Особенно большую помощь стал оказывать Кузьма Минин, который организовал сбор «третьей деньги», третьей части всего имущества, и добровольных пожертвований. Вскоре в Нижний Новгород стали прибывать воинские люди. Из Арзамаса пришли смоляне, которые бежали туда после захвата Смоленска Сигизмундом. К ним присоединились дорогобужане, вязьмичи, балахнинцы, гороховчане. Сначала общая численность составляла только 3000 человек.
В марте 1612 года ополченцы отправились в Ярославль, где было собрано много орудий и провианта из северных городов. Туда прибыло подкрепление из Касимова, Темникова, Кадома, Алатыри. Всего войско достигло 10 000 человек. Во главе его стало временное правительство — «Совет всей земли». Титул Пожарского звучал так: «По избранию всея земли Московского государства всяких чинов людей у ратных и земских дел стольник и воевода князь Дмитрий Михайлович Пожарский».
Для Пожарского вопрос о новом государе также играл большое значение, но признавать истинность Лжедмитрия III он не был намерен. Поэтому он вступил в переговоры с новгородцами о кандидатуре Карла-Филиппа. Князь Дмитрий, как когда-то Ляпунов, надеялся на шведскую помощь в борьбе с поляками. Но достигнуть договоренности не удалось. В июле, получив тревожные известия из подмосковного стана, следовало быстрым темпом идти к Москве для сражений с Хоткевичем.
После поимки наемных убийц, подосланных Заруцким, Пожарский с подозрением стал относиться к представителям Первого ополчения. Поэтому он отказался расположиться в одном стане с Трубецким и сначала не приглашал того на военный совет. Но совместная борьба сблизила полководцев. Они вскоре поняли, что действуют во имя общей цели — освобождения страны от интервентов. Современники заметили перемены в отношениях между князьями и написали в своих воспоминаниях так: «Стали в одиночестве поступать и Российскому государству во всем добра хотеть безо всякой хитрости». Ведь в целом оба воеводы были честными и порядочными людьми, остро воспринимавшими все проблемы, стоящие перед Русским государством.
После окончательного взятия Кремля Пожарский и Трубецкой начали рассылать по стране грамоты с просьбой присылать на Земский собор выборщиков. Но только к февралю 1613 года их собралось достаточное количество. Некоторые современники полагали, что Д. М. Пожарский надеялся, что именно его изберут новым государем. Он даже устраивал для всего воинства пиры, желая всем понравиться. Но выбор пал не на него. Для русской знати князь был слишком худороден, и его воцарение внесло бы сумятицу в иерархические отношения.
Подобно Трубецкому, Пожарский со смирением воспринял мнение большинства и одним из первых целовал крест новому царю Михаилу Федоровичу Романову. Не возражал он и против того, что вскоре от ополченцев власть перешла боярскому правительству во главе с возвращенным в столицу Ф. И. Мстиславским. Такова была воля молодого царя, больше доверявшего высшей знати, чем воеводам-освободителям.
Выше уже отмечалось, что Михаил Федорович наградил князя Дмитрия Михайловича боярством и поручил держать яблоко (державу) во время своего венчания на царство. Но в первые годы его правления Пожарскому пришлось вынести немало унижений: Г. Г. Пушкин отказался «сказывать ему боярство»; казначей Н. В. Траханиотов возмутился тем, что не ему было доварено нести яблоко, наконец, по приказу царя ему пришлось самому «сказывать боярство» царскому двоюродному брату Б. М. Салтыкову, родственнику всем известного изменника М. Г. Салтыкова, бежавшего к польскому королю.
Дмитрий Михайлович не обижался и продолжал мужественно сражаться на полях сражений. В 1615 году он громил поляков под Оршей, в 1617 остановил у Можайска полки польского королевича Владислава. Потом он отбивал его атаки от московских Арбатских ворот. Во время проектируемой в начале 30-х годов войны с Польшей за Смоленск планировалось назначить главнокомандующим именно Д. М. Пожарского. Но из-за плохого здоровья он отказался. Для русской армии это стало большим ударом. Старый и упрямый М. Б. Шеин бездарно проиграл всю кампанию и капитулировал перед королевичем Владиславом.
Перейдя на гражданскую службу, Пожарский возглавлял разные приказы: Ямской, Разбойный, Московский судный, был воеводой Новгорода, собирал «пятую деньгу». При дворе он был на почетном месте. После смерти первой жены князь женился на дочери А. И. Голицына. В Медведкове построил красивый дом и шатровую церковь. На Красной площади он возвел храм в честь иконы Казанской Богоматери. Он покровительствовал иконописцам, книжникам, актерам-скоморохам, которых даже называли «людьми Пожарского».
Многие современники очень уважали князя Дмитрия Михайловича и отзывались о нам так: «Всегда против супостатов лица своего не щадит». Он скончался 20 апреля 1642 года, постригшись перед смертью под именем своего верного соратника Кузьмы. В этот день вся Москва была в трауре. Царь Михаил Федорович пешком проводил гроб полководца до ворот города — его отвезли в родовую усыпальницу в Спасо-Евфимиев монастырь.