Он родился в 1875 году в маленьком немецком городке Кайзерсберг (Верхний Эльзас) в многодетной семье бедного протестантского пастора. В младенчестве Альберт был настолько хилым ребёнком, что родители часто тревожились за его жизнь. Но, как оказалось впоследствии, несмотря на невероятное самоотречение и работу сверх всяких человеческих сил в течение многих десятков лет (а, может быть, как раз именно благодаря этому) он прожил девяносто лет, а ведь это удаётся лишь немногим, тем более мужчинам, чья продолжительность жизни значительно меньше, чем у женщин! Видимо, так получилось именно потому, что он не щадил себя, изнурительный (но добровольный и вдохновенный!) труд закалил его организм, приучил работать в постоянном напряжении, можно сказать, "гореть", что и послужило причиной такого удивительного долголетия. Этому же, конечно, очень помогло также и то, что Швейцер был счастливым человеком, который прожил жизнь так, как хотел - в соответствии со своими желаниями, мечтами и идеалами. И, главное, не столько для себя, сколько для других людей - самых бедных, несчастных и обездоленных.
Альберт был замкнутым, застенчивым мальчиком, который больше всего на свете любил природу, животных и музыку. Учился он далеко не блестяще. В 1893 году поступил в Страсбургский университет, где занимался одновременно на двух факультетах - теологическом и философском. Параллельно с обучением в университете периодически брал уроки игры на органе в Париже, где его согласился обучать известный органист Видор, удивлённый необыкновенным музыкальным талантом скромного провинциального юноши.
Вот как описывает студенческие годы Швейцера писатель Пауль Герберт Фрайер в своей книге, посвящённой этому Праведнику Мира:
В своей автобиографии сам Швейцер писал позднее:
Когда Швейцер наметил для себя такую жизненную программу, ему был всего 21 год и он, конечно, не представлял себе конкретно, чем будет заниматься после достижения тридцатилетнего рубежа. Самым же удивительным оказалось то, что этот внутренний порыв молодого человека не угас в нём с годами и его осуществлению Швейцер затем посвятил многие десятки лет. И именно это осуществление мечты сделало его счастливым.
Швейцер был очень талантлив, причём - сразу в нескольких, самых разных областях. Прежде всего - как выдающийся органист, дававший концерты в странах Европы. У его современников органные концерты Швейцера многие годы и даже десятилетия имели огромный успех. При этом надо сказать, что он был ещё и прекрасным пианистом.