Вместе с Елагиным в ряды вольных каменщиков пришла плеяда блестящих общественных деятелей. Просветитель Николай Новиков издал несколько тысяч наименований книг, назначение которых было в повышении общего образовательного уровня широких слоев населения. Его друг, масон Иван Петрович Тургенев, директор Московского университета, создал систему высшего образования. Масон Николай Карамзин написал первую полную многотомную «Историю государства Российского». Елагин в должности директора Придворных театров заложил основы национального театра.
Масон Михаил Херасков, возглавивший Петербургскую академию художеств, основал легендарную ложу «Умирающий сфинкс», членами которой были основоположники национального портрета Боровиковский, Левицкий и Рокотов, создатель русской жанровой живописи Венецианов, а также великий Брюллов.
Сама государыня, хотя и невольно, сделала немало для будущего масонства в России, насаждая в высшем обществе антихристианский дух «вольтерьянства». С ее легкой руки оно стало модным среди русской знати. Русский просветитель Н.И. Новиков записывает в это время в своем дневнике, что уже стоит «на распутье между вольтерьянством и религией».
Настоящие масоны появились в России только в конце царствования Екатерины. Одним из них был Шварц, уроженец Трансильвании. В Россию он приехал в 1780 году в качестве гувернера, но вскоре стал профессором Московского университета, где со временем сколотил вокруг себя небольшой масонский кружок из числа преподавателей и студентов. В 1782 году Россия была признана «восьмой провинцией масонского мира». Но свою «полезную» деятельность Шварц закончить так и не успел, ибо скончался в 1784 году.
Бывший член берлинской ложи «Трех глобусов» барон Шредер, направленный министром короля Фридриха из Пруссии Вёльнером для руководства русскими, занял место Шварца. Король прусский Фридрих-Вильгельм II, ревностный масон и враг России, подчинил русских франкмасонов. Таким образом посеянные семена дали всходы. Сподвижник Шварца Новиков учредил «Типографическую компанию», выпустившую в свет большое количество масонских изданий. В своих статьях он писал, что «вере учат не так, как надо», и рекомендовал, как надо учить. О его деятельности донесли императрице, особо упомянув, что Новиков «со друзьями участвует в уловлении известной особы» (наследника Павла Петровича). В 1792 году властями были опечатаны книги Новикова, из которых двадцать наименований продавались вопреки запрещению, а восемнадцать были изданы вовсе без разрешения. В это же время арестован был и сам Новиков. Заточение его в Шлиссельбурге продолжалось вплоть до кончины Екатерины II в 1796 году. Причина тяжкого приговора о заключении на 15 лет в Шлиссельбургскую крепость, постигшего Новикова, до сих пор неясна: ее видят в попытках вовлечь в деятельность масонов великого князя Павла Петровича, что крайне неприязненно было воспринято императрицей.
Екатерина II относилась к масонству резко отрицательно. В начале восьмидесятых годов в России действовало 145 масонских лож. Императрица Екатерина II всё сильнее ощущала вокруг себя, как стягивается кольцо масонского влияния, за которым проявлялась воля владетельных особ Запада, и прежде всего Германии. После конвента в Вильгельмсбаде, ещё раз подтвердившего роль русских масонов как политических агентов прусского короля, Екатерина вполне осязаемо почувствовала угрозу своей власти. Принадлежавшие к правящим родам, российские масоны вольно или невольно являлись орудием влияния западных владык. Часть из масонов входила в Её ближайшее окружение – Н.И. Панин (возглавлявший внешнюю политику России и являвшийся воспитателем сына Екатерины Павла), И.П. Елагин (кабинет-министр), В.И. Бибиков, А.В. Храповицкий (статс-секретарь), Артемьев (обер-секретарь). Активными проводниками масонской политики служили екатерининские вельможи из родов Долгоруких, Гагариных, Трубецких, Куракиных, Щербатовых, Чернышёвых, Брюсов, Репниных и многих других.
В 1782 году Екатерина предпринимает против масонства ряд решительных мер. Во-первых, выходит указ о запрещении тайных обществ, который, по сути дела, ставит вольных каменщиков вне закона. Во-вторых, из её ближайшего окружения постепенно изгоняются масонские функционеры. Но центр масонской работы переносится из Петербурга в Москву, а деятельность масонских лож становится ещё более тайной и враждебной России. В 1792 году «братьев» было 1500–2000 человек. В 1794 году Екатерина II специальным Указом полностью запрещает деятельность масонских лож.
В целом, императрицей Екатериной II были предприняты обыкновенные для всякой власти действия по ликвидации идеологической конкуренции и усиления революционности общества (по ее выражению – «разврата»).