Едва оправившись от первого шока, Марфа взяла перо и написала родственнику грамоту. В ней она прямо заявила, что ни у нее, ни у сына никогда и в мыслях не было думать о царском престоле. Сама она всегда советовала юному Михаилу держаться подальше от политических баталий и не стремиться к власти. Ведь хорошо известно, что люди Московского государства неверны своему слову и, поцеловав крест одному государю, тут же готовы изменить ему ради другого. В качестве примера она напомнила, как все сначала поклялись верно служить сыну царя Бориса Федору, а потом ему изменили и отъехали к вору Гришке Расстриге. Но и на этом не успокоились: Гришку Отрепьева убили и сожгли, выбрали государем Василия Шуйского, но и тому изменили ради Тушинского вора. В заключение Марфа задала риторический вопрос:
«Видя такое прежним государям крестопреступление, позор, убийство и поругание, как же стать государем моему сыну, не царского рода, юному и неопытному?» И сама же на него ответила: «Ни за что не соглашусь на избрание Михаила новым царем».
После письма Шереметева Марфа поняла, что жизнь ее сына вновь находится в опасности. С ним могли расправиться менее удачливые претенденты на трон, а также польский король Сигизмунд, чтобы убрать соперника королевича Владислава. В этих условиях ей показалось, что даже в Костроме жить небезопасно. Более надежным убежищем показался Ипатьевский монастырь с толстыми крепостными стенами. Туда она вскоре и перебралась вместе с Михаилом. По иронии судьбы убежищем Романовых стала обитель, отстроенная на пожертвования Годуновых. В 1586 году Борис Федорович с дядей Дмитрием Ивановичем построили вокруг Ипатьевского монастыря святые врата и возвели каменную ограду. В итоге он превратился в мощную крепость с четырьмя угловыми башнями и тремя въездными воротами.
Марфа и Михаил поселились в каменном двухэтажном здании, носившем название «наместнический корпус». (Он предназначался для заместителя архимандрита.) В нижнем этаже разместились слуги. Марфа расположилась в правой верхней половине, Михаил — в левой. Подняться в их покои можно было по широкой наружной лестнице. У Марфы были четыре небольшие проходные комнаты с выходом на деревянные стены и нижнее помещение для слуг. Туда она спускалась, когда следовало отдать распоряжения по хозяйству. Комнаты Михаила выходили на открытую галерею, где можно было прогуливаться в хорошую погоду. Но в целом их покои были очень маленькие и полутемные, поскольку окошечки напоминали бойницы.
В конце февраля в Кострому прискакал столичный гонец и сообщил, что 21 февраля на Земском соборе Михаил Федорович Романов единогласно избран новым царем. Основанием для этого послужило кровное родство с угасшей династией (царю Федору Ивановичу Михаил приходился двоюродным племянником). Кроме того, нареченный царь молод и, по мнению избирателей, может основать династию, в период Смуты он ничем себя не запятнал, находится в родственных связях с очень многими знатными родами: Мстиславскими, Шуйскими, Ростовскими, Оболенскими, Черкасскими, Сицкими, Голицыными, Троекуровыми, боярами Салтыковыми-Морозовыми и другими. Его избрание не нарушало сложившуюся при дворе иерархию и могло принести долгожданный мир измученной в междоусобных баталиях стране. Так думали участники Земского собора.
Когда Марфа узнала, что ее мнение было проигнорировано и теперь ее единственный сын становится объектом нападок менее удачливых претендентов на трон, то не смогла удержаться от горьких слез. Что сулил Михаилу царский престол? Лишь беды и несчастья. Казна разграблена, дворец разрушен, верного войска и элементарной охраны нет. Со всех сторон грозили враги: король Сигизмунд с Владиславом, шведский король Густав с Карлом-Филиппом, а также
Путь к престолу
Тем временем в Москве решали вопрос о том, как уговорить Марфу Ивановну благословить сына на царство и заставить Михаила Федоровича принять царский венец. От Ф. И. Шереметева было известно, что посланцев, скорее всего, ждет отказ. На общем совете постановили отправить в Кострому представительное посольство во главе с самим боярином Ф. И. Шереметевым, рязанским архиепископом Феодоритом и рядом других уважаемых лиц. Для них был составлен обстоятельный наказ, в котором излагались контраргументы на возражения Марфы и Михаила.