В январе 1611 года на Москву двинулось первое ополчение во главе с Прокофием Ляпуновым. Патриарх Гермоген из Кремля рассылал грамоты по русским городам, призывая не признавать Владислава русским царем. Он освободил народ от присяги королевичу. Поляки и бояре требовали от Гермогена остановить двинувшееся на Москву ополчение, но патриарх ответил: «Если все изменники и королевские люди выйдут из Москвы вон, то я опишу ратным людям, чтобы они вернулись назад». Патриарха заключили в подземелье Чудова монастыря и уморили голодом, но народ уже поднимался на защиту Отечества. Народным приговором 30 июля 1611 года из членов первого ополчения был создан «Совет всей земли», возложивший всю полноту власти на князя Д. Трубецкого, дворянина П. Ляпунова и атамана И. Заруцкого. В казачьих и дворянских лагерях ополченцев под Москвой были созданы приказы, восстановившие управление страной. Власти ополчения сменили переметнувшихся к полякам воевод и провели мобилизацию служилых людей, установив им фиксированное жалованье. Земли изменников конфисковывались и раздавались дворянскому ополчению.
Весной 1611 года, на Вербное воскресенье, в Москве начались уличные бои. Восставших москвичей, погибавших сотнями, поддержали отряды земского ополчения князя Дмитрия Пожарского. Поляки были отброшены в Кремль, где смогли удержаться с поддержавшими их московскими боярами. Поляки успели поджечь Москву, которая горела три дня и была полностью разграблена. С кремлевских стен польские солдаты стреляли в русских жемчужинами.
Через три дня в сожженную Москву вошло стотысячное ополчение П. Ляпунова. Недалеко от него расположились казацкие отряды Д. Трубецкого и И. Заруцкого. Польский гарнизон во главе с Гонсевским, насчитывал всего три тысячи человек. Совет всей земли постановил, что три амбициозных руководителя восставших «должны были строить землю и всяким ратным людям промышлять». Кремль штурмовать никто не спешил.
«Приговор» Совета всей земли постановил направить во все казачьи отряды служилых людей для контроля и прекращения грабежей. В казаки запрещалось принимать беглых холопов. Приговор подписали все руководители и представители двадцати пяти русских городов.
О трениях И. Заруцкого, Д. Трубецкого и П. Ляпунова донесли полякам и Гонсевский подбросил казакам поддельную грамоту с приказом Ляпунова земским людям «убивать казаков как собак». Ляпунова позвали в казачий круг и, не дав сказать ни одного слова, быстро зарубили. Дворянское ополчение отказалось от союза с казаками и разошлось по домам. На уходящие из Москвы многотысячные русские полки с кремлевских стен с удовольствием смотрел С. Гонсевский.
Польские начальники отправились в Варшаву праздновать победу над Московским царством. Пьянствовать начали уже на выезде из Москвы. После кутежа под Можайском пьяные паны на переправе через реку утопили шапку Мономаха и другие царские регалии. Для династии Романовых на коронацию шапка, держава, скипетр, бармы и все государевы символы были изготовлены по старым рисункам и образцам московскими мастерами.
Пока поляки праздновали в Нижнем Новгороде был созван Земской собор из представителей всех сословий Московского царства. Собор принял решение о сборе нового «ополчения всей земли». 18 августа 1612 года Кузьма Минин и Дмитрий Пожарский с войском подошли к Москве. С другой стороны на усиление польского гарнизона шел большой отряд гетмана Я. Ходкевича. У поляков был почти год, чтобы укрепиться в Москве, но им не хватило одного дня. С третьей стороны встали лагерем казаки Трубецкого и Заруцкого, тут же пригласившие на переговоры князя Пожарского. Он видел, как погиб зарубленный Ляпуков и в казачий круг не поехал. Пожарский попросил атаманов хотя бы не пропустить отряд гетмана Ходкевича на соединение с польским гарнизоном в Кремле. Ходкевич в яростных атаках потерял много своих знаменитых гусар и прорваться к Кремлю не смог. Остатки его отряда покинули Москву. В октябре ополчение полностью обложило Кремль, в котором в заложниках было много не переметнувшихся бояр. Полякам обещали жизнь и 28 октября 1612 года они ушли из Кремля, отпустив боярских заложников, среди которых был пятнадцатилетний Михаил Романов со своей матерью.
К зиме Московское царство покинули все большие отряды оккупантов, хотя небольшие польские, казацкие и разбойничьи шайки бродили по русской земле до 1618 года. Смута на Руси почти закончилась, но по Деуминскому мирному договору 1618 года поляки оставили за собой Смоленск и Чернигов. Шведы ушли из Новгорода, но оставили за собой устье Невы и все побережье Финского залива. Европейские земли царства заметно уменьшились. Впереди у страны было много работы.
Начало династии Романовых
После окончания Смуты в стране было необходимо восстановить государственную власть. Символом власти на Руси был государь — необходимо было выбрать нового царя и новую династию, которую бы признала Россия.