Читаем Странная обезьяна. Куда делась шерсть и почему люди разного цвета полностью

Тестируя работу алгоритма, авторы нанесли предсказанные цвета кожи тысячи с лишним человек на мировую карту. Полученная картина в самом деле похожа на реальное географическое распределение пигментации.

Методика отлично показала себя на образцах плохого качества, содержащих очень маленькое количество ДНК. Разработчики планируют продолжать совершенствовать метод: включать в процедуру новые снипы и повышать надежность предсказаний{11}.


Недавно появилась аналогичная модель, которая предсказывает форму волос: на основании 32 снипов можно узнать, прямые волосы или «непрямые». Пока что надежность предсказания — 66 % для европейцев и 79 % для азиатов{12}, и главную партию играет знакомый нам ген EDAR. На сегодняшний день это единственная модель для криминалистов, предсказывающая признак, не связанный с пигментацией.


Переходим к самому интересному. Кроме прочего, разработчики HIrisPlex-S презентовали онлайн-вариант методики, доступный любому желающему. По адресу https://hirisplex.erasmusmc.nl/ вы увидите форму из 41 снипа. Теперь, если у вас есть подходящий геном, смотрите, какие генетические буквы находятся в указанных позициях, заполняйте форму и получайте прогноз!

У нас есть подходящий геном, и не один! Ведь на сайте Института эволюционной антропологии им. Макса Планка{13} выложены в свободный доступ генетические последовательности древних людей. Конечно, мы с биологом Константином Лесковым не удержались и воспользовались этой возможностью — испытали работу программы на геномах двух неандертальцев (из Денисовой пещеры и из пещеры Виндия), денисовского человека и древнего Homo sapiens из Усть-Ишима (Сибирь, 45 000 лет).

Для уточнения деталей мы даже вступили в переписку с одним из авторов исследования, Сьюзен Уолш.

В итоге получились любопытные результаты, которые я привожу ниже.



Итак, оба неандертальца и денисовец, если верить программе (и если мы нигде не ошиблись), черны как ночь. Кожа, волосы и глаза сапиенса из Усть-Ишима столь же темные.



Должен сказать, однообразная темнокожесть всех четверых озадачила нас: вдруг систему заело? Для контроля мы взяли геномы француза и пигмея мбути, выложенные на том же сайте Института эволюционной антропологии им. Макса Планка, и вот что получилось.



Похоже, правда? Значит, методика не глючит.

И все же, прежде чем заявлять во всеуслышание о черных неандертальцах, надо сделать важную оговорку. HIrisPlex-S — методика, предназначенная для тестирования современных людей. Как видим, даже в рамках нашего вида эволюция пигментации шла разными путями. А неандертальцы и денисовцы сотни тысяч лет эволюционировали в Евразии независимо от наших предков и вполне могли посветлеть своим особым образом, в результате неких мутаций, нам пока неизвестных. В этом случае методика не сработает, потому что такие уникальные для неандертальцев снипы в калькуляторе HIrisPlex-S отсутствуют. Для выявления специфических мутаций, влияющих на «окраску» древних людей, необходимы более глубокие исследования архаичных геномов.

Напомню о пресловутых рыжих волосах неандертальцев. Мутация в гене MC1R, из-за которой испанский и итальянский неандертальцы должны были порыжеть, у современных людей не встречается.

Правда, как я уже писал, у неандерталок из Денисовой пещеры и Виндии этой мутации в любом случае нет. Быть может, неандертальский цвет волос так же радовал древних троглодитов своим разнообразием, как радует современных европейцев.

И все-таки, если неандертальцы Денисовой пещеры и Виндии, а также денисовец и древний сапиенс из Усть-Ишима действительно были очень темнокожими кареглазыми брюнетами, то какой из этого вывод? Простой: значит, общий предок сапиенсов, денисовцев и неандертальцев был темнокожим брюнетом с карими глазами. Посветление евразийских сапиенсов могло происходить независимо от неандертальцев, если таковые вообще светлели.

Древние геномы готовят нам еще множество сюрпризов. Доступность инструментов для их анализа позволяет любому энтузиасту генетики, сидя дома за компьютером, совершать маленькие открытия подобно тому, как астрономы-любители открывают новые кометы и астероиды.

Методики предсказания пигментации по ДНК быстро совершенствуются. Вероятно, в ближайшем будущем такая система будет выдавать результат не в виде категорий «бледный — промежуточный — темный», а количественно, в единицах меланинового индекса. А еще лучше — картинкой заданного оттенка. Кстати, примерно так уже сейчас работает сервис по предсказанию цвета глаз, расположенный на сайте Gedmatch.com: результат его работы — изображение глаза с радужкой нужного цвета.









Заключение

Перейти на страницу:

Похожие книги

Искусство статистики. Как находить ответы в данных
Искусство статистики. Как находить ответы в данных

Статистика играла ключевую роль в научном познании мира на протяжении веков, а в эпоху больших данных базовое понимание этой дисциплины и статистическая грамотность становятся критически важными. Дэвид Шпигельхалтер приглашает вас в не обремененное техническими деталями увлекательное знакомство с теорией и практикой статистики.Эта книга предназначена как для студентов, которые хотят ознакомиться со статистикой, не углубляясь в технические детали, так и для широкого круга читателей, интересующихся статистикой, с которой они сталкиваются на работе и в повседневной жизни. Но даже опытные аналитики найдут в книге интересные примеры и новые знания для своей практики.На русском языке публикуется впервые.

Дэвид Шпигельхалтер

Зарубежная образовательная литература, зарубежная прикладная, научно-популярная литература
Тайны нашего мозга, или Почему умные люди делают глупости
Тайны нашего мозга, или Почему умные люди делают глупости

Мы пользуемся своим мозгом каждое мгновение, и при этом лишь немногие из нас представляют себе, как он работает. Большинство из того, что, как нам кажется, мы знаем, почерпнуто из общеизвестных фактов, которые не всегда верны… Почему мы никогда не забудем, как водить машину, но можем потерять от нее ключи? Правда, что можно вызубрить весь материал прямо перед экзаменом? Станет ли ребенок умнее, если будет слушать классическую музыку в утробе матери? Убиваем ли мы клетки своего мозга, употребляя спиртное? Думают ли мужчины и женщины по-разному? На эти и многие другие вопросы может дать ответы наш мозг. Глубокая и увлекательная книга, написанная выдающимися американскими учеными-нейробиологами, предлагает узнать больше об этом загадочном природном механизме. Минимум наукообразности — максимум интереснейшей информации и полезных фактов, связанных с самыми актуальными темами: личной жизнью, обучением, карьерой, здоровьем. Перевод: Алина Черняк

Сандра Амодт , Сэм Вонг

Зарубежная образовательная литература, зарубежная прикладная, научно-популярная литература