Неизвестна точная дата рождения Яна Гуса, но предположительно он появился на свет в 1369 году в крестьянской семье небольшого городка Гусинец, на юго-западе Чехии. Окончив Карлов университет, получил степень магистра «свободных искусств» и в 1400 году принял священство, после чего назначен на место проповедника при Вифлеемской часовне. Архиепископ, расположенный к Гусу, возложил на него обязанность проповедовать перед духовенством на его съездах или соборах в Праге. Задачи Гуса в проповедях сводились к призыву чешского народа к благочестивой жизни и обличение нравов духовенства. Одновременно с этим Гус читал лекции в университете, экзаменовал слушателей, исполнял должности декана и ректора (1402–1403). В стенах университета Ян Гус познакомился с философскими и богословскими сочинениями оксфордского профессора и реформатора Джона Уиклифа, которые были осуждены на родине последнего. В Праге авторитет оксфордского университета был непререкаем. Так, например, бакалаврам разрешалось читать в Карловом университете лекции только по запискам парижских, оксфордских или пражских магистров. В 1408 году в Праге прошел соборный капитул, представители которого указали университетским профессорам, что в сочинениях Уиклифа есть целый ряд еретических положений. Надо сказать, что если другие профессора яростно отстаивали ряд положений из учений английского богослова, то Ян Гус ограничился указанием, что многие из поставленных Уиклифу в вину положений неверно извлечены из его сочинений.
Однако непримиримость чешского профессора к непотребному поведению католического духовенства, в частности он укорял священников, которые брали с бедных деньги за требы, вызвала в католической среде такие жалобы, что расположенный к Гусу архиепископ лишил его звания проповедника на духовных съездах, а потом запретил и священствовать.
Все это происходило на фоне обостряющего конфликта между светской и духовной властью в Чехии. Пражский университет в этом споре стал на сторону короля, что дало возможность чешской партии в университете осуществить давнишнее желание – добиться такого преобразования университетского устава, которое обеспечило бы за ней перевес голосов. Король Вацлав IV (1361–1419) согласился признать за чешской нацией в университете три голоса, предоставив трем остальным «нациям» вместе лишь один. Это послужило поводом к оставлению немецкими профессорами и студентами Праги. Ян Гус снова избран ректором, и в университете заметно усиливается влияние богословских воззрений Уиклифа.
В 1402 году папа издает буллу, согласно которой все сочинения Уиклифа необходимо сжечь. Карлов университет не захотел подчиниться, так как усмотрел в булле незнание вопроса и искажение положений английского богослова. Ян Гус с несколькими другими профессорами апеллировал к папе, доказывая, что только невежды могли предать сожжению философские, математические и тому подобные книги Уиклифа, в которых содержится так много «чудных истин» и нет никаких заблуждений. В защиту сочинений Уиклифа в университете был устроен публичный диспут, в котором Ян Гус принял самое активное участие.
В это время папский престол занимал антипапа Иоанн XXIII, не отличавшийся высокими моральными качествами и подозревавшийся во многих не только духовных, но и светских преступлениях. Он объявил крестовый поход против своего соседа, короля Владислава Неаполитанского с отпущением грехов всем тем, кто будет содействовать его успеху. В 1412 году буллы об индульгенциях были обнародованы в Праге, и Ян Гус высказался против заключавшегося в них злоупотребления – права церкви отпускать грехи. На диспуте в университете Гус доказывал, что буллы не согласны ни со словами Христа, ни с интересом государства. Вопрос коснулся папской власти, и по этому вопросу мнения разделились; некоторые из друзей Гуса, как, например, Степан Палеч, соглашаясь, что в буллах заключаются очевидные заблуждения, не решились отрицать право папы давать индульгенции. Гус заявил: «друг мне Палеч и друг мне истина, между обоими же нужно дать преимущество истине». В этот спор об индульгенциях, ради которого в церквах всенародно выставлялись кружки для сбора пожертвований, вмешалась толпа и под предводительством одного из королевских любимцев сожгла папскую буллу. По распоряжению короля пражский магистрат казнил трех молодых ремесленников, которые в церкви особенно горячо кричали, что буллы – обман. Казнь состоялась, несмотря на заступничество Гуса; народ признал казненных мучениками, движение разрасталось, над Прагой был произнесен интердикт, и Гус вынужден был оставить город. Он удалился в замок Козий-градек; где начал проповедовать и на досуге написал свой трактат «О церкви», составленный всецело на основании взглядов Уиклифа.