В это же время он продолжает участие в патриотическом движении. Избирается начальником Службы безопасности недолго просуществовавшего Фронта национального спасения. В 1993 году принял участие в событиях по защите Белого дома (Верховного совета России) в противостоянии с Борисом Ельциным. Почти вся его добровольческая рота, участвовавшая в защите ПМР, пошла с ним. Штабом подразделения стало помещение на Поварской улице, в котором позже расположится модный ресторан «Эль Гаучито».
В ходе событий принимал участие в штурме Останкино, в котором в ногу ранили его товарища Владислава Шурыгина, ставшего впоследствии известным военным корреспондентом. Именно Бородай будет рядом с ним в этот момент, находясь в непосредственном подчинении у генерала Макашова. Участвовал в переговорах с подразделением «Витязь» и утром 4 октября вместе со своими бойцами ушел из Белого дома, покидать который отказался только Василий Фимин, который там и погиб.
Себя идентифицировал исключительно русским националистом с акцентом на патриотизм. После событий был приглашен в газету «Завтра». В это время окончил МГУ и поступил в аспирантуру.
В 1994 году Бородай проходит существовавшую тогда военную стажировку от военной кафедры в Кантемировской дивизии. Там встретился с теми, кто был с другой стороны баррикад при штурме Белого дома. Начал писать военные очерки и был приглашен на работу в РИА «Новости» в качестве военного корреспондента.
С конца 1994 года находился в постоянных командировках в Грозном. В РИА печатался без указания фамилии, как и основная часть корреспондентов. В то время от РИА по поручению руководства писал служебную записку Виктору Черномырдину по обстановке в Чечне. Рассказывая это, Бородай смеялся, вспоминая, как перепечатывал ее огромным шрифтом для удобства тогдашнего премьера. Так и проработал 1995-й и 1996 годы.
В то время Шурыгин свел его с популярным тогда Александром Невзоровым50
, но с ним сразу не сработался из-за напыщенности и неадекватности модного ньюсмейкера. Тогда Бородая пригласил Александр Проханов в газету «Завтра» на должность военного обозревателя. Там он уже печатался под своей фамилией. Позже Бородай создаст интернет-телеканал «День-ТВ».Потом из-за нехватки денег Александр Юрьевич из чисто военной журналистики опять вернулся к бизнесу, где занялся пиаром и лоббированием. Первое большое дело, на котором поднялся, было в отношении «Сибнефти». С этого время основу бизнеса в основном составлял пиар, в том числе и в газете «Завтра».
В то время он уже дружил с Игорем Гиркиным, которого привлекал к делам по бизнесу, давая и ему возможность подзаработать. Знакомство с ним состоялось на демонстрации 9 мая 1996 года через Ольгу Кулыгину, которая в Приднестровье была санинструктором и с того времени знала обоих. Отношения быстро переросли в доверительные и товарищеские, и Бородай стал крестным отцом первого ребенка Гиркина.
Как военкор, в это время занялся Таджикистаном, так как после Хасавюртовского мира тема Чечни в то время стала угасать. С 1996-го по 1999 год Бородай регулярно бывал в Таджикистане, разрываемом последствиями кровавой гражданской войны. Чаще всего работал с 201-й дивизией. Много выходов совершил с отрядами психологических операций и разведкой дивизии.
По делам бизнеса и сопутствующим у него был заход в Афганистан.
В это же время стал заниматься и Украиной.
С 1999 года началась вторая чеченская война. С самого начала августа 1999-го отправился туда. С ним поехал Гиркин, которому он сделал документы журналиста. Гиркину на службе долго не согласовывали командировку, ему же это требовалось для продвижения по карьерной лестнице, да и просто для патриотического драйва. К тому времени у Александра Юрьевича уже было много связей в военной среде, и Бородай через журнал внутренних войск «На боевом посту» при содействии тогдашнего редактора Владимира Шеремета сделал Гиркину документы военного корреспондента, что позволило тому поехать вместе с Бородаем.
Там Александр воюет и работает в «кадарской зоне» в 8-м отряде спецназа внутренних войск, в котором бывал с начала 1996 года и дружил с его командиром Владимиром Ивановым. Потом Новолацкий район. В следующий раз в Чечню Бородай зайдет в январе 2000 года. Лично принял участие во втором штурме Грозного. Попал в окружение в Заводском районе Грозного, подразделение, в котором он находился, понесло значительные потери убитыми и ранеными.
Потом опять вернулся в Москву и продолжил бизнес, но в следующем, 2001 году опять вместе с Гиркиным поехал в Чечню, где дислоцировался в Веденском районе, в ставшим потом широко известном лагере Хатуни.
Я спросил Бородая: «Александр Юрьевич, зачем ты там был? Ты же был уже обеспеченным состоявшимся респектабельным человеком», – на что получил ответ: «Для себя». Очевидно, базовым мотивом для него был военный экшн и патриотизм. Самореализация.