Постепенно проходило расширение структуры и повышение статуса органов афганской военной контрразведки. В 1983 г. их структура полностью повторяла советскую. Она включала в себя ГУВКР, управления (отделы) контрразведки по МВД, пограничным войскам. ВВС и ПВО. национальной гвардии, штабу тыла афганских вооруженных сил, военно-учебным заведениям. Управление контрразведки по МВД было создано в декабре 1983 г. и включало в себя 11 отделов, 2 отделения, 4 группы, 8 зональных отделов (корпусного штата) и 26 отделов контрразведки по провинциальным подразделениям органов внутренних дел. В Кабуле размещались четыре отдела контрразведки: 1-й отдел управления контрразведки (контрразведывательное обеспечение центрального аппарат МВД ДРА); отдел контрразведки по управлению МВД Кабула; отдел контрразведки по управлению безопасности МВД; отдел контрразведки по подразделениям МВД зоны «Центр». Подразделения главного управления военной контрразведки вели контрразведывательную работу в генеральном штабе вооруженных сил ДРА, в управлениях и отделах министерства обороны ДРА, оказывали помощь периферийным органам военной контрразведки, обобщали и распространяли положительный опыт деятельности военной контрразведки, вели разведку, расследовали уголовные дел на военнослужащих вооруженных сил ДР А. В армейских корпусах, пехотных дивизиях, отдельных бригадах (артиллерийской, танковой, десантно-штурмовых, пограничных и т. д.), гарнизонах были самостоятельные отделы военной контрразведки, подчинявшиеся ГУВКР. предназначенные для контрразведывательной защиты соответствующих частей и соединений афганских вооруженных сил.
В августе 1983 г. афганской военной контрразведкой при участии сотрудников 3-го отдела Представительства КГБ СССР в Афганистане и 00 КГБ по 40-й армии была пресечена разведывательная деятельность группы агентов иранской военной разведки, действовавшей на авиабазе Шиндант (8 офицеров и одного гражданского служащего, осуществлявшего нелегальные переходы в Иран и передававшего разведывательную информацию сотрудникам иранских спецслужб). Арестованные афганские офицеры, проходя службу на авиабазе Шиндант, собирали сведения о наличии на аэродроме советских и афганских самолетов и вертолетов, системе охраны и обороны аэродрома, участии советских военнослужащих в боевых операциях и потерях, размещении советских воинских подразделений в районе аэродрома, организации их водоснабжения. Они похищали у афганских военных летчиков топографические карты Афганистана и приграничных районов СССР. При аресте у афганских офицеров было изъято 40 листов топографических карт советского производства. У агента-связного муллы Абделя Насира — схема аэродрома Шиндант, составленная для спецслужб Ирана офицерами Голем Мохаммадом и Даулятом Мохаммадом с указанием на ней военных самолетов, вертолетов, системы охраны и обороны[414]
.16 апреля 1986 г. в результате опроса местных жителей советником отдела военной контрразведки по 7-й пехотной дивизии афганской армии была получена информация о том, что вооруженными отрядами оппозиции заминирована дорога, ведущая в Вазахву. Именно по этому маршруту было намечено прохождение колонны материально-технического обеспечения, направлявшейся в 6-ю пограничную бригаду. По рекомендации контрразведки маршрут движения колонны был изменен, в итоге ни одна из машин не пострадала и груз без потерь был доставлен до места назначения.
В провинции Кунар по местам дислокации штабов 9-й пехотной дивизии (г. Асадабад) и 10-й пограничной бригады (н. п. Науки) размещались отделы военной контрразведки, осуществлявшие контрразведывательную работу в подразделениях пехотной дивизии, пограничной бригады и их ближайшем окружении. Советник отдела военной контрразведки по 9-й пехотной дивизии оказывал помощь в организации борьбы с дезертирством, предотвращении проникновения агентуры афганской оппозиции в среду военнослужащих, в повышении боевой готовности частей и подразделений дивизии и обеспечение безопасности боевых действий. Советник отдела военной контрразведки по 10-й пограничной бригаде оказывал помощь в организации контрразведывательного обеспечения подразделений бригады, выставленных вдоль афганско-пакистанской границы и пытавшихся в зоне своей ответственности в провинции Кунар перекрыть основные маршруты движения караванов с оружием из Пакистана на территорию Афганистана. Учитывая, что подразделения бригады были размещены вдоль границы в большом отрыве от мест дислокации других частей афганской армии, они практически ежедневно подвергались интенсивному обстрелу реактивными снарядами, выпускаемыми вооруженными отрядами оппозиции. Поэтому главной задачей афганских военных контрразведчиков и пограничников в провинции Кунар было выживание.