По справке из Московской Духовной Консистории, нынешняя церковь «построена 1788 года тщанием священников Максима Дионисиева и Иоанна Сергеева, приношениями прихожан и посторонних дателей». В 1750‑х годах Максим Дионисиев был диаконом Филипповской церкви. С 1760 годов в документах он значится уже священником означенной церкви. Отец Максим был весьма деятельным и уважаемым священником. Как раз в настоятельство о. Максима Филипповская церковь обветшала и потребовала срочной перестройки, о чем свидетельствует сохранившееся прошение его с приходскими людьми на имя митрополита Московского и Калужского Платона: «Генваря 20 дня 1777 года, поданным Вашему Высокопреосвященству от нас прошением представлено об означенной нашей приходской церкви убогих местах, а особливо в святом алтаре от самого почти фундамента, даже до свода оказались немалые расседины, кои время от времени умножаются, наводя крайнюю опасность. И что по учиненному со общаго нашего согласия архитектором Матвеем Федоровичем Казаковым осмотру, повреждение оной церкви оказалось от слабого фундамента, отчего по мнению ево, архитектора, необходимо следует настоящую церковь со старым алтарем, исключая трапезу и имеющийся при оной придел, всю до фундамента разобрать и вновь построить. И ныне по спешествующу Божию благоволению и Вашему архипастырскому благословению, собрано и приуготовлено, как материалов, так и наличных денег всего более пяти тысяч рублев. Того ради, Вашего Высокопреосвященства, милостивого архипастыря, покорнейше просим вышеозначенную нашу приходскую церковь разобрать и оную по нову возобновить».
Строительство по проекту М. Ф. Казакова и под руководством архитектора С. Карина длилось 10 лет, и к 1787 году был выстроен величественный храм в стиле раннего классицизма. Построенная церковь свт. Филиппа, митрополита Московского в Мещанской слободе, на месте старого одноименного храма XVII века, при трапезной 1752 года, была задумана в качестве домовой церкви подворья митрополита Платона, но проект подворья остался неосуществленным.
Придел прп. Алексия, Человека Божия
Внутреннее пространство храма поражало обилием лепнины, полукольцами колонн, высоким светлым куполом, прорезанными окнами-люкарнами. Нужно добавить, что стройная гармония архитектурных форм создает еще и великолепный акустический эффект. Иконостас только в своей нижней части принадлежал Казакову, верхняя часть была выполнена в конце XIX века.
Интерьер церкви свт. Филиппа. 2016 год
Освящение вновь построенной церкви было в 1788 году. В 1827 году к трапезной был пристроен второй придел – преподобного Сергия Радонежского на средства князя Долгорукова. В XIX веке на территории храма были построены дома церковнослужителей. В 1889 году купцом Н. Ф. Степановым на территории храма была построена богадельня.
В 1896 году при церкви святителя Филиппа, что в Мещанской слободе была открыта церковно-приходская школа, о чем сообщали Московские церковные ведомости: «…Прошлый 1896–1897 учебный год ознаменовался открытием нескольких новых церковно-приходских школ в Московской епархии, как в самой столице, так и в уездах губернии. В городе Москве, с началом учебного года, открыта церковно-приходская школа в Филипповской, что в Мещанской слободе, церкви. Вновь открытая школа совершает свою деятельность под руководством Совета Кирилло-Мефодиевского братства учителей и учительниц…»
Помимо церковно-приходской школы в приходе церкви существовали Николаевский детский приют Московского благотворительного общества, Городское начальное училище и Железнодорожное училище, где должность законоучителей проходили члены причта Филипповской церкви.
Интерьер церкви свт. Филиппа. 2016 год
В феврале-марте 1898 года причт и староста Московской Филипповской, на Мещанской улице, церкви просили «…разрешить существующия для отопления церкви духовыя печи по их ветхости переменить и вновь на старых местах поставить; сделать переделки в трапезной церкви и в приделе во имя преподобного Алексия: наложить на существующие стены кирпичную кладку на один аршин, разобрать кирпичные коробовые своды и заменить их новыми кирпичными парусными, расширить арочный пролет, оконный пролет заложить; разобрать на время иконостас в Алексеевском приделе, а также возобновить стенную живопись, а иконостас, по прочистке его и украшении позолотой, возстановить в том же виде и размере», в каком он существует теперь.
Придел прп. Сергия Радонежского Икона прп. Сергия Радонежского
За историю существования храма свт. Филиппа, митрополита Московского, руководство приходом осуществляли следующие священники:
иерей Иван Федоров, с 1747 по 1760 гг. иерей Максим Дионисиев, с 1760 по 1783 гг. (умер декабря 1 дня, 1783 года)
священник Иван Сергеев Александровский, с 1783 по 1806 гг.
священник, духовник священно-церковнослужителей Алексей Алексеев Константинов, с 1806 по 1827 гг.