С точки зрения радикальной уйгурской интеллигенции, в современном мире нет ни одного тюркского или монгольского народа, у которого не было бы генов уйгурского происхождения. Помимо самих уйгуров и сары-югуров, прямыми потомками древних уйгуров считаются древние монголы с Амура, а также башкиры, калмыки, саха, шорцы, телеуты, теленгиты, ойраты, найманы, канглы, тувинцы.
Вышеописанные родственные связи признаются не только радикально настроенной частью интеллигенции этих народов, но и значительной частью рядового населения. Это обстоятельство принципиально влияет на восприятие населением уйгурского мира, или Великого Уйгурстана, в целом и напрямую смыкается с идеей всемирного государства тюрков – так называемым Великим Тюркестаном.
Эпизод с существованием в Новое Время самостоятельного государства с этнической доминантой уйгуров – так называемого Восточного Туркестана – до сих пор оказывает значительное влияние на политическое самосознание синьцзянских уйгуров, поэтому стоит на нём остановиться подробнее.
На территории, объявленной в 1945 году Восточным Туркестаном под этнической доминантой уйгуров, в период с 1820 по 1920-е годы обитали люди, известные более чем под пятнадцатью самоназваниями, такими как сарты, каракурчинцы, тургоуты и т. д. Объединяющее же самоназвание «уйгур» вообще было принято на съезде в Ташкенте в 1921 году по предложению академика Бартольда. Таким образом, все действия по объединению этих разрозненных племенных общин произошли по инициативе советских специалистов. В результате активной военной поддержки Советского Союза в рамках противодействия распространению влияния правительства Чан Кайши сразу после Великой Отечественной войны часть территории современного Китая была отчуждена и временно получила название Восточный Туркестан.
Позднее, согласно закрытой договорённости между Советским правительством и правительством КНР, которое к тому времени олицетворял Мао Цзэдун, Советский Союз отозвал с этой территории своих специалистов и советников. Позднее, в результате спецоперации руководители Республики Восточный Туркестан были вывезены в Москву.
Данная территория была оккупирована подразделениями Народно-освободительной армии Китая. Оккупация прошла практически без эксцессов и в первое время была просто не замечена земледельческим и скотоводческим населением.