1 июня на Московское царство венчался боярин Василий Шуйский. В государстве началась анархия и хаос. Власть шаталась во всех городах и областях государства, а их уже было очень много — Москва, Владимир, Суздаль, Ростов, Переяславль-Залесский, Тверь, Углич, Ярославль, Кострома, Поморье, Пермская земля, Западная Сибирь, Заонежье, Усольский полуостров, Соловки, Новгород, Псков, Смоленск, Брянск, Калуга, Тула, Рязань, Северские земли с Путивлем и Стародубом, часть «Дикого поля» с Воронежем, Белгородом и Курском, Поволжье, Нижний Новгород, Вятка, Закамье, Чебоксары, Казань, Астрахань, Башкирия и Кабарда.
Василий Шуйский недолго просидел на московском троне. В Путивле поднял восстание князь Шаховский, в Чернигове — князь Телятевский, в Рязани — Ляпуновы. В Польше быстро нашли нового самозванца Лжедмитрия II. Во главе нового войска нового самозванца встал беглый холоп Иван Болотников. В царстве, охваченном смутой, началась крестьянская война. Почти впервые заигравшиеся бояре столкнулись, наконец, лицом к лицу с вооруженным народом.
Армия И. Болотникова с дворянским ополчением Ляпуновых осадила Москву. На помощь к Шуйскому подошли отряды из северных городов и крестьянскую армию отбросили от Москвы. Болотников рассылал по всей стране письма, в которых поднимал крестьян против бояр и помещиков, требуя забрать у них деньги и имущество. После этого дворянин Ляпунов явился к Шуйскому с повинной. Оставшихся с Болотниковым восставших заперли в Туле, которую осаждали более полугода. В октябре 1607 года Тула была взята войсками Шуйского. Крестьянский вождь при захвате кричал: «Придет мое время, я вас закую в железо, зашью в медвежьи шкуры и отдам псам». Дворяне в железо не хотели и Болотникова быстро утопили.
Пока войска Шуйского стояли под Тулой, польские войска Лжедмитрия II подошли к Москве и, не имея достаточных сил для захвата Москвы, стали лагерем у Тушино. Ни «полуцарь» Шуйский, ни «Тушинский вор» Лжедмитрий II победить не могли. Многие бояре, дворяне, купцы предлагали свои услуги и тому, и другому, прося за это деньги и милости. В народе их стали называть «перелетами». По всей земле растеклись разбойники и грабители, осаждавшие даже города.
К Лжедмитрию II стекались авантюристы со всей Европы, его армия постоянно увеличивалась. Государство спасла Троице-Сергиева лавра — укрепленный монастырь, закрывший дорогу в богатые северные города.
В сентябре 1608 года тридцатитысячная польская армия осадила монастырь, который защищали десять тысяч воинов, монахов, крестьян. Крепкие стены и мужество защитников стали непреодолимым бастионом, который не смогли взять захватчики. Двухлетняя осада не закончилась польской победой. Собранные М. Скопиным-Шуйским на севере русские войска разгромили отряды тушинского вора, который был разеран в декабре 1610 года.
Спаситель Москвы М. Скопин-Шуйский погнал врага с родной земли, был отравлен на боярском пиру, как возможный конкурент на шапку Мономаха. Выдающийся российский историк С. Ф. Платонов писал, что «в Москве все сословия дошли до глубокого политического разврата».
В феврале 1609 года полуцарь Шуйский заключил союз со шведским королем. За 6000 шведских солдат Москва отдала права на Ливонию и Карелу с землями. Шведские войска расползлись по всему Балтийскому побережью.
Польская армия Сигизмунда разбила под Смоленском войска Шуйского и пошла на Москву. 7 июня 1610 года ополчения во главе с Захаром Ляпуновым свергли Василия Шуйского с престола. «Полуцаря» постригли в монахи и за московский трон тут же началась борьба. Польская партия предлагала сына Сигизмунда королевича Владислава, Захар Ляпунов с дворянами — Василия Голицына, Романовы предложили четырнадцатилетнего Михаила, двоюродного племянника последнего законного царя Федора Ивановича. Боярская Дума не поддержала никого из претендентов. Для управления государством в период междуцарствования дума назначила особую комиссию в составе Ф. Мстиславского, И. Воротынского, В. Голицына, И. Романова, Ф. Шереметева, А. Трубецкого и Б. Лыкова.
В сентябре 1610 года Семибоярщина пустила польские войска в Москву, которая присягнула королевичу Владиславу. Был взят Смоленск. «Великое боярское посольство» отправилось в Варшаву и было задержано в Польше на восемь лет. Королевич Владислав в Москву не ехал, поляки и шайки грабителей грабили Россию и сокращали ее население. Шведские войска воспользовались смутой и взяли Новгород с землями до Финского залива. Устоял только Псков. Положение Москвы стало безвыходным.
Москва была занята польским гарнизоном, вся московская царская администрация находилась под польским влиянием. Король Сигизмунд из-под Смоленска распоряжался в Московском царстве как государь. Русские начали освобождаться от польских оккупантов.