Это был далеко не единственный фронт борьбы Леди Ю. Она объявила еще одну войну: прежде всего российским нефтяным компаниям «Лукойлу», ТНК-ВР и «Татнефти», контролировавшим внутренний рынок нефтепродуктов в Украине. Был запрещен реэкспорт российской нефти с территории Украины (что вызвало недовольство министра юстиции, украинца американского происхождения Романа Зварича, подавшего в отставку). Началось административное давление украинского правительства на российские нефтяные компании, контролировавшие нефтеперерабатывающие заводы (НПЗ), поставлявшие нефтепродукты на Украину.
Чтобы не зависеть от российских НПЗ, Тимошенко предложила создать новые государственные автозаправочные станции (АЗС), построить свой НПЗ в Одесском порту и перерабатывать там нефть, закупаемую в ближневосточных и других странах, причем поставки Украине нероссийской нефти Тимошенко предлагала значительно увеличить. Эти намерения были блокированы лично президентом Ющенко, вмешавшимся в конфликт и издавшим указ об отмене государственного регулирования цен на нефтепродукты, что свело на нет борьбу Тимошенко против российских нефтеперерабатывающих компаний в Украине.
Хотя во время празднования Дня независимости Украины 24 августа 2005 года Ющенко заявил, что правительство Тимошенко является наиболее успешным за все годы независимости страны, тлеющий конфликт между тремя центрами власти — Ющенко, Тимошенко и Порошенко — давал о себе знать все больше и больше. Ющенко дал негласное поручение Порошенко курировать межгосударственную двустороннюю украинско-российскую комиссию, созданную по инициативе Ющенко и Путина. Президент заявил, что именно СНБО (а не правительство) должно быть «единственным местом, где будут приниматься стратегические решения». Таким образом, Ющенко делегировал ряд полномочий, принадлежавших ранее премьер-министру, секретарю СНБО.
Публично Ющенко категорически отрицал вероятность того, что этот конфликт может привести к отставке премьер-министра или всего правительства. Тем не менее эта отставка произошла, хотя внешне вызвана она была абсолютно посторонним событием. Неожиданно и демонстративно в отставку подал государственный секретарь Украины Александр Зинченко. На собранной им пресс-конференции Зинченко выступил с обвинениями в коррупции против ряда соратников президента Ющенко, а Порошенко обвинил чуть ли не в заговоре. «Большинство украинцев не понимают, что происходит в стране, — сказал Зинченко. — В окружении президента достаточно порядочных людей, но небольшая группа авантюристов-политиков пытается воспользоваться достижениями Оранжевой революции... Секретарь СНБО Петр Порошенко, первый помощник президента Александр Третьяков, депутат Николай Мартыненко и несколько их партнеров реализуют сценарий использования власти в собственных целях... Порошенко незаконно влияет на судей, систематически пользуется телефонным правом, «крышует» взяточничество на таможне и заставляет представителей бизнеса делиться с ним прибылью и активами... В своих действиях Порошенко прикрывается именем президента. Именно прикрывается, поскольку президент не давал ему таких полномочий».
Порошенко все обвинения в свой адрес категорически отвергал: «Я хотел бы услышать хоть один конкретный факт по отношению к любой из фамилий, которые были названы. Будут факты — мы их расследуем. Но такого факта не было названо!.. Я бы очень хотел подать в суд» (в суд Порошенко не подал). Он утверждал также, что у президента к нему не было никаких претензий, и сам Зинченко тоже никогда ранее их не предъявлял: «Президент мне ни разу не говорил ни о каких претензиях в мой адрес. Я думаю, Зинченко обманывает, утверждая, что он уже два-три месяца сообщал что-то такое президенту. Единственное, в чем у нас в свое время были противоречия с Зинченко, это то, что секретариат президента до сих пор осуществляет управление правоохранительными органами на Украине. Я предлагал госсекретарю решить эту проблему, но не получил поддержки». Он признал лишь то, что боролся против принудительного изъятия Никопольского ферросплавного завода: «Я считаю, что Никопольский ферросплавный должен быть собственностью частной структуры. Но это моя позиция как представителя власти: я считаю, что тот ущерб, который страна понесла в результате реприватизации, намного превышает полученную прибыль»[35].