Малое количество осадков влечет за собой небольшой сток. Так, в центре Центрально-Якутской низменности модуль годового стока обычно менее 2 л/сек км2
. К периферии же он возрастает до 2–4 л/сек, в то время как на тех же широтах Средне-Сибирского плоскогорья модуль стока (в разных условиях) достигает 5–11 л/сек км2. При этом сток в низменности уменьшается от истоков к низовьям рек, несмотря на увеличение площади бассейна, что связано с уменьшением осадков и увеличением испарения в центре низменности. По сравнению со Средне-Сибирским плоскогорьем (отчасти из-за равнинности территории) здесь меньше и густота речной сети, но зато неизмеримо больше озер термокарстового и старичного происхождения.Описываемая территория относится к средней части бассейна Лены. Это место впадения крупнейших ленских притоков — Олёкмы, Алдана и Вилюя.
Лена и исторически являлась и сейчас остается важнейшей транспортной артерией Якутии. Навигация по Лене длится 110–140 дней. В пределы Лено-Алданского плато и Центрально-Якутской низменности она вступает мощной рекой с глубинами до 12–20 м. Ширина современной долины достигает 30 км при ширине поймы в 7 —15 км. В русле реки масса островов. Близ устья Алдана ширина русла с островами достигает 10–15 км. На отрезке от г. Олёкминска до пос. Покровска (выше устья Алдана на 170 км) долина сужается, пересекая известняковое Лено-Алданское плато. Коренные берега с живописными скалами («столбами») подходят к самому руслу. После впадения Алдана долина Лены расширяется до 80
Справа в Лену впадает р. Олёкма (длина 1310 км), дающая 13 % среднегодового объема стока Лены. Параллельно юго-восточной границе протекает Алдан. Его общая длина 2242 км, а площадь бассейна 701 800 км2
. Крупнейший левый приток Алдана — р. Амга (длина 1375 км) — пересекает юго-восточную часть Лено-Алданского плато. Воды Алдана составляют 34,6 % годового объема стока Лены, или 164 куб. км.Наибольший из левых притоков Лены — Вилюй (длина 2435 км, площадь бассейна 490 600 кв. км) входит в пределы Центрально-Якутской низменности начиная со среднего течения. Его сильно развитые левые притоки: Ыгыатта, Марха (923 км), Тюкян и Тюнг начинаются на Средне-Сибирском плоскогорье. Правые притоки Вилюя, берущие начало с Лено-Вилюйского междуречья, короткие и маловодные. Вилюй приносит Лене 72 куб. км воды в год, или 12 % объема ее стока.
Весеннее половодье в верховье Лены наступает в конце апреля, в среднем течении — во второй половине мая (Якутск 28 мая), а в низовье — в первой половине июня. Поэтому ледоход сопровождается заторами. Чтобы предотвратить вызываемые ими наводнения, часто ведется бомбардировка с воздуха. Иногда максимальные расходы в верхней части бывают не во время половодья, а в июне — августе, в период летних дождей. Зимой наблюдается наименьший сток, что видно из следующих цифр стока в % от годового (БСЭ, т. 24, стр. 487).
Осенний ледоход начинается в начале октября в нижнем течении Лены, а в конце октября выше Якутска.
За летнюю навигацию по Лене завозят в Якутию 72 % потребных грузов (хлебных и технических грузов, черных металлов, нефтепродуктов). Вывозится лес и уголь.
Зимой Лена резко мелеет, а многие малые притоки промерзают до дна. Толщина льда — в среднем 1,5 м. Почти на всех реках образуются большие наледи.
Запасы электроэнергии бассейна Лены оцениваются в 60 млн. квт, или 250 млрд, квт-ч годовой выработки. Однако из-за суровых климатических условий, резкого сокращения расходов зимой, больших масс льда и тяжелых условий его пропуска через плотины, из-за значительной ширины долины и малоустойчивых берегов строительство гидроэлектростанций сложнее и обойдется дороже, чем на реках Центральной Сибири. Кроме того, в долине Лены расположены города и порты Якутии, месторождения минерального сырья, а также большая часть сельскохозяйственных угодий, затопление которых весьма нежелательно. Долгое время изыскания под строительство мощной гидростанции не приводили к удовлетворительному результату. Только в 1959 г. было закончено изыскание, и в полутора тысячах километрах от устья, в узкой долине Вилюя, у Эрбейэкского порога, где почти нет поймы, возник поселок строителей Вилюйской ГЭС — Чернышевск. Вилюйская ГЭС даст электроэнергию алмазникам Мирного и Далдына.
По предварительным наметкам Гидропроекта (1963), для использования гидроэнергии Лены может быть создан каскад из трех гидроэлектростанций: Нижне-Ленская — у булунской «трубы», которая может дать небывалую в мире мощность с годовой выработкой до 100 млрд, квт-ч электроэнергии; Якутская — у конца «ленских столбов» выше пос. Покровска и Мухтуйская — выше г. Ленска.