Однако, как отмечал А. Ф. Стародубцев, «в Управлении еще не представляли себе, с каким опытным и жестоким противником придется столкнуться зафронтовым работникам. Часть мероприятий была скомкана по причине стремительности немецкого наступления и осталась только на бумаге, многие из агентов оказались слишком неопытны и были раскрыты немецкой контрразведкой».
Уже осенью 1941 г. Ленинградское управление НКВД стало направлять на оккупированную территорию агентов с целью попасть с немецкие спецслужбы. По возвращению в Ленинград они давали весьма скудную информацию о месте нахождении и оперативных возможностях проникновения в разведшколы.
С лета – осени 1941 г. возникает серьезная потребность в оперативном обучении сотрудником НКВД, особенно тех, кто должен был забрасываться в тыл врага. Л. И. Кожевников в 1977 г. писал, что «Первая разведшкола 4-го отдела была открыта в сентябре 1941 года на побережье Финского залива, в Лисьем Носу. На Охте была установлена мощная радиостанция. Годом позже, в ноябре 1942 года, когда первая школа уже не могла обеспечить потребность в кадрах, была открыта вторая – в пос. Боровичи, недалеко от Малой Вишеры». Разведывательную подготовку в этих учебных оперпунктах прошли многие разведчики, часть из них стали в последующем командирами разведывательно-диверсионных групп. С началом войны на Малой Охте работала школа 2-го спецотдела по переподготовке радистов. С сентября 1941 г. на 16-й линии Васильевского острова готовила разведчиков для заброски в немецкий тыл еще одна школа, созданная по линии контрразведки. В этот же период в Выборгском районе находилась школа УНКВД по подготовке радистов, зашифрованная под военно-морскую.
Руководство НКВД использовало все возможности для блокирования разведорганов врага, в том числе и «налеты» на подразделения Абвера в прифронтовой полосе. Такой опыт не всегда был успешным, так операция по уничтожению авбергруппы в Сиверском в 1942 г. была неудачной, многие сотрудники погибли и возвратились в тыл Красной армии. С середины 1942 г. в Ленинградском управлении НКВД и особом отделе фронта стали появляться планы по активному проникновению в разведорганы. Подразделение П. А. Соснихина начало разрабатывать операцию по внедрению агента в «Псковскую абверкоманду». Соснихин родился в селе Вареж Муромского уезда Владимирской губернии в семье рабочего, в 15 лет вступил в местную ЧОН (часть особого назначения). В 1931 г. Соснихина призвали в армию. Он попал на западную границу, в Сестрорецкий пограничный отряд. В 1934 г. ему предложили перейти на оперативную работу в морской пограничный отряд, затем последовала служба в НКВД. Среди сотрудников П. А. Соснихина следует назвать В. Н. Маковеенко, А. Ф. Приходько, А. М. Алова и других. Подразделения Соснихина работали в постоянном взаимодействии с разведотделом штаба фронта и Управлением НКВД.
Один из первых опытов внедрения бывшего агента «абверкоманды-104», сдавшегося НКВД в 1942 г. состоялся у Д. Д. Таевере, заместителя начальника ОКР «Смерш» 67-й армии. Н. Филимонов, попавший в плен летом 1941 г., был завербован в лагере сотрудниками «абвергруппы-111», прошел обучение и был направлен в советский тыл. После переброски он сдался чекистам и рассказал про устройство абверкоманды, назвал сотрудников и выразил готовность вернуться в Псков, для выполнения задания «Смерш». Возвращение происходило через линию фронта, и после проверок он вновь оказался в Пскове. В расположении разведоргана он рассказал о «добытых в СССР сведениях» и после очередных проверок начал подготовку к выполнению нового задания руководства абвершколы. «Успешное» задание стало рекомендацией для вступления в антисоветский Народно-трудовой союз. Филимонову удалось выяснить кадровый состав преподавателей, узнать о работе Смысловского. После дополнительного обучения в Валге он вновь возвращается в Псков и в составе разведгруппы из трех человек был заброшен в район Холма. Все немецкие агенты пришли к чекистам. Впоследствии Филимонов служил в Красной армии.
Полученные сведения позволили продолжить разработку операций по внедрению в разведорганы врага.
Для проникновения в школы, как правило, использовался достаточно опасный и трудный путь – через плен и концентрационный лагерь. В лагерях происходила вербовка в немецкие разведшколы, под предлогом набора добровольцев во власовскую армию. Как правило, вербовщиками являлись не только немецкие офицеры, но и русские офицеры Абвера и СД. Многие из них были выходцами из белоэмигрантских кругов, другие перешли на сторону фашистов уже в годы войны и сумели заслужить доверие, выполнив различные задания в советском тылу.