В ходе дальнейшего обсуждения вопроса с подводными лодками Кузнецову все же удалось большие подводные лодки отстоять, т. к. Сталин на своих предложениях не слишком настаивал. Общее количество лодок все же пришлось сократить, т. к. по мнению И.В. Сталина и И.И. Носенко строительство такого большого количества субмарин стало бы серьезной проблемой для судостроительной промышленности.
В итоге предложения ВМФ по подводным лодкам были приняты в сокращенном виде, при этом нарком ВМФ заверил И.В. Сталина, что малые и средние подлодки будут строиться в основном в Горьком, и не загрузят мощности заводов, которые могут строить крупные надводные корабли.
Говоря об общей направленности развития флота, И.В. Сталин отметил, что «в ближайшие 10-15 лет наши эскадры будут защищаться. Другое дело, если вы собираетесь идти в Америку... так как нам этого не нужно, то мы не обязаны перенапрягать нашу промышленность». О Черноморском флоте он высказался так: «.нам надо иметь на Черном море такой флот, как говорили старые моряки, который мог бы в любой момент закрыть Босфор и, если потребуется, прорваться сквозь него. Черноморский флот должен быть в 10-12 раз сильнее турецкого».
В конце совещания были обсуждены вопросы перспектив судостроения. Здесь так же Сталин предложил серьезные изменения. Дело в том, что до того времени практически все судостроительные заводы, параллельно с созданием новых кораблей, занимались ремонтом уже действующих. Это отвлекало и силы, и мощности. Данная проблема была Сталину известна и понятна. Поэтому относительно перспектив судоремонта, Сталин рекомендовал создать четыре больших специализированных завода, по числу флотов, которые бы специализировались только на ремонте кораблей. Судостроительные же заводы в перспективе судоремонтом не занимать.
Учитывая будущую кораблестроительную программу, И.В. Сталин интересовался у И.И. Носенко возможностями расширения заводов в
Комсомольске-на-Амуре и в Николаеве. Планы у вождя по развитию судостроения в СССР были большие. Уже в сентябре 1945 года Сталин впервые заговорил «о необходимости создания автономной базы судостроения на Черноморском, Дальневосточном и Северном театрах и даже на Балтике». В пример он приводил Ленинград, который уже обладал к этому времени относительно высокой степенью автономности, что подтвердила война. Даже находясь в полной блокаде, т. е. в полной изоляции от всей остальной страны, Ленинград мог не только ремонтировать корабли всех классов, но в течение всей блокады заниматься постройкой небольших кораблей, а также достройкой подводных лодок и эсминцев.
И еще одна любопытная деталь - конкретных задач флотам И. В. Сталин на совещании в сентябре 1945 года не ставил, оставив оперативные вопросы в ведении Наркома. Это тоже было абсолютно правильно, т. к. Сталин, став к концу войны первоклассным полководцем, не считал себя сведущим в вопросах грамотного оперативного применения и использования ВМФ. В случае с ВМФ, он оставил за собой исключительно определение стратегических приоритетов
Мы не знаем точно, что думал в 1945 году Сталин относительно перспектив применения ВМФ, в связи с созданием атомного оружия в США. По-видимому, каких-то конкретных решений у него на этот счет не было, но то, что данный вопрос, как и вопрос использования в условиях ядерных атак противника Вооруженных Сил в целом, в сентябре 1945 года его уже волновал, сомнений быть не может. Для осмысления новой военно-политической ситуации и прогноза развития ВМФ в условиях реальности атомной войны требовалось время.
Для окончательного уточнения предложений по плану, там же была создана очередная комиссия, призванная для начала согласовать и свести воедино, как требование флота, так и возможности судостроительной промышленности. В комиссию вошли заместители председателя Совнаркома СССР Л.П. Берия и Н.А. Кузнецов, Нарком ВМФ Н.Г. Кузнецов, начальник Генерального штаба генерал армии А.И. Антонов и начальник Главного Морского штаба адмирал И.С. Исаков, Нарком судостроительной промышленности И.И. Носенко с его первым заместителем А.М. Редькиным, Нарком вооружения Д.Ф. Устинов, а также многолетний куратор ВМФ член Политбюро А.А. Жданов. Несколько позднее, 20 сентября, в комиссию дополнительно ввели и Наркома черной металлургии И.Ф. Тевосяна, ранее возглавлявшего судостроение.
Следует отметить, что маршал Л.П. Берия являлся наиболее подходящей фигурой для претворения в жизнь установок вождя, которые сводились к механическому исключению из программы ряда крупных кораблей. В отношении же типов кораблей и сроков их постройки Берия ориентировался на промежуточную позицию, занятую Сталиным в отчаянном споре между наркоматами ВМФ и судостроительной промышленности.