общества кайзера Вильгельма в Берлине. Основной задачей института, было проведение научных работ в интересах национальной химической промышленности. Как мы уже знаем, работы эти были двойного назначения. Габер твёрдо верил в правоту националистической идеологии германского правительства. Сейчас это звучит как курьёз: еврей, твёрдо верящий в националистическую идеологию Германии. Но так было. Время, когда степень преданности нации станут определять по цвету глаз ещё не пришло. «В мирное время ученый принадлежит миру, но во время войны он принадлежит своей стране».
В 1907 году на международной конференции в Гааге представители крупнейших держав мира, включая Германию, подписали конвенцию, запрещающую применение химического оружия в войне. Как известно, чем сильнее держава, тем меньше её «юридически обязывают» разного рода международные конвенции и соглашения. Тем не менее, ни Германский Генштаб, ни Антанта поначалу не собирались их нарушать. С началом позиционной войны перед штабами встала проблема выцарапывания вражеских солдат из окопов и блиндажей. Дивизионные пушки и пулемёты в клочья рвали наступающие полки, но ничего не могли поделать с окопавшимся взводом. Для выкуривания противника из окопов французы применяли 26-мм ружейные гранаты со слезоточивым бромацетоном.
Германский генштаб потребовали от химиков разработать эффективное вещество раздражающего действия, которое заставляло бы солдат противника покидать траншеи. Коллектив Института физической химии и электрохимии под руководством Габера взялся за работу. Первые опыты по применению боевого химического вещества в виде так называемого «снаряда № 2» (10,5-см шрапнель с заменой в ней черного пороха сернокислым дианизидином) были произведены германцами в октябре 1914 г. 27 октября этот снаряд был применен на западноевропейском театре в атаке на Нев-Шапель. По противнику выпустили 3000 химических снарядов. Хотя их раздражающее действие оказалось невелико, но, по германским данным, применение нового оружия облегчило взятие Нев-Шапеля. В дальнейшем снаряд был снят с вооружения.
Сразу после начала войны немецкие химики проводили опыты с окисью какодила и с фосгеном. Опыты были вскоре прекращены после взрыва в лаборатории. Учёные решили не мучиться с разработкой новой рецептуры, а предложили выпускать на вражеские позиции дешёвое и распространённое химическое сырьё – хлор. Поскольку аналогичный газ вполне мог применяться против немецких войск, немцы занялись разработкой противогазов с абсорбирующим фильтром. И тоже под руководством Габера!
В своих работах с ядовитыми газами, Габер отметил, что длительное воздействие низких концентраций на человека имеет тот же эффект, что и воздействие высоких концентраций, но в течение короткого времени. Он сформулировал простое математическое соотношение между концентрацией газа и необходимым временем воздействия. Сотрудникам МЧС и офицерам химбатов это соотношение известно как правило Габера.
Габер разработал способ боевого применения хлора и был руководителем химической службы немецких войск. Габер сам учил бойцов газового подразделения как пользоваться газовыми баллонами.
С начала 1915 года германское командование во главе с герцогом Альбрехтом Вюртембергским готовило операцию по прорыву вражеского фронта под бельгийским городком Ипр. XV корпус германской армии должен был нанести удар в стык между 2-й английской армией и 20-м французским корпусом. Задолго до начала развёртывания войск немцы приступили к подготовке химической атаки. Операцией руководил Фриц Габер. С февраля по март на участке фронта шириной в 6 км были установлены газобаллонные батареи, по 20 газобаллонов в каждой. Всего потребовалось 6000 баллонов, из которых половина коммерческого образца была реквизирована. В добавление к ним было приготовлено 24 000 новых баллонов половинного объема. Всего для заправки баллонов использовали 180 тонн хлора. Для защиты от артиллерийского огня баллоны укрывали в специальных траншеях.
К 10 марта подготовка газовой атаки была завершена. Время атаки постоянно откладывалось в ожидании необходимых и юго-западного июжного ветров. В течение этого периода некоторые газовые баллоны были повреждены случайными попаданиями артиллерийских снарядов. Наконец, 22 апреля в 17 ч (по англ. времени) химики атаковали. Выход газовой волны продолжался 5 мин. Действия на флангах усиливались стрельбой химическими снарядами.
22 апреля была прекрасная утренняя заря. Наблюдатели союзников заметили некоторое оживление за линией фронта. Германская артиллерия молчала. В 17.00 с наблюдательных пунктов увидели два необычных зеленовато-желтых облака. Распространяясь в сторону, эти газовые облака поднялись кверху и, продвигаемые вперед легким ветром, становились голубовато-белым туманом, таким, какой можно видеть над мокрым лугом в морозную ночь.