Тестируя работу алгоритма, авторы нанесли предсказанные цвета кожи тысячи с лишним человек на мировую карту. Полученная картина в самом деле похожа на реальное географическое распределение пигментации.
Методика отлично показала себя на образцах плохого качества, содержащих очень маленькое количество ДНК. Разработчики планируют продолжать совершенствовать метод: включать в процедуру новые снипы и повышать надежность предсказаний{11}
.Недавно появилась аналогичная модель, которая предсказывает форму
волос: на основании 32 снипов можно узнать, прямые волосы или «непрямые». Пока что надежность предсказания — 66 % для европейцев и 79 % для азиатов{12}, и главную партию играет знакомый нам генПереходим к самому интересному. Кроме прочего, разработчики HIrisPlex-S презентовали онлайн-вариант методики, доступный любому желающему. По адресу https://hirisplex.erasmusmc.nl/
вы увидите форму из 41 снипа. Теперь, если у вас есть подходящий геном, смотрите, какие генетические буквы находятся в указанных позициях, заполняйте форму и получайте прогноз!У нас есть подходящий геном, и не один! Ведь на сайте Института эволюционной антропологии им. Макса Планка{13}
выложены в свободный доступ генетические последовательности древних людей. Конечно, мы с биологом Константином Лесковым не удержались и воспользовались этой возможностью — испытали работу программы на геномах двух неандертальцев (из Денисовой пещеры и из пещеры Виндия), денисовского человека и древнегоДля уточнения деталей мы даже вступили в переписку с одним из авторов исследования, Сьюзен Уолш.
В итоге получились любопытные результаты, которые я привожу ниже.
Итак, оба неандертальца и денисовец, если верить программе (и если мы нигде не ошиблись), черны как ночь. Кожа, волосы и глаза сапиенса из Усть-Ишима столь же темные.
Должен сказать, однообразная темнокожесть всех четверых озадачила нас: вдруг систему заело? Для контроля мы взяли геномы француза и пигмея мбути, выложенные на том же сайте Института эволюционной антропологии им. Макса Планка, и вот что получилось.
Похоже, правда? Значит, методика не глючит.
И все же, прежде чем заявлять во всеуслышание о черных неандертальцах, надо сделать важную оговорку. HIrisPlex-S — методика, предназначенная для тестирования современных людей. Как видим, даже в рамках нашего вида эволюция пигментации шла разными путями. А неандертальцы и денисовцы сотни тысяч лет эволюционировали в Евразии независимо от наших предков и вполне могли посветлеть своим особым образом, в результате неких мутаций, нам пока неизвестных. В этом случае методика не сработает, потому что такие уникальные для неандертальцев снипы в калькуляторе HIrisPlex-S отсутствуют. Для выявления специфических мутаций, влияющих на «окраску» древних людей, необходимы более глубокие исследования архаичных геномов.
Напомню о пресловутых рыжих волосах неандертальцев. Мутация в гене
Правда, как я уже писал, у неандерталок из Денисовой пещеры и Виндии этой мутации в любом случае нет. Быть может, неандертальский цвет волос так же радовал древних троглодитов своим разнообразием, как радует современных европейцев.
И все-таки, если неандертальцы Денисовой пещеры и Виндии, а также денисовец и древний сапиенс из Усть-Ишима действительно были очень темнокожими кареглазыми брюнетами, то какой из этого вывод? Простой: значит, общий предок сапиенсов, денисовцев и неандертальцев был темнокожим брюнетом с карими глазами. Посветление евразийских сапиенсов могло происходить независимо от неандертальцев, если таковые вообще светлели.
Древние геномы готовят нам еще множество сюрпризов. Доступность инструментов для их анализа позволяет любому энтузиасту генетики, сидя дома за компьютером, совершать маленькие открытия подобно тому, как астрономы-любители открывают новые кометы и астероиды.
Методики предсказания пигментации по ДНК быстро совершенствуются. Вероятно, в ближайшем будущем такая система будет выдавать результат не в виде категорий «бледный — промежуточный — темный», а количественно, в единицах меланинового индекса. А еще лучше — картинкой заданного оттенка. Кстати, примерно так уже сейчас работает сервис по предсказанию цвета глаз, расположенный на сайте Gedmatch.com
: результат его работы — изображение глаза с радужкой нужного цвета.Заключение