Князя Василия Ивановича провозгласили царём 19 мая 1606 года. Венчал его на царство 1 июня Новгородский митрополит Исидор, так как после свержения Лжедмитрия был смещён с патриаршества его ставленник патриарх Игнатий, а новые выборы духовного владыки ещё не были проведены.
«Совершилось Царское венчание в храме Успения, с наблюдением всех торжественных обрядов, но без всякой расточительной пышности».
В Успенском соборе новый царь дал клятвенную запись: «Мне, Великому Государю всякого человека, не осудя истинным судом с Бояры своими, смерти не предати, и вотчин и дворов и животов у братьов у братьи их и у жен и у детей не отнимати, будет которые с ними в мысли не бытии, так же у гостей и у торговых людей и у черных людей, хотя который по суду и по сыску дойдет и до смертные вины, и после их у жен и у детей дворов и лавок и животов не отъимати, буде с ними они в той вине невинны; да и доводов ложных мне, Великому Государю, не слушати, а сыскивати сыски накрепко и ставити с очей на очи, чтоб в том православное христианство безвинно не гибли; а кто на кого скажет, и сысков того, казнити, смотря по вине его, что был взвел неподдельно, тем сам осудится».
Став царём Василий Шуйский первым делом попытался завязать контакты с соседними странами. «И послал царь Василей в Литву князя Григорья Волконского да в дьячье место посольского подьячева Ондрея Иванова. А в Крым послал царь Василей думнаго дворянина Ондрея Матвеевича Воейкова».
Николай Карамзин повествует: «Еще Василий имел время возобновить дружественные сношения с Императором, с Королями Английским и Датским. Гонец Рудольфов и Посланник Шведский находились в Москве. Непримиримый враг врага нашего, Сигизмунда, Карл IX ревностно искал союза России, и Василий действительно не спешил заключить его, в надежде обойтись без войны с Сигизмундом. Хан Казы-Гирей уверял Царя в братстве, Ногайский Князь Иштерек в повиновении. Воевода Князь Ромодановский отправился к Шаху Аббасу для важных переговоров о Турции и Христианских землях Востока. Еще Двор Московский занимался делами Европы и Азии, политикою Австрии и Персии; но скоро опасности ближайшие, внутренние, многочисленные и грозные скрыли от нас внешность, и Россия, терзая свои недра, забыла Европу и Азию!».
Новому монарху необходимо было получить поддержку соседних самодержцев, поскольку в своей стране его положение оставалось довольно шатким. Летописец сообщает: «А как после Ростриги сел на государство царь Василей, и в польских, и в украиных, и в северских городех люди смутились и заворовали, креста царю Василью не целовали, воевод почали и ратных людей побивать, и животы их грабить, и затеели, будто тот вор Рострига с Москвы ушол, а в ево место будто убит иной человек. В Борисове городе убили Михаила Богдановича Сабурова. В Белегороде убили князя Петра Ивановича Буйносова. А с Ливен Михайло Борисович Шеин утек душею да телом, а животы ево и дворянские пограбили».
На периферии, особенно в южных уездах, распространяется слух о спасении царя Дмитрия, будто бы избежавшего смерти и бежавшего из Москвы. Многие в это верят, поскольку о событиях в Москве мало что знают.
Чтобы пресечь опасные слухи и успокоить народ царь Василий IV переносит из Углича в Москву тело царевича Дмитрия. Царевича торжественно, при большом скоплении народа, перезахоранивают в Михайловском соборе.
В это самое время на юге страны появляется Иван Болотников, называющий себя воеводой чудом спасшегося законного царя Дмитрия.
Болотников, ранее бывший боевым холопом князя Андрея Телятевского, попал в плен к татарам и был продан в Турцию. Был выкуплен немцами. Одно время жил в Венеции, но после, услышав, что в Польше якобы находится царевич Дмитрий, предложил ему свои услуги и явился с письмом от него в Путивль к воеводе князю Григорию Петровичу Шаховскому, который изменил законному царю и поднял мятеж.
К Ивану Болотникову отовсюду стекаются служилые люди и простолюдины. У него уже целая армия, угрожающая новому царю.
Правительство снаряжает и отправляет против мятежников три полка, во главе с князем Юрием Никитовичем Трубецким и Михаилом Александровичем Нагим. «В передовом полку боярин князь Борис Михайлович Лыков да князь Яков Петрович Борятинской. В сторожевом полку околничей князь Григорей Петрович Рамодановской да князь Раман княж Иванов сын Гагарин».
«И под Крамами у воевод с воровскими людми был бой. И ис Путивля пришол Ивашко Болотников да Юшка Безаубцов со многими северскими людми и с казаки пришли на проход в Кромы. И после бою в полкех ратные люди далных городов ноугородцы и псковичи, и лучаня, и торопчане, из замосковных городов под осень в полкех быть не похотели, видя то, что во всех украиных городех учинилась измена и учали ис полков розъезжатца по дамом».
Как видно, со слов летописца, состоявший на царской службе служилый люд воевать не хотел. Командование действовало крайне осторожно и неумело, с большой медлительностью, что не способствовало военным успехам. Царские воеводы всё время опаздывали с принятием решений, поэтому терпели поражения.