Сама по себе система заградительной службы не в состоянии была полностью искоренить «отставание» как способ дезертирства. Успех борьбы с подобными преступлениями зависел от исполнительской дисциплины командного состава частей фронта. «СМЕРШ» постоянно указывал на невыполнение отдельными командирами приказов и распоряжений по фронту. 16 августа 1943 года начальник фронтового управления «СМЕРШ» информировал военный совет: «Несмотря на указания военного совета, категорически запрещающие зачисление в части военнослужащих, отставших в пути следования от своих частей, командиры соединений эти указания грубо нарушают, принимают в свои части случайных военнослужащих, зачастую сбежавших с переднего края обороны». Но и после дополнительных распоряжений командования ситуация не изменилась. 15 сентября в докладной записке с Северо-Западного фронта начальнику ГУКР «СМЕРШ» НКО СССР сообщалось о том, что, «несмотря на приказ командующего фронтом, продолжают иметь место факты, когда военнослужащие уходят из частей на переднем крае обороны, пробираются в тыл и пристраиваются в тыловые подразделения при попустительстве со стороны офицерского состава».
В июле-августе 1943 года опергруппы «СМЕРШ» смогли выявить такие способы дезертирства, обнаружить которые путем обычной проверки документов было невозможно. Оказалось, что некоторые командиры частей и соединений в нарушение приказов командующего фронтом выдавали целым группам военнослужащих командировочные предписания без указания срока явки в часть. Подобная практика нередко способствовала «совершению самого акта дезертирства». Например, красноармейцы 357-й стрелковой дивизии Набатов и Махаев были командированы для работы в ремпоезде № 2. Срок явки в часть в их документах отсутствовал. 17 апреля солдаты были отозваны, но решили в свой полк не возвращаться, а обосновались в удаленной от фронта деревеньке. Располагая продаттестатом и «бессрочным» командировочным предписанием, они тихо вели сытую жизнь вплоть до момента их задержания в июле сотрудниками «СМЕРШа». 15 июля того же года осташковской опергруппой была задержана команда из 3 человек во главе с техником-лейтенантом Чепелевым. При задержании последний предъявил бессрочное командировочное предписание, пользуясь которым вся команда пристроилась на ст. Сигово, получая по продаттестатам продукты на 14 человек.
Случалось и так, что вооруженные дезертиры создавали банды, занимавшиеся грабежом в прифронтовой зоне. Военной контрразведке приходилось вести борьбу и с этим злом. Отделы «СМЕРШ» периодически высылали оперативные группы в места наиболее вероятного «оседания» дезертиров для поимки или уничтожения бандитов. В августе 1943 года были ликвидированы 2 вооруженные банды. Опергруппой «СМЕРШ» 22-й армии в Сережинском районе Калининской области были задержаны занимавшиеся вооруженным грабежом дезертиры Смирнов и Васильев, а организатор банды Андреев был убит при попытке к бегству.
СМЕРШ, проверка документов (х/фильм «В августе сорок четвертого…»)
В целом следует отметить, что усилия по пресечению дезертирства, в том числе и на часто упоминаемом здесь Северо-Западном фронте, дали ощутимые результаты, и оно уже не носило массового характера, продолжая существовать в форме отдельных проявлений. По сведениям управления «СМЕРШ», с мая по июль 1943 года из частей фронта дезертировали 249 человек, а всеми видами заградительной службы были арестованы 210 дезертиров. Между тем на фронте было сосредоточено значительное количество войск. К июлю в его состав входили 1-я ударная, 22-я и 34-я общевойсковые, а также 6-я воздушная армии. В летние месяцы наметилась тенденция к сокращению случаев дезертирства при возрастании числа задержанных дезертиров, что служит доказательством роста эффективности соответствующей работы военной контрразведки и всей системы заградслужбы. Вместе с тем мероприятия по борьбе с изменой и дезертирством составили значительную долю общего объема оперативно-следственной работы контрразведки в годы Великой Отечественной войны.