Регулируя внутрицерковную жизнь, владыке удалось выстроить жесткую вертикаль власти. В тех условиях, в отличие от нынешних, она оправдывалась необходимостью противостоять тоталитаризму. Все настоятели беспрекословно подчинялись правящему епископу. Исполнительные органы – настоятелям. Конфликт, если он возникал в общине, решался, как правило, в пользу пресвитера. Архиепископу довольно быстро удалось установить некую закрытую зону, куда чиновник СДРПЦ редко показывал свой нос. Более того, до конца 1950-х годов большинство поступавших к уполномоченному жалоб внутрицерковного характера пересылалось в епархию (31). Скажем, уполномоченный отказался рассмотреть жалобу на старосту из Джанкоя, который «крадет деньги из церковного ящика», говоря, что «она имеет отношение к епархии» (32).
Несколько раз Лука пытался размыть само понятие «регистрация», поставить чиновника СДРПЦ перед свершившимся фактом перемещения духовенства. Но подобные вольности не проходили. В качестве иллюстрации можно привести такой случай. В Алупке заболел священник, и Лука без уведомления уполномоченного перевел служить туда о. Леонида Дунаева из ялтинского собора. Чиновник СДРПЦ наносит превентивный удар. На встрече с Лукой 9 мая 1956 года он сообщает архиепископу о снятии о. Леонида с регистрации. «На мое заявление о снятии с регистрации Дунаева, Лука долгое время молчал, опустив голову, с распростертыми руками на столе. После оцепенения он нашел мою руку, пожал ее в сильном волнении и глухим голосом проговорил: «Простите меня, простите меня! Вы правы, мы совершили нехорошие дела».
На просьбу Луки простить его, я ответил, что, считаясь с его болезнью и имея в виду, что его подвел Кудрявцев, на этот раз я исполню просьбу архиепископа и не сниму с регистрации Дунаева» (33).
До конца 1950-х внутрицерковная власть епископа не ставилась под сомнение, «достаточно было грозного послания Луки, и смута прекращалась» (34). Довольно долго бурлили страсти разве что в Никольском соборе Евпатории, где прихожане горой встали за о. Николая Ливанова.
О. Николай, несмотря на бурную деятельность по созиданию общины, согрешил против седьмой заповеди и был отчислен за штат (35). В других общинах конфликты быстро затухали. И только когда в конце 1950-х власть правящего епископа пошатнулась, во многих приходах, в том числе в кафедральном соборе, разгорелись склоки среди прихожан, омрачившие и без того грустную картину последних лет архипастырства Луки.
В СДРПЦ владыку больше всего опасались в качестве церковного политика. Поэтому многие решения руководства СДРПЦ доводились до сведения Луки окольными путями, намеками и советами через третьих лиц. Святитель и в далеком Крыму оставался интеллектуальным ресурсом Церкви. Он неоднократно ставил перед патриархом важные вопросы: о выпуске богослужебных книг, о необходимости созыва Архиерейского собора в 1953-м, об упорядочении налогового бремени и т. п. С одной стороны его всячески зажимали: статьи в «Журнале Московской патриархии» не печатали, не давали возможности переписываться с заграницей, редко допускали к трибуне. С другой – его мнение, произнесенное шепотом на кухне, разносилось по дальним уголкам страны.
Лука по-прежнему продолжал свою врачебную деятельность. «Его, как профессора, очень много посещает больных, приходят к нему не только с болезнями, связанными с его специальностью как хирурга, но и со всякого рода другими болезнями, приходят и психопаты, и его племяннице, ведущей учет и запись больных к нему на прием, приходится выслушивать немало всякого рода оскорблений от лиц, которым она отказывает в записи на прием», – отмечает уполномоченный (36).
Принимал он больных, как правило, один час в день. В 1956 году третьим изданием выходят «Очерки гнойной хирургии». Владыка послал только что отпечатанную монографию патриарху Алексию I в подарок. Между тем здоровье архипастыря все ухудшалось. Академик В.П. Филатов нашел у него помутнение хрусталика. К 1956 году святитель полностью ослеп, но продолжал еще какое-то время консультировать больных. Мария Германовна Тринихина рассказывала, что приблизительно в 1956 году у ее дочери возникли серьезные проблемы с кишечником. Врачи определили ее положение как безнадежное. Тогда она обратилась к святителю. Тот осмотрел девочку, ознакомился с историей болезни и сказал, что ее можно спасти. Дал направление на операцию, но врачи не решились оперировать. Тогда Лука лично явился в больницу и подробно проконсультировал врачей. Операция прошла успешно (37).
Болезнь мешала святителю часто посещать храмы епархии. Так, в 1956 году владыка ездил только в Ялту и село Зуя на храмовые праздники. Летом он жил в Алуште, приезжая на воскресную литургию в Симферополь, но иногда служил и в местном храме, проповедовал.