В итоге несколько поляков решили попросту сбежать к тому, кто вновь назвался Дмитрием. Вскоре выяснилось, что и стрельцы-охранники стали оставлять свою службу и отбывать в неизвестном направлении. Все это привело Марину и ее родственников в напряженное состояние. Сами они бежать не решалась, поскольку боялись заплутать в занесенных снегом бескрайних русских лесах. Кроме того, внушало опасение и состояние здоровья Юрия Мнишека. От плохого питания и жизненных невзгод он постоянно прибаливал. К Рождеству среди поляков уже почти не осталось ни одного здорового человека. У кого была высокая температура, у кого болело горло, некоторых мучил сильный кашель. Виной были холода, промерзлые, плохо отапливаемые дома и отсутствие добротной пищи. Марине даже стало казаться, что Господь специально наказывает ее за прошлую любовь к роскоши, чванство и желание возвыситься любым путем.
Новый год, 1607-й, Марина, ее родственники и свита встретили голодными и больными. Все понимали, что следовало бороться за свою жизнь. Многие предложили покинуть Ярославль и добраться до войска нового самозванца. Однако Юрий Мнишек заявил, что бегство может еще больше ухудшить их положение. Вскоре оказалось, что он был прав. Противники царя Василия Шуйского во главе с И. Болотниковым были разбиты под Москвой и отошли к Калуге. Там их вновь окружили правительственные войска. Из столицы прискакал гонец с известием, что на радостях царь решил оказать милость пленникам: приказал не отбирать у них оружие, распорядился построить для них новый, более удобный двор и разрешил написать письма в Польшу.
17 января состоялось новоселье. Новый двор был очень обширным и вместил сразу 300 человек. Марина смогла наконец-то расселить своих фрейлин с большим комфортом. У каждой появились свои покои и помещение для слуг. Удручало только скудное питание. Были дни, когда кроме хлеба и пива ничего не давали. Только в самом конце января рацион стал более разнообразным, с мясом, молоком, яйцами и овощами. По этому случаю для всех был устроен праздничный обед. Впервые за много дней пленники почувствовали себя сытыми. У шляхтичей сразу поднялся боевой дух, и они начали планировать побег к новому Лжедмитрию. Однако их замысел стал известен приставам, и бегство не состоялось.
Безделье и неопределенность положения привели к тому, что многие бравые вояки впали в беспробудное пьянство. Разгоряченные напитками, они устраивали драки с местными жителями по самому незначительному поводу. Марину и ее отца это очень обеспокоило, поскольку ярославцы могли взяться за оружие и отомстить за все обиды. Пришлось в воротах двора установить караул из боеспособных слуг. Приставы, недовольные буйным поведением поляков, стали наказывать пленников голодом. Это приводило к тому, что за кусок хлеба многие отдавали последнюю одежду. Марине же с отцом и родственниками приходилось продавать столовое серебро, которое местные купцы брали за бесценок. Тогда Юрий Мнишек заявил городским. властям, что если они будут морить их голодом, то все поляки погибнут и за это придется держать ответ перед царем.
Вскоре из Москвы прибыл окольничий М. М. Салтыков и навел порядок. Часть пленников была отправлена в Москву с тем, чтобы оттуда вернуться на родину, часть поехала в Вологду. Остальным выплатили все долги по питанию, сверх того дали 470 ведер пива и 17 ведер водки. По этому случаю во дворе Юрия Мнишека был устроен настоящий праздник. Радовали и тайные известия, приходящие из разных мест, о том, что «царь Дмитрий» жив и вновь готов бороться за свой престол. У Марины после таких новостей сразу поднималось настроение и даже хотелось петь и танцевать. Конечно, в глубине души она не верила, что ее муж жив, но надеяться на чудо все же хотелось.
В начале мая пришлось отметить сразу три когда-то счастливых, а теперь печальных события в судьбе бывшей царицы: торжественный въезд в Москву, венчание на царство и свадьбу. Казалось, что все это было давным-давно, в какой-то другой, навсегда ушедшей жизни. Лето прошло в тревожных ожиданиях вестей из столицы и-с полей сражения. Всех интересовал исход борьбы Василия Шуйского с новым претендентом на роль Дмитрия. Правда, как потом выяснилось, самого самозванца не было в армии. За него сражались Иван Болотников и некий «царевич Петруша», якобы сын царя Федора Ивановича. Но утомленные ярославской ссылкой поляки были готовы перейти на сторону даже отъявленного мошенника, лишь бы обрести свободу.