В марксистское обществоведение Скворцов-Степанов вошел как один из лучших знатоков научного коммунизма, талантливейший теоретик большевистской партии, крупный исследователь истории революционного движения и классовой борьбы, блестящий знаток вопросов научного атеизма. По справедливому замечанию Н. А. Семашко, он «принадлежал к числу самых образованных марксистов современности». Многолетняя революционная деятельность не только не помешала ему стать видным ученым, теоретиком. Напротив, она вдохновила Скворцова-Степанова на творчество, наполнив его произведения глубоким и ярким содержанием.
Велики заслуги Ивана Ивановича Скворцова-Степанова в развитии и защите идейной чистоты марксистско-ленинской теории. С момента создания Социалистической академии он уже в качестве ее действительного члена сделал очень много для научной пропаганды учения Маркса — Энгельса — Ленина, подготовки марксистских кадров обществоведов.
Скворцов-Степанов входил в инициативную группу по созданию на основе решения Пленума ЦК РКП(б) от 8 декабря 1920 года первого в мире Музея по марксизму, который через месяц (И января) был преобразован в Институт К. Маркса и Ф. Энгельса. Под руководством В. И. Ленина Иван Иванович вместе с В. В. Адоратским, М. Н. Покровским, Ф. А. Ротштейном, В. А. Невским и другими много приложил усилий в деле становления этого первого научного центра по марксоведению.
Когда в первой половине 20-х годов возникла необходимость создания нового центра по изучению, сбору и хранению выдающегося теоретического наследия В. И. Ленина, Иван Иванович также был в числе инициаторов этой идеи, с которой выступили коммунисты Москвы. В течение нескольких месяцев (до создания 28 октября 1923 года Института В. И. Ленина при ЦК партии) при МК РКП(б) работал институт, носивший имя вождя Октябрьской революции. Официально Институт В. И. Ленина как центр всесоюзного характера был открыт 31 мая 1924 года по решению XIII съезда РКП(б). С 1926 года Скворцов-Степанов — директор Института В. И. Ленина и остался им после слияния двух научно-партийных учреждений — Истпарта и Института В. И. Ленина в одно — Институт В. И. Ленина при ЦК ВКП(б).
Работе по собиранию, хранению и изучению великого теоретического наследия В. И. Ленина Иван Иванович отдавался с особой страстью. Он считал первейшей обязанностью института, носящего имя вождя Великого Октября, исследование и пропаганду ленинского учения и сам показывал в этом деле великолепный пример. Поистине исторической заслугой Скворцова-Степанова является организация сбора рукописей Владимира Ильича, переписки с ним его соратников, выявление важных фактических данных из богатейшей ленинской биографии. Иван Иванович выступил одним из первых авторов научных трудов, составивших впоследствии обширную Лениниану, а стал одним из первых историков партии большевиков.
Под руководством Скворцова-Степанова началась подготовка ко второму изданию Собрания сочинений В. И. Ленина. При этом Иван Иванович широко использует свой опыт во время подготовки первого издания сочинений, которое выпускалось под его редакцией совместно с В. Д. Бонч-Бруевичем, М. С. Ольминским и другими. Всю эту многогранную работу Института В. И. Ленина при ЦК ВКП(б) Скворцов-Степанов рассматривал как мощный фундамент в борьбе за идейную сплоченность партийных рядов. Придавая огромное значение выпуску ленинских трудов в условиях исключительно напряженной деятельности Центрального Комитета ВКП(б) по обеспечению единства партии, Скворцов-Степанов в записке М. С. Ольминскому писал: «Я сознаю всю ответственность редактирования сочинений Владимира Ильича и отношусь к этому делу с величайшей внимательностью». Собрание сочинений, заявил Иван Иванович на вечере памяти В. И. Ленина, даст ценнейший материал для истории ВКП(б) и для истории русской общественной мысли вообще, для науки об обществе. «Ознакомление с методом работы Владимира Ильича, — подчеркнул он, — будет иметь большое педагогическое и дидактическое значение для всех научных исследователей, для всех научных работников».
Трудно переоценить предпринятое издание Институтом В. И. Ленина «Ленинских сборников», перевод важнейших произведений Владимира Ильича Ленина на иностранные языки и языки народов СССР. В «Записках Института В. И. Ленина», которые стали выходить шире, чем раньше, печатались (наряду со статьями научного характера) воспоминания и библиографические заметки. Работу научного коллектива в институте непосредственно направлял его директор Скворцов-Степанов, прекрасно понимавший историческое значение выполняемых исследований и публикаций. «Это дело, которому почетно отдать все силы, все знания, все, чем наградила вас природа», — любил говорить Иван Иванович и сам следовал этому правилу до последнего вздоха.