Заводские испытания начались на Гороховецком полигоне с февраля 1972 г. С мая в них принимали участие уже два дооборудованных танка. Уже к середине года было выполнено 37 из 40 пусков, запланированных на этом этапе. Однако из-за ряда отказов число управляемых пусков в ходе заводских испытаний увеличили до 70, задействовав дополнительно 21 боевую и 9 телеметрических ракет. Кроме того, по программе заводских испытаний провели 350 выстрелов обычными боеприпасами, так как наряду с «Коброй» отрабатывались и системы неуправляемого вооружения 1АЗЗ в составе комплекса «Обь». Все это требовало больших затрат времени, и для расширения фронта работ на совещании главных конструкторов было принято решение доделать еще три танка в харьковском КБ машиностроения.
Совместные испытания начались на Гороховецком полигоне 14июля 1973 г., на три года позже срока, установленного постановлением 1968 г. Государственной комиссии были представлены два танка и 44 ракеты. Однако события начали развиваться очень неблагоприятно. За месяц с небольшим (до 23 августа) выполнили десяток управляемых пусков, но только в трех из них удалось поразить цели. С парой промахов и одним незачетным пуском можно было смириться, но отказы матчасти в четырех испытаниях свидетельствовали о ненадежности техники. При этом в каждом аварийном случае подводили различные элементы комплекса, так что надежды на быстрое его доведение до кондиции доработкой одного из компонентов не имелось. Однажды не сработала электроцепь клина пушки, в другом случае наведению помешало появления бликов в оптической цепи координатора, в третьем имела место непроходимость канала управления бортовой аппаратуры ракеты, а в четвертом на ракете просто сломалось крыло.
Решением совета главных конструкторов от 6 сентября 1973 г. испытания были прерваны. Подготовленные к пускам ракеты подвергли дополнительным проверкам, выявившим некондиционность ряда элементов. Пришлось заменить лампы излучателей, крылья и замки их крепления. При этом обнаружили значительные отклонения геометрии деталей от чертежей и нарушения режима термообработки. Провели дополнительный анализ программы выведения на начальном участке полета, еще раз скорректировав принятые коэффициенты контура управления.
На оптическом координаторе установили диафрагму для устранения влияния бликов, при этом световой поток, воздействующий на начальном участке полета ракеты, был снижен в 2,5–3,5 раза. С другой стороны, была уменьшена отражающая поверхность отражателя. Ввели дополнительное устройство для поддержания нормального функционирования канала управления при кратковременной потере сигнала. Для исключения дальнейших отказов при стрельбе внесли доработки в электроцепь клина затвора.
Для проверки эффективности вносимых изменений выполнили 29 управляемых пусков, причем удалось добиться 10 попаданий при всего лишь паре промахов. Успех пришел не сразу: испытания сопровождались 14 отказами, включая шесть поломок крыльев, четыре аварии бортового излучателя, сбой в бортовой аппаратуре. В трех случаях неудачи были обусловлены неправильной стыковкой ракет.
Доработки продолжались: в пеленгаторе ввели авторегулирование фона, реализовали меры по обеспечению виброустойчивости прицела и другого танкового оборудования. На участвовавших в испытаниях танках проявился повышенный разгар ствола, что потребовало перестволения пушки, которое сначала выполнили на танке № 124. Наряду с текущими доработками велись и более перспективные исследования по применению в усовершенствованных модификациях ракеты бортовых радиоблоков в микросхемном исполнении и исключению все еще проявлявших ненадежность батарей и ламп.
После годичного перерыва, 10 сентября 1974 г., совместные испытания возобновились. Министр оборонной промышленности С.А. Зверев уделял особое внимание ходу этого затянувшегося процесса, потребовав еженедельно докладывать о ходе отработки «Кобры» на Гороховецком полигоне.
До конца года удалось довести число выполненных пусков до 22. Из первых 19 управляемых пусков, проведенных по программе совместных испытаний, две трети завершились попаданиями в цель. Было зафиксировано всего пять отказов, что позволило определить повышение надежности с 50 до 75 %. С другой стороны, на этом этапе испытаний появилась и новая напасть — выбросы обратного пламени при открывании клина затвора пушки после пуска «Кобры».