По решению правительства вскоре был учрежден рассчитанный на пропагандистов и широкие массы журнал «Революция и церковь». Сотрудничество в нем Иван Иванович считал своим партийным долгом. Коммунизму, как подчеркнул Скворцов-Степанов в статье «Религия и общественный строй», помещенной в журнале, не нужны религиозные постулаты. Высшим его существом будет сам Человек, строитель нового мира. На конкретных примерах из истории автор показал, как церковь на всех этапах развития человечества оказывала услугу имущим слоям, укрощая массы, держа их в повиновении. Теперь этому пришел конец.
На погромные антисоветские проповеди церковников, активно сопротивлявшихся мерам рабоче-крестьянского правительства, Скворцов-Степанов ответил целой серией ярких и страстных антирелигиозных статей: «Новое послание первосвященника Тихона», «Сбавили тону», «Благословения», «Проклятие», которые вошли в брошюру «Религия, духовенство, его доходы, его проклятия и благословения», вышедшую в 1918 году. Как отмечал М. С. Ольминский в «Правде», «это на редкость интересная, увлекательная книжка. В самых простых словах автор рассказывает, какую роль играет духовенство в воспитательной и политической жизни страны». Он рекомендовал всем прочесть работу Ивана Ивановича: «И прочтет ее с интересом даже человек, давно усвоивший правильный взгляд на религию и духовенство. Эта книжка обязательно должна иметься в каждой — даже небольшой — рабочей, крестьянской и красноармейской библиотеке».
В своем послании о Брестском мире от 2 марта 1918 года патриарх Тихон, предвкушая, как ему казалось, победу германских оккупантов и карателей, призывал «подчиниться мечу Вильгельма Второго». Иван Иванович дал уничтожающий ответ на этот враждебный выпад. Первосвященник Тихон хочет убить у бедноты всякое помышление о том, что общество можно устроить по-другому, отметил он. Подобно Тихону, украинские первосвященники не нашли ободряющих слов для восставших против захватчиков крестьян, а скорее всего призовут их покорно принять германское нашествие как «выражение гнева божия и покорно склонить перед ними свою волю».
Создавая статьи-памфлеты на антирелигиозную тему, Иван Иванович стремился дать в них ответ на обычный вопрос, мучивший верующих: почему в первые послеоктябрьские годы православная и другие церкви страны заняли антисоветскую позицию, стали «по другую сторону баррикад»? И делал это блестяще. Недаром его выступления, печатные работы за короткий срок приобрели широчайшую популярность и авторитет среди пропагандистов и в читательской массе. И недаром именно его выдвинули общественным обвинителем на судебном процессе над патриархом Тихоном.
Конечно, больше всего верующих находилось в деревне, в массе своей неграмотной. Учитывая это, Иван Иванович ряд работ посвятил специально атеистическим беседам с крестьянами. В трех номерах газеты «Правда» за декабрь 1919 года он публикуют статью «Житие чудотворца Николая». Это была талантливая, по общему признанию, чрезвычайно своевременная публикация, в которой очень нуждались сельские антирелигиозники: в тот период число почитателей этого «чудотворца» среди деревенского населения было весьма велико. Спокойный, доверительный тон статьи, неоспоримые факты, четкая логика его суждений заставляли задумываться заблуждавшихся, ставили в тупик «церковных агитаторов». По признанию самого Скворцова-Степанова, в первые послеоктябрьские годы «профессия антирелигиозника» сделалась для него почти что «главной профессией».
А когда Иван Иванович закончил свой труд по электрификации, Владимир Ильич в своем письме автору предложил: «…Напишите еще (отдохнув сначала,
Неотложность этого поручения диктовалась тем, что церковная агитация в те годы приобрела внушительные размеры.