В коррупционных схемах также участвовали главы органов исполнительной власти указанного уровня. Из всего количества рассмотренных дел по 10 % проходила эта категория государственных служащих, в 4 % случаев они выполняли роль лидеров группировок. Незначительная доля участия руководителей администраций в группировках, в то время когда в более чем в половине выявленных преступлений были задействованы другие чиновники, свидетельствует о том, что они в основном используются для решения важных вопросов, связанных с достижением преступных замыслов, не будучи включенными в их состав. За взятки выполняют определенную работу в пределах своих официальных функций, не нарушая правовые нормы. Порой даже не знают о своей роли в общей криминальной структуре.
Если лидером группировки является глава субъекта Российской Федерации, то она, как правило, имеет межотраслевой, межрегиональный, а зачастую и международный характер. Данное положение объясняется наличием у них властно-распорядительных полномочий и соответствующих связей в сфере экономики.
Подобного рода структура до недавнего времени действовала в Сахалинской области, где губернатор организовал группировку, в состав которой входили заместитель председателя правительства области, советник губернатора, министр сельского хозяйства, торговли и продовольствия, другие чиновники областного уровня.
На протяжении более шести лет высокопоставленные должностные лица осуществляли покровительство коммерческим организациям, действующим в сфере рыболовства, сельского хозяйства, транспортного обеспечения и строительства. Глава области с участниками группировки, курирующими различные сектора экономики, оказывали содействие предпринимателям в получении выгодных заказов, предоставлении мер государственной поддержки, а также совершали иные действия, входившие в их полномочия, в интересах коммерческих организаций.
В одном из эпизодов губернатор и его сообщники получили от частного юридического лица за государственный заказ на строительство дорог в Сахалинской области в качестве взяток 85 миллионов рублей, что составило 6 % от суммы госконтракта. В другом случае предприниматель, осуществлявший строительство учебного заведения в Южно-Сахалинске на бюджетные средства, передал соучастникам группировки в качестве взяток 10 % от суммы выделенных средств. Общий размер по двум эпизодам составил 125 миллионов рублей. Еще одному бизнесмену чиновники за взятку гарантировали поддержку областной администрации в получении предусмотренных законом субсидий на строительство животноводческого комплекса.
За организацию преступного формирования и совершенные правонарушения глава Сахалинской области был задержан в своем рабочем кабинете сотрудниками центрального аппарата ФСБ. В ходе обыска оперативники изъяли по месту жительства один миллиард рублей наличными. Обыски прошли также в московской квартире и на его даче, где, помимо денег, изъяли более 800 ювелирных изделий, в том числе ручку стоимостью 36 миллионов рублей. Губернатор и трое соучастников обвинялись в получении взяток на 522 миллиона рублей. По уголовному делу арестовано имущество главы Сахалинской области на сумму более чем полтора миллиарда рублей. По решению суда его передали в пользу государства.
Прикрытие преступной деятельности на этом уровне осуществляют коррумпированные должностные работники автономных, краевых и областных правоохранительных органов. Проведенный анализ реализованных уголовных и оперативных дел в отношении преступных формирований свидетельствует, что в 30 % такие функции выполняли работники прокуратуры.
Чаще всего их действия выражались в форме отказа в возбуждении уголовных дел в отношении коррумпированных работников органов власти и управления, затягивания сроков проведения предварительного следствия с целью последующего его прекращения по амнистии либо другим реабилитирующим основаниям, а также отказа в санкционировании ареста, обыска, переквалификации деяния на менее тяжкое с последующим прекращением уголовного дела. В начале 2000-х годов часть функций из органов прокуратуры передана в Следственный комитет России и суды.
Судьи этого уровня участвовали в принятии мер в интересах членов организованных группировок в 14 % указанных дел. За взятки они оказывали содействие подсудимым в уклонении от справедливого наказания. В основном такими субъектами являлись высокопоставленные работники органов власти и управления. В суде порой не находят своего подтверждения даже самые веские доказательства виновности, если на скамье подсудимых находятся упомянутые лица.
Участие сотрудников различных служб органов внутренних дел этого уровня в прикрытии организованных сообществ по изученным материалам составляло 12 %. Коррумпированность среди сотрудников управлений безопасности была меньше.